EA
Essam Ali
Author with expertise in Electrochemical Biosensor Technology
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
11
(64% Open Access)
Cited by:
5
h-index:
23
/
i10-index:
61
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Climate-smart rice (Oryza sativa L.) genotypes identification using stability analysis, multi-trait selection index, and genotype-environment interaction at different irrigation regimes with adaptation to universal warming

Muhammad Habib et al.Jun 15, 2024
Abstract Climate change has brought an alarming situation in the scarcity of fresh water for irrigation due to the present global water crisis, climate variability, drought, increasing demands of water from the industrial sectors, and contamination of water resources. Accurately evaluating the potential of future rice genotypes in large-scale, multi-environment experiments may be challenging. A key component of the accurate assessment is the examination of stability in growth contexts and genotype-environment interaction. Using a split-plot design with three replications, the study was carried out in nine locations with five genotypes under continuous flooding (CF) and alternate wet and dry (AWD) conditions. Utilizing the web-based warehouse inventory search tool (WIST), the water status was determined. To evaluate yield performance for stability and adaptability, AMMI and GGE biplots were used. The genotypes clearly reacted inversely to the various environments, and substantial interactions were identified. Out of all the environments, G3 (BRRI dhan29) had the greatest grain production, whereas G2 (Binadhan-8) had the lowest. The range between the greatest and lowest mean values of rice grain output (4.95 to 4.62 t ha -1 ) was consistent across five distinct rice genotypes. The genotype means varied from 5.03 to 4.73 t ha -1 depending on the environment. In AWD, all genotypes out performed in the CF system. With just a little interaction effect, the score was almost zero for several genotypes (E1, E2, E6, and E7 for the AWD technique, and E5, E6, E8, and E9 for the CF method) because they performed better in particular settings. The GGE biplot provided more evidence in support of the AMMI study results. The study's findings made it clear that the AMMI model provides a substantial amount of information when evaluating varietal performance across many environments. Out of the five accessions that were analyzed, one was found to be top-ranking by the multi-trait genotype ideotype distance index, meaning that it may be investigated for validation stability measures. The study's findings provide helpful information on the variety selection for the settings in which BRRI dhan47 and BRRI dhan29, respectively, performed effectively in AWD and CF systems. Plant breeders might use this knowledge to choose newer kinds and to design breeding initiatives. In conclusion, intermittent irrigation could be an effective adaptation technique for simultaneously saving water and mitigating GHG while maintaining high rice grain yields in rice cultivation systems.
0
Citation3
0
Save
0

Investigating the Inhibitory Mechanism of para-Sulfonato-calix[4]arenes against Polymerase and Helicase of SARS-CoV-2: Molecular Docking and Dynamics Simulation Studies

Khalid Khan et al.Jun 25, 2024
The coronavirus disease (COVID-19) pandemic, caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), has had a profound impact on global health and socio-economic conditions. To date, various vaccines have been administered worldwide in an effort to curb the spread of the virus. Despite vaccination efforts, there have been complications. Existing antiviral drugs have shown limited effectiveness, prompting the use of computational methods to understand the dynamics of the virus and develop suitable treatments. The current study focuses on using biocompatible para-sulfonato-calix[4]arenes to dock against two key proteins of SARS-CoV-2, namely ribonucleic acid (RNA)-dependent RNA polymerase, and helicase. Docking results indicate a strong binding affinity of these compounds to the target proteins, with higher scores compared to commonly used medications. Molecular dynamics (MD) simulation validates the docking results, showing stable protein-ligand complexes over time. The compounds are also screened for absorption, distribution, metabolism, and excretion properties and toxicity, suggesting their potential as lead candidates for inhibiting the virus’s key proteins. However, further in vivo and in vitro studies are recommended to confirm these findings.
0

Impact of Skipping Irrigation at Different Growth Stages of Wheat on Crop Water Productivity in North Nile Delta 1- Vegetative Growth and Water Relationships

