Abstract To determine possible modes of virus transmission, we investigated a cluster of coronavirus disease cases associated with a shopping mall in Wenzhou, China. Data indicated that indirect transmission of the causative virus occurred, perhaps resulting from virus contamination of common objects, virus aerosolization in a confined space, or spread from asymptomatic infected persons.

ABSTRACTThe emerging new VOC B.1.1.529 (Omicron) variant has raised serious concerns due to multiple mutations, reported significant immune escape, and unprecedented rapid spreading speed. Currently, studies describing the neutralization ability of different homologous and heterologous booster vaccination against Omicron are still lacking. In this study, we explored the immunogenicity of COVID-19 breakthrough patients, BBIBP-CorV homologous booster group and BBIBP-CorV/ZF2001 heterologous booster group against SARS-CoV-2 pseudotypes corresponding to the prototype, Beta, Delta, and the emergent Omicron variant.Notably, at 14 days post two-dose inactivated vaccines, pVNT titre increased to 67.4 GMTs against prototype, 8.85 against Beta and 35.07 against Delta, while neutralization activity against Omicron was below the lower limit of quantitation in 80% of the samples. At day 14 post BBIBP-CorV homologous booster vaccination, GMTs of pVNT significantly increased to 285.6, 215.7, 250.8, 48.73 against prototype, Beta, Delta, and Omicron, while at day 14 post ZF2001 heterologous booster vaccination, GMTs of pVNT significantly increased to 1436.00, 789.6, 1501.00, 95.86, respectively. Post booster vaccination, 100% samples showed positive neutralization activity against Omicron, albeit illustrated a significant reduction (5.86- to 14.98-fold) of pVNT against Omicron compared to prototype at 14 days after the homologous or heterologous vaccine boosters.Overall, our study demonstrates that vaccine-induced immune protection might more likely be escaped by Omicron compared to prototypes and other VOCs. After two doses of inactivated whole-virion vaccines as the "priming" shot, a third heterologous protein subunit vaccine and a homologous inactivated vaccine booster could improve neutralization against Omicron.

Gastric cancer remains a serious threat to public health with high incidence and mortality worldwide. Accumulating evidence demonstrates that long non-coding RNAs (lncRNAs) play important roles in regulating gene expression and are involved in various pathological processes, including gastric cancer. To investigate the possible role of dysregulated lncRNAs in gastric cancer development, we performed lncRNA microarray and identified 3141 significantly differentially expressed lncRNAs in gastric cancer tissues. Next, some of deregulated lncRNAs were validated among about 60 paired gastric cancer specimens such as Linc00261, DKFZP434K028, RPL34-AS1, H19, HOTAIR and Linc00152. Our results found that the decline of DKFZP434K028 and RPL34-AS1, and the increased expression of Linc00152 positively correlated with larger tumor size. The high expression levels of HOTAIR were associated with lymphatic metastasis and poor differentiation. Since the biological roles of Linc00152 are largely unknown in gastric cancer pathogenesis, we assessed its functions by silencing its up-regulation in gastric cancer cells. We found that Linc00152 knockdown could inhibit cell proliferation and colony formation, promote cell cycle arrest at G1 phase, trigger late apoptosis, reduce the epithelial to mesenchymal transition (EMT) program, and suppress cell migration and invasion. Taken together, we delineate the gastric cancer lncRNA signature and demonstrate the oncogenic functions of Linc00152. These findings may have implications for developing lncRNA-based biomarkers for diagnosis and therapeutics for gastric cancer.

Objectives Severe or critical COVID-19 is associated with intensive care unit admission, increased secondary infection rate, and would lead to significant worsened prognosis. Risks and characteristics relating to secondary infections in severe COVID-19 have not been described. Methods Severe and critical COVID-19 patients from Shanghai were included. We collected lower respiratory, urine, catheters, and blood samples according to clinical necessity and culture and mNGS were performed. Clinical and laboratory data were archived. Results We found 57.89% (22/38) patients developed secondary infections. The patient receiving invasive mechanical ventilation or in critical state has a higher chance of secondary infections (P<0.0001). The most common infections were respiratory, blood-stream and urinary infections, and in respiratory infections, the most detected pathogens were gram-negative bacteria (26, 50.00%), following by gram-positive bacteria (14, 26.92%), virus (6, 11.54%), fungi (4, 7.69%), and others (2, 3.85%). Respiratory Infection rate post high flow, tracheal intubation, and tracheotomy were 12.90% (4/31), 30.43% (7/23), and 92.31% (12/13) respectively. Secondary infections would lead to lower discharge rate and higher mortality rate. Conclusion Our study originally illustrated secondary infection proportion in severe and critical COVID-19 patients. Culture accompanied with metagenomics sequencing increased pathogen diagnostic rate. Secondary infections risks increased after receiving invasive respiratory ventilations and intravascular devices, and would lead to a lower discharge rate and a higher mortality rate.

