HO
Hideki Ota
Author with expertise in MicroRNA Regulation in Cancer and Development
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(71% Open Access)
Cited by:
1,222
h-index:
33
/
i10-index:
79
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Circulating Exosomal microRNAs as Biomarkers of Colon Cancer

Hiroko Ogata‐Kawata et al.Apr 4, 2014
Purpose Exosomal microRNAs (miRNAs) have been attracting major interest as potential diagnostic biomarkers of cancer. The aim of this study was to characterize the miRNA profiles of serum exosomes and to identify those that are altered in colorectal cancer (CRC). To evaluate their use as diagnostic biomarkers, the relationship between specific exosomal miRNA levels and pathological changes of patients, including disease stage and tumor resection, was examined. Experimental Design Microarray analyses of miRNAs in exosome-enriched fractions of serum samples from 88 primary CRC patients and 11 healthy controls were performed. The expression levels of miRNAs in the culture medium of five colon cancer cell lines were also compared with those in the culture medium of a normal colon-derived cell line. The expression profiles of miRNAs that were differentially expressed between CRC and control sample sets were verified using 29 paired samples from post-tumor resection patients. The sensitivities of selected miRNAs as biomarkers of CRC were evaluated and compared with those of known tumor markers (CA19-9 and CEA) using a receiver operating characteristic analysis. The expression levels of selected miRNAs were also validated by quantitative real-time RT-PCR analyses of an independent set of 13 CRC patients. Results The serum exosomal levels of seven miRNAs (let-7a, miR-1229, miR-1246, miR-150, miR-21, miR-223, and miR-23a) were significantly higher in primary CRC patients, even those with early stage disease, than in healthy controls, and were significantly down-regulated after surgical resection of tumors. These miRNAs were also secreted at significantly higher levels by colon cancer cell lines than by a normal colon-derived cell line. The high sensitivities of the seven selected exosomal miRNAs were confirmed by a receiver operating characteristic analysis. Conclusion Exosomal miRNA signatures appear to mirror pathological changes of CRC patients and several miRNAs are promising biomarkers for non-invasive diagnosis of the disease.
0
Citation718
0
Save
0

Ultra-sensitive liquid biopsy of circulating extracellular vesicles using ExoScreen

Yusuke Yoshioka et al.Apr 7, 2014
Cancer cells secrete small membranous extracellular vesicles (EVs) into their microenvironment and circulation. Although their potential as cancer biomarkers has been promising, the identification and quantification of EVs in clinical samples remains challenging. Here we describe a sensitive and rapid analytical technique for profiling circulating EVs directly from blood samples of patients with colorectal cancer. EVs are captured by two types of antibodies and are detected by photosensitizer-beads, which enables us to detect cancer-derived EVs without a purification step. We also show that circulating EVs can be used for detection of colorectal cancer using the antigen CD147, which is embedded in cancer-linked EVs. This work describes a new liquid biopsy technique to sensitively detect disease-specific circulating EVs and provides perspectives in translational medicine from the standpoint of diagnosis and therapy. The potential of extracellular vesicles (EVs) as cancer biomarkers is substantial. Here, Yoshioka et al. describe a sensitive technique to analyse EVs directly from blood samples of patients with colorectal cancer, highlighting a liquid biopsy technique with cancer-detection possibilities.
0

Development and validation of an algorithm for identifying patients undergoing dialysis from patients with advanced chronic kidney disease

Tsutomu Imaizumi et al.Jan 6, 2025
Abstract Background Identifying patients on dialysis among those with an estimated glomerular filtration rate (eGFR) < 15 mL/min/1.73 m 2 remains challenging. To facilitate clinical research in advanced chronic kidney disease (CKD) using electronic health records, we aimed to develop algorithms to identify dialysis patients using laboratory data obtained in routine practice. Methods We collected clinical data of patients with an eGFR < 15 mL/min/1.73 m 2 from six clinical research core hospitals across Japan: four hospitals for the derivation cohort and two for the validation cohort. The candidate factors for the classification models were identified using logistic regression with stepwise backward selection. To ensure transplant patients were not included in the non-dialysis population, we excluded individuals with the disease code Z94.0. Results We collected data from 1142 patients, with 640 (56%) currently undergoing hemodialysis or peritoneal dialysis (PD), including 426 of 763 patients in the derivation cohort and 214 of 379 patients in the validation cohort. The prescription of PD solutions perfectly identified patients undergoing dialysis. After excluding patients prescribed PD solutions, seven laboratory parameters were included in the algorithm. The areas under the receiver operation characteristic curve were 0.95 and 0.98 and the positive and negative predictive values were 90.9% and 91.4% in the derivation cohort and 96.2% and 94.6% in the validation cohort, respectively. The calibrations were almost linear. Conclusions We identified patients on dialysis among those with an eGFR < 15 ml/min/1.73 m 2 . This study paves the way for database research in nephrology, especially for patients with non-dialysis-dependent advanced CKD.