Dalia hag et al.Jun 22, 2024
A field trial was carried out through the two consecutive wheat growing times of year, 2020/21 and 2021/22, at Sakha Agriculture Research Station in Kafr El-Sheikh Governorate, situated in the middle northern region of the Nile Delta area. The study aims to determine the most critical growth stage of some wheat cultivars ( Misr 1, 3, Sakha 95, Giza 171, Gemmeiza 9,and 10) for skipping watering. Furthermore, five irrigation treatments were implemented ; Treatment A, involved full irrigation, with no skipping of irrigation at any growth stage. Treatments B, C, D, and E involved skipping irrigation at the tillering, elongation, booting, and milking stages, respectively. Obtained results revealed that Sakha 95 followed by Giza 171 are the most suitable wheat cultivars for the area of study. The control treatment, which involved full irrigation, exhibited the greatest crop return, yield components, and water associations. Skipping irrigation at the milking stage is more tolerant to skipping watering.The crop-water function of PIW and WP were analyzed. Suitable wheat cultivars should be cultivated in the middle north of Nile Delta area are Sakha 95, Giza 171 and Gemmeiza 9 under this investigation. The study recommends that the Sakha 95 variety, followed by Giza 171 and Gemmeiza 9, are the most suitable for the northern Delta region of Egypt. When irrigation water is available, we recommend not preventing irrigation at any stage of growth. In the event of a shortage of irrigation water, irrigation can be prevented in the milky phase, as the crop loss is very slight.
0

Post Mortem Interval Calculation of Oryctolagus Cuniculus Through Forensic Entomofauna – A Tool for Resolving Medicolegal Issues in Crime Scenes

Mohammad Attaullah et al.Jun 26, 2024
Post mortem interval (PMI) is an essential tool in crime scene investigations and is pivotal for resolving medicolegal issues. Developmental rates of insects can be utilized for the calculation of PMI of known and unknown animal and human cadavers. In the present study, PMI for rabbit, Oryctolagus cuniculus (Linnaeus 1758) was calculated through insect developmental rates and insect successional patterns on decomposing carcass of O. cuniculus. A total of 8 species of insects belonging to three orders and 8 families were identified on the O. cuniculus carcass. The blow fly, Chrysomya albiceps (Wiedemann 1819) belonging to the family Calliphoridae was the common and first visitor species to the rabbit carcass. The developmental rate of C. albiceps associated with the ambient climatic conditions was used as a model for the calculation of PMI. Temperature correction factor of the carcass temperature versus met station temperature was found as y = 0.9185x + 3.3624; R² = 0.8343. The accumulated degree days (∑ADD) were found as 535 while the accumulated degree hours (ADH) were found as 12842 with a resultant PMI of 7 days (ADD) and 167.4 h (ADH). Five decomposition stages of O. cuniculus were identified as fresh, bloated, active decay, advanced decay and dry remains stage. Findings of the present study can be applied for the calculation of PMI of known and unknown animal and human cadavers for resolving medicolegal issues in crime scenes.
0

Exploration for the opioidergic, GABAergic and histaminergic potentials of synthesized Schiff’s base derivatives: An in-vivo approach

Adnan Khan et al.Aug 1, 2024
Herein, five Schiff's base analogs (designated as AK1 to AK5) were synthesized and screened for their analgesic and anti-inflammatory efficacies. All compounds exhibited analgesic activity at selected doses from 45.31 % to 75.75 %, while the standard drug diclofenac sodium produced result as 86.33 %. Compounds AK1, AK3, AK4 and AK5 were found significantly P<0.001 effective at a dose of 25 mg/kg body weight (b.w). Similarly, in tail immersion test the produced percentage activity were in range from 40.19 % to 62.35 %. in which the compounds AK1, AK2, AK4 and AK5 were significantly P<0.01 effective at dose 12.5 mg/kg b.w, while at this dose significance level of efficacy of AK3 was P<0.05. Similarly, at administering doses of 25 mg/kg b.w all compounds were effective with significance level P<0.001, n = 8. Administration of the synthesized Schiff's bases at the tested doses significantly reduced paw edema as compared to control. Results of paw edema at 3rd hour was significant P<0.001. AK4 and AK5 were subjected to mechanistic approaches by GABAergic, opiodergic and histaminergic pathways. In GABAergic pathway bicuculline caused a partial reversal of writhings responses indicating the involvement of GABA receptors and therefore the tested compounds may have act through GABAergic pathway. The naloxone caused a mild reversal in the tail immersion test and indicated that some other mechanisms are additionally involved in mode of action of these compounds. Additionally a mild response was observed while studying its action involving histaminergic pathway.
0

