The Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD; https://card.mcmaster.ca) is a curated resource providing reference DNA and protein sequences, detection models and bioinformatics tools on the molecular basis of bacterial antimicrobial resistance (AMR). CARD focuses on providing high-quality reference data and molecular sequences within a controlled vocabulary, the Antibiotic Resistance Ontology (ARO), designed by the CARD biocuration team to integrate with software development efforts for resistome analysis and prediction, such as CARD's Resistance Gene Identifier (RGI) software. Since 2017, CARD has expanded through extensive curation of reference sequences, revision of the ontological structure, curation of over 500 new AMR detection models, development of a new classification paradigm and expansion of analytical tools. Most notably, a new Resistomes & Variants module provides analysis and statistical summary of in silico predicted resistance variants from 82 pathogens and over 100 000 genomes. By adding these resistance variants to CARD, we are able to summarize predicted resistance using the information included in CARD, identify trends in AMR mobility and determine previously undescribed and novel resistance variants. Here, we describe updates and recent expansions to CARD and its biocuration process, including new resources for community biocuration of AMR molecular reference data.

Delayed graft function (DGF) increases morbidity and mortality in kidney transplant recipients. Operative parameters, including hemodynamic manipulation through vasopressors and fluids, can impact perfusion to the newly transplanted kidney and influence DGF incidence. We analyzed intraoperative time-series data in 5-minute intervals from kidney transplant recipient operations (N = 545) in conjunction with pretransplant characteristics and postsurgical outcomes, including DGF incidence, 60-day creatinine, and graft survival. Of the operations, 127 DGF events were captured in our cohort from a single academic transplant center (57/278 donations after brainstem death [DBDs], 65/150 donations after circulatory/cardiac death [DCDs], 5/117 live donations). In multiple regression, postanastomosis hypotension defined as mean arterial pressure (MAP) <75 mmHg was a risk factor for DGF independent of conventional predictors of DGF in DCD and DBD kidneys. DCD recipients with DGF had lower average postanastomosis MAP (DGF: 80.1 ± 8.1 mmHg vs no DGF: 76.4 ± 6.7 mmHg, P = .004). Interaction analysis demonstrated above-average doses of vasopressors and crystalloids were associated with improved outcomes when used at MAPs ≤75 mmHg, but they were associated with increased DGF at MAPs >75 mmHg, suggesting that the incidence of DGF can be highly influenced by intraoperative hemodynamic controls. This analysis of surgical time courses has identified potential new strategies for goal-directed anesthesia in renal transplantation.