Abstract The massive and rapid transmission of SARS-CoV-2 has led to the emergence of several viral variants of concern (VOCs), with the most recent one, B.1.1.529 (Omicron), which accumulated a large number of spike mutations, raising the specter that this newly identified variant may escape from the currently available vaccines and therapeutic antibodies. Using VSV-based pseudovirus, we found that Omicron variant is markedly resistant to neutralization of sera form convalescents or individuals vaccinated by two doses of inactivated whole-virion vaccines (BBIBP-CorV). However, a homologous inactivated vaccine booster or a heterologous booster with protein subunit vaccine (ZF2001) significantly increased neutralization titers to both WT and Omicron variant. Moreover, at day 14 post the third dose, neutralizing antibody titer reduction for Omicron was less than that for convalescents or individuals who had only two doses of the vaccine, indicating that a homologous or heterologous booster can reduce the Omicron escape from neutralizing. In addition, we tested a panel of 17 SARS-CoV-2 monoclonal antibodies (mAbs). Omicron resists 7 of 8 authorized/approved mAbs, as well as most of the other mAbs targeting distinct epitopes on RBD and NTD. Taken together, our results suggest the urgency to push forward the booster vaccination to combat the emerging SARS-CoV-2 variants.

Abstract Many new Omicron sub-lineages have been reported to evade neutralizing antibody response, including BA.2, BA.2.12.1, BA.4 and BA.5. Most recently, another emerging sub-lineage BA.2.75 has been reported in multiple countries. In this study, we constructed a comprehensive panel of pseudoviruses (PsVs), including wild-type, Delta, BA.1, BA.1.1, BA.2, BA.3, BA.2.3.1, BA.2.10.1, BA.2.12.1, BA.2.13, BA.2.75 and BA.4/BA.5, with accumulate coverage reached 91% according to the proportion of sequences deposited in GISAID database since Jan 1 st , 2022. We collected serum samples from healthy adults at day14 post homologous booster with BBIBP-CorV, or heterologous booster with ZF2001, primed with two doses of BBIBP-CorV, or from convalescents immunized with three-dose inactivated vaccines prior to infection with Omicron BA.2, and tested their neutralization activity on this panel of PsVs. Our results demonstrated that all Omicron sub-lineages showed substantial evasion of neutralizing antibodies induced by vaccination and infection, although BA.2.75 accumulated the largest number of mutations in its spike, BA.4 and BA.5 showed the strongest serum escape. However, BA.2 breakthrough infection could remarkably elevated neutralization titers against all different variants, especially titers against BA.2 and its derivative sub-lineages.

Microbial cell factories (MCF) offer an eco-friendliness and cost-effectiveness way for producing high-value chemicals. However, their productive performance is often limited due to the loss of protein stability during microbial fermentation process. Here, protein stability was rationally reprogrammed to build efficient MCF for four-carbon dicarboxylic acids production by developing a codon combination subset-based protein stability regulator (ccsPSR). First, the effect of protein stability on fermentation production was analyzed, and then the targeted genes such as ribF responsible for protein stability were identified by transcriptomic analysis. Next, ccsPSR was designed and constructed by screening and analyzing synonymous codons capable of increasing adenine frequency from 2 to 6 codon positions in the ribF gene. Finally, by ccsPSR to adjust protein stability in E. coli, succinate production was up to 153.36 g/L with its productivity 2.13 g/L/h, and malate production was up to 30.02 g/L with its yield 1.04 g/g, respectively. These results suggest that reprogramming protein stability is an effective strategy for improving the production performance of MCF.

Abstract Reactive oxygen species (ROS)-associated anticancer approaches usually suffer from two limitations, i.e., insufficient ROS level and short ROS half-life. Nevertheless, no report has synchronously addressed both concerns yet. Herein, a multichannel actions-enabled nanotherapeutic platform using hollow manganese dioxide (H-MnO 2 ) carriers to load chlorin e6 (Ce6) sonosensitizer and CO donor (e.g., Mn 2 (CO) 10 ) has been constructed to maximumly elevate ROS level and trigger cascade catalysis to produce CO. Therein, intratumoral H 2 O 2 and ultrasound as endogenous and exogeneous triggers stimulate H-MnO 2 and Ce6 to produce •OH and 1 O 2 , respectively. The further cascade reaction between ROS and Mn 2 (CO) 10 proceeds to release CO, converting short-lived ROS into long-lived CO. Contributed by them, such a maximumly-elevated ROS accumulation and long-lived CO release successfully suppresses the progression, recurrence and metastasis of lung cancer with a prolonged survival rate. More significantly, proteomic and genomic investigations uncover that the CO-induced activation of AKT signaling pathway, NRF-2 phosphorylation and HMOX-1 overexpression induce mitochondrial dysfunction to boost anti-tumor consequences. Thus, this cascade catalysis strategy can behave as a general means to enrich ROS and trigger CO release against refractory cancers. Graphic Abstract