SW
Sharon Wu
Author with expertise in Small Cell Lung Cancer
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
8
(0% Open Access)
Cited by:
1
h-index:
12
/
i10-index:
14
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Multidimensional analysis of B7 homolog 3 (B7-H3) RNA expression in small-cell lung cancer (SCLC) molecular subtypes.

Carl Gay et al.Jun 1, 2024
8088 Background: SCLC is an aggressive cancer with a poor prognosis. B7-H3, a transmembrane protein showing low expression in normal tissues but overexpression in SCLC and other tumors, is a promising target for antibody–drug conjugates. We performed a multidimensional analysis of B7-H3/ CD276 expression in SCLC molecular subtypes (SCLC-A, -N, -P, and -I) and its relationship with expression of other immune-related genes. Methods: Clinical and molecular data for a cohort of patients (pts) with SCLC were derived from a real-world database (Caris Life Sciences, Irving, TX, USA). Tumor RNA expression was used to assign the SCLC molecular subtype derived from non-negative matrix factorization. Programmed death ligand-1 (PD-L1) protein expression was assessed by immunohistochemistry (IHC; antibody 22c3; positive cut-off: tumor proportion score >1%). Demographic, clinical, and molecular data were summarized by SCLC subtype or B7-H3 expression quartile (Q). Spearman’s r evaluated correlations between expression of B7-H3 and other immune-related genes/signatures. Results: The cohort included 1721 pts (52.5% female; 98.9% [434/439] smokers; median age, 67 years [range, 18–90+]). Across the subtypes, B7-H3 expression was high and remarkably consistent ( q>0.05; Table). Other biomarker genes, including DLL3 (q<0.05), had lower and more variable expression. Median (range) B7-H3 expression across all samples was 16.75 (0–68.2) transcripts per million (TPM). Across B7-H3 expression Qs, the proportion of PD-L1-positive pts by IHC was similar (Q1, 39.8%; Q2, 46.5%; Q3, 40.7%; Q4, 39.2%). Median (95% confidence interval) B7-H3 expression was similar between pts with prior immunotherapy ( n=24; 14.43 [11.64–21.17] TPM) and pts without ( n=208; 14.20 [13.00–15.91] TPM); treatment information was not available for the remaining samples in this cohort. B7-H3 expression was not strongly correlated with any other immune-related genes/signatures, although several had moderate correlation ( HAVCR2/ TIM3, r=0.59; PDCD1LG2/ PD-L2, r=0.56; M2 macrophages, r=0.56; CD86, r=0.56). Conclusions: In pts with SCLC, B7-H3 showed high and consistent expression across subgroups defined by molecular subtype or prior immunotherapy. The relative expression of B7-H3 was higher and less variable among molecular subtypes than for other key molecular targets in this tumor type, including DLL3. B7-H3 expression had limited association with PD-L1 expression, supporting a role as a distinct therapeutic target. [Table: see text]
0
Citation1
0
Save
0

Immunotherapy outcomes and profile in lung cancer brain metastases.

John Villanó et al.Jun 1, 2024
8646 Background: Brain metastasis (BM) in NSCLCs have a unique tumor micro-environment (TME) characterized by distinct immune-constituents and the presence of blood-brain barrier, differentiating them from primary NSCLC tumors (PT). Despite the high incidence of BM, earlier trials indicated that less than 15% of BM patients benefit from immune checkpoint inhibitors (ICIs). We characterized the TME of BM to potentially identify a subset of patients who may respond favorably to ICIs. Methods: 36,726 NSCLC samples were analyzed by NGS of DNA (592-gene) and RNA (whole transcriptome) at Caris Life Sciences (Phoenix, AZ). TMB-high was defined as >=10mt/MB, PD-L1 was tested by IHC (22c3), and TME by RNA expression (quanTIseq). Real-world overall survival was obtained from insurance claims data and calculated from treatment start on six common ICIs to last contact (IO-OS), while time-on-treatment (TOT) was from first to last of treatment. Hazard ratios (HRs) were calculated using the Cox proportional hazards model and p values (log-rank test). Fisher’s exact tests and Mann-Whiney U were used and adjusted for multiple comparisons (q<0.05). Results: Samples were comprised of 63.5%, PT 4.9% BM, and 31.6% extracranial metastases. High TMB and loss of heterozygosity (LOH) rates were higher in BM vs. PT (55% vs. 35.7%) and (28.0% vs. 14.3%), q<0.05, respectively, while PD-L1+ rate was similar (53.3% BM vs. 55.6% PT). Significant mutational differences in BM vs. PT included TP53 (77.7% vs 65.1%), KEAP1 (19.4% vs. 12.1%), and STK11 (17.5% vs. 12.0%), q<0.05. Immune deconvolution demonstrated the abundance of neutrophils, Tregs, monocytes, and B cells was higher in PT vs. BM (fold-change: 1.35-1.73, q<0.05), while dendritic cells were higher in BM vs. PT (fold-change: 13, q<0.05). BM had significantly longer IO-OS (24.4 vs. 19.7 mo: HR = 0.83, 95% CI 0.76-0.90, p<0.05) and TOT (7.7 vs. 6.0 mo; HR = 0.83, 95% CI 0.77-0.89, p<0.05) compared to PT. PD-L1+ and TMB High were associated with longer IO-OS in BM vs. PT (HR = 0.71, 95% CI 0.63-0.81, p<0.05) and (HR = 0.83, 95% CI 0.74 – 0.93, p<0.05), respectively. By histology, squamous cell carcinoma (SC) was significantly more prevalent in PT compared to BM (25.9% vs. 8.5%, q<0.05). In adenocarcinoma (AD), BM was associated with longer IO-OS (HR = 0.78, 95% CI 0.70-0.87, p<0.05) compared to PT, while in SC, the survival association was not significant. The longer survival seen in AD was still significant after multivariate analysis with TP53, STK11 and KEAP1 (HR = 0.76, 95% CI 0.68-0.86, q<0.05). In BM, PD-L1+ and TMB High were associated with longer IO-OS in AD and may be considered first line treatment in this population, if asymptomatic. Conclusions: Historically BM have been associated with poor outcomes. We demonstrate that BM has higher TMB, increased infiltration of dendritic cells, and higher LOH than PT. After stratifying patients based on PD-L1 and TMB, patients with BM adenocarcinoma histology had improved post ICI survival.
0

