DG
David Gómez‐Andrés
Author with expertise in Standards and Guidelines for Genetic Variant Interpretation
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
606
h-index:
17
/
i10-index:
24
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Expansion of the Human Phenotype Ontology (HPO) knowledge base and resources

Sebastian Köhler et al.Oct 25, 2018
The Human Phenotype Ontology (HPO)—a standardized vocabulary of phenotypic abnormalities associated with 7000+ diseases—is used by thousands of researchers, clinicians, informaticians and electronic health record systems around the world. Its detailed descriptions of clinical abnormalities and computable disease definitions have made HPO the de facto standard for deep phenotyping in the field of rare disease. The HPO’s interoperability with other ontologies has enabled it to be used to improve diagnostic accuracy by incorporating model organism data. It also plays a key role in the popular Exomiser tool, which identifies potential disease-causing variants from whole-exome or whole-genome sequencing data. Since the HPO was first introduced in 2008, its users have become both more numerous and more diverse. To meet these emerging needs, the project has added new content, language translations, mappings and computational tooling, as well as integrations with external community data. The HPO continues to collaborate with clinical adopters to improve specific areas of the ontology and extend standardized disease descriptions. The newly redesigned HPO website (www.human-phenotype-ontology.org) simplifies browsing terms and exploring clinical features, diseases, and human genes.
0
Citation605
0
Save
0

Clinical and Molecular Profiling in GNAO1 Permits Phenotype–Genotype Correlation

Amaia Lasa‐Aranzasti et al.Jun 16, 2024
Abstract Background Defects in GNAO1 , the gene encoding the major neuronal G‐protein Gαo, are related to neurodevelopmental disorders, epilepsy, and movement disorders. Nevertheless, there is a poor understanding of how molecular mechanisms explain the different phenotypes. Objectives We aimed to analyze the clinical phenotype and the molecular characterization of GNAO1 ‐related disorders. Methods Patients were recruited in collaboration with the Spanish GNAO1 Association. For patient phenotyping, direct clinical evaluation, analysis of homemade‐videos, and an online questionnaire completed by families were analyzed. We studied Gαo cellular expression, the interactions of the partner proteins, and binding to guanosine triphosphate (GTP) and G‐protein‐coupled receptors (GPCRs). Results Eighteen patients with GNAO1 genetic defects had a complex neurodevelopmental disorder, epilepsy, central hypotonia, and movement disorders. Eleven patients showed neurological deterioration, recurrent hyperkinetic crisis with partial recovery, and secondary complications leading to death in three cases. Deep brain stimulation improved hyperkinetic crisis, but had inconsistent benefits in dystonia. The molecular defects caused by pathogenic Gαo were aberrant GTP binding and hydrolysis activities, an inability to interact with cellular binding partners, and reduced coupling to GPCRs. Decreased localization of Gαo in the plasma membrane was correlated with the phenotype of “developmental and epileptic encephalopathy 17.” We observed a genotype–phenotype correlation, pathogenic variants in position 203 were related to developmental and epileptic encephalopathy, whereas those in position 209 were related to neurodevelopmental disorder with involuntary movements. Milder phenotypes were associated with other molecular defects such as del.16q12.2q21 and I344del. Conclusion We highlight the complexity of the motor phenotype, which is characterized by fluctuations throughout the day, and hyperkinetic crisis with a distinct post‐hyperkinetic crisis state. We confirm a molecular‐based genotype–phenotype correlation for specific variants. © 2024 The Author(s). Movement Disorders published by Wiley Periodicals LLC on behalf of International Parkinson and Movement Disorder Society.
0
Citation1
0
Save