Effect of different blanching methods on kinetics of physico-chemical, functional properties, and enzyme inactivation in baby corn

Ubaida Akbar et al.Sep 1, 2024
Baby corn, characterized by its high water activity and elevated respiration rate, poses a formidable obstacle to prolonged storage under standard ambient conditions and necessitates specialized treatments for transportation to distant locations. One of the primary postharvest challenges associated with baby corn is the occurrence of brown pigment formation because of enzymatic browning at the apex of its immature ovules, cut surfaces, and silk attached to the young ears. The present study was undertaken to investigate the effect of different blanching treatments on peroxidase inactivation, physicochemical properties, and functional properties of baby corn. The treatments applied were hot water blanching (HWB) at temperatures ranging from 70°C to 90 °C for 30-240 s, steam blanching (SB) for 30-240 s, and microwave blanching (MWB) at power levels of 360 W-900 W for 30-300 s. Results indicated that 90 % peroxidase enzyme inactivation occurred under different methods as 90 °C for 60 s for HWB, 100 °C for 60 s for SB, and 540 W for 30 s for MWB. These blanching methods have shown significant effects on the properties under investigation. MWB demonstrated the highest retention of ascorbic acid (94.15 %) and minimal color changes (ΔE = 5.72) in comparison to hot water and steam blanching. Similarly, the result for total flavonoid content for 540 W, 90 °C and 100 °C for 30, 60, and 60 s were found to be 3.01,1.99 and 2.10 mg QE/100g, phenols 48.98, 47.99 and 48.03 mg GAE/100g and DPPH (%) 42.55, 34.20 and 37.08 % respectively. The findings suggest that microwave blanching of baby corn at 540 W for 30 s holds promise to inactivate the peroxidase enzyme with better retention of physicochemical and functional properties.
0

Revealing the effects of amino acid, organic acid, and phytohormones on the germination of tomato seeds under salinity stress

Faika Karakan et al.Jan 1, 2024
Abstract Salinity accumulation poses a threat to the production and productivity of economically important crops such as tomatoes ( Solanum lycopersicum L.). Currently, salt tolerance breeding programs have been limited by insufficient genetic and physiological knowledge of tolerance-related traits and a lack of an efficient selection domain. For that purpose, we aimed to determine the ability of tomato cultivars to tolerate salt based on seed traits by multiple biochemical pathways. First, we tested three tomato cultivars according to their response to different sodium chloride (NaCl) concentrations (0, 6.3, 9.8, 13.0, and 15.8 dS m −1 ) and then we analysed their amino acids, organic acids, and phytohormones. Considering the results of germination traits, it is possible to conclude that cultivar H-2274 was more tolerant to salt stress than others. As a result, multivariate discriminant analysis including principal component analysis and two-way hierarchical clustering analyses were constructed and demonstrated that tomato cultivars were separated from each other by the amino acid, organic acid, and phytohormone contents. Considering germination traits of tomato seeds, cv. ‘H-2274’ was more tolerant to salinity than others depending on high proline (29 pmol µl −1 ) and citric acid (568 ng µl −1 ) assays. Biochemical variability offers a valuable tool for investigating salt tolerance mechanisms in tomatoes, and it will be appreciated to find high-tolerant tomato cultivar(s) to saline conditions. Also, the findings of this study have significant potential for practical applications in agriculture, particularly in developing salt-tolerant tomato cultivars to enhance productivity in saline environments and address socio-economic challenges.
Load More