Molecular and immunological characterization of androgen receptor expression in different breast cancer subtypes.

Priya Jayachandran et al.Jun 1, 2024
1114 Background: While estrogen receptor (ER) is well-studied in breast cancer (BC), the role of androgen receptor (AR) in prognosis and therapy response is less understood. Here, we aimed to characterize the clinicopathologic and molecular features of AR gene expression in BC subtypes. Methods: 10,728 BC samples were tested by NGS (592, NextSeq; WES, NovaSeq) and WTS (NovaSeq; Caris Life Sciences, Phoenix, AZ). MSI was tested by IHC and NGS. TMB-high was designated as >10 somatic mutations/MB. Tumors with AR-high(H) and AR-low(L) RNA expression were classified by top and bottom quartile, respectively. Real world overall survival (OS) and treatment-associated survival was obtained from insurance claims and calculated from treatment start to last contact using Kaplan-Meier estimates. Statistical significance was determined by chi-square and Mann-Whitney U test with p-values adjusted for multiple comparisons ( q<.05). Results: Lobular carcinoma had higher AR expression (2.37-fold) and AR positivity by IHC (93.6% vs 63.6%) compared to ductal carcinoma ( q<.05). Luminal A (LumA) had higher AR expression and IHC positivity compared to HER2-enriched, basal-like, and normal-like tumors ( q<.05). AR-H tumors were significantly ( p<.05) enriched for PIK3CA mutations in LumA (60.3% vs 29.8%), LumB (48.1% vs 23.2%), HER2-enriched (51.2% vs 39.3%), and basal-like (23.8% vs 8.3%); CDH1 mutations in LumA (26% vs 10.3%) and normal-like (55.5% vs 4.8%); MAP3K1 in LumA (17.1% vs 5.3%); ESR1 in LumB (17.9% vs 10.7%); and NF1 in HER2-enriched (19.3% vs 7.1%). AR-H had higher immune infiltration for LumA (B cells, M2 Mφ, neutrophils, NK cells, DC), LumB (B cells, M2 Mφ, neutrophils, NK cells, CD4+ T cells, DC), basal-like (NK cells, CD4+ T cells), and normal-like (NK cells, DC; q<.05) than AR-L. Conversely, AR-H HER2-enriched tumors had lower immune infiltration (B cells, M1 and M2 Mφ, NK cells, CD8+ T cells, DC) and fewer TMB-high (15.1% vs 23.2%), dMMR/MSI-high (0.3% vs 2%), and PD-L1+ tumors (15% vs 40.8%; p<.05) compared to AR-L (all q<.05). Post-doxorubicin survival was longer for patients with AR-H tumors; however, opposing trends were observed for patients with LumB (75.5 vs 56.3 m; p=.081) and HER2-enriched tumors (47.9 vs 65.2 m; p.071). AR-H was associated with longer post-dox survival in patients with LumB PIK3CA-mt tumors (81.7 vs 39.3 m; p=.036), but shorter post-dox survival in HER2-enriched PIK3CA-wt (50.4 vs 70.4 m) and PIK3CA-mt cohorts (40.8 vs 58.0 m; p=.18). Conclusions: Findings from our updated analysis based on PAM50 designation suggest a strong association between AR and PIK3CA mutations across subtypes and suggest that distinct AR-associated alterations in the immune microenvironment require further study. Exploration of specific mutations and immune-oncology markers associated with AR-H may aid in molecularly selected clinical trial design for advanced BC patients.
0

Genomic and tumor microenvironment dynamics of brain metastases in breast cancer.

Dharmini Manogna et al.Jun 1, 2024
1018 Background: Brain metastases (BM) in breast cancer (BC) have a poor prognosis, with median survival at 7.2-13 months. Interplay between genomic evolution of cancer cells and development of BM is obscure. We sought to identify genomic aberrations associated with BM. Methods: We included 14095 BC samples: 429 BM, 7858 extra-cerebral metastases (ECM) and 5808 primary tumors (PT) were analyzed by next generation sequencing of DNA (NextSeq, 592 genes and NovaSeq, WES) and RNA (NovaSeq, WTS) (Caris Life Sciences, AZ). Tumor mutational burden-high (TMB-H) was defined as ≥10 mt/MB. Cut-off for PD-L1 immunohistochemistry positivity was ≥2 intensity and >5% staining (SP142). Global loss of heterozygosity (gLOH) used a cut-off of ≥ 16%. PAM50 was evaluable for a subset (n=9724, 69%) with WTS data. Statistical significance determined using chi-square and Mann-Whitney U test and adjusted for multiple comparisons (q<0.05). Results: Median age was lower in BM than ECM and PT (55 vs 62 vs 59 years, q<0.05). BM subtype was triple negative (TNBC, 40.1%), HR+/HER2- (30.5%), or HER2+ (29.4%) vs. ECM primarily HR+/HER2- (65.4%) and PT HER2+ (52.5%). BM were Basal-like (35.3%) or HER2-enriched (35.3%), whereas ECM were Luminal B (47.2%) and PT were Basal-like (34.4%) or Luminal B (34.6%). The Table summarizes molecular findings. In HR+/HER2- BC, BM were associated with TMB-H vs. ECM and PT (q<0.05). BM had higher GATA3-mt and ESR1-mt compared to PT (q<0.05). In HER2+ BC, BM had lower PD-L1+ (11.8% vs 39.3%) and higher ESR1-mt than PT. BM had higher ERBB2-amp (93.5% vs 75.2%) and RARA-amp (27.3% vs 6.7%) than PT (q<0.05). TNBC BM had higher proportion of TMB-H tumors but lower PD-L1+ (20.8% vs 50.7%) than PT. BM had increased gLOH than ECM (59.2% vs 36.2%). PIK3CA was lower in BM vs. ECM. In all subtypes, BM, when compared to ECM and PT respectively, were associated with decreased AR+ (HR+/HER2-: 57.7% vs 80.8% vs 85.7%; HER2+: 54.4% vs 77.1% vs 81%; TNBC: 15.1% vs 27.7% vs 23.1%), increased dendritic cell infiltration (HR+/HER2-: 3.2% vs 2.6% vs 2.5%; HER2+: 3.85% vs 2.41% vs 2.36%; TNBC: 3.96% vs 2.89% vs 3.05%) but lower IFN score (HR+/HER2-: -0.56 vs -0.41 vs-0.35; HER2+: -0.53 vs -0.39 vs -0.30; TNBC: -0.55 vs -0.30 vs -0.28). Conclusions: BM in BC are more frequently associated with TNBC and Basal-like BC phenotypes than ECM or PTs. BM have a higher proportion of ESR1-mut than PTs, highlighting a possible association between endocrine resistance and development of BM. BM had lower IFN score and PDL-1 expression highlighting an immunosuppressed tumor microenvironment. [Table: see text]
0

Characterization of ESR1 mutations in endometrial and ovarian cancers.

Stéphanie Gaillard et al.Jun 1, 2024
5598 Background: Low-grade ovarian (OC) and endometrial (EC) cancers frequently express estrogen receptor (ERα, encoded by ESR1), and are considered hormonally responsive tumors. The use of endocrine therapy in the advanced and recurrent disease setting is common. In breast cancer, ESR1 mutations ( ESR1mt) convey resistance to endocrine therapy. Mechanisms for endocrine failure in gynecologic cancers are not well understood. In this study, we aim to evaluate the prevalence of ESR1mt, and associated characteristics, in EC and OC. Methods: 17,666 EC and 21,879 OC samples were analyzed by NGS of DNA (NextSeq, 592 genes and NovaSeq, WES) and RNA (NovaSeq, WTS) (Caris Life Sciences, Phx, AZ). Tumor mutational burden (TMB) totaled all somatic mutations (mt) per tumor (TMB-H: > 10 mt/MB). Statistical significance determined using chi-square and Mann-Whitney U test and adjusted for multiple comparisons (q<0.05). Real-world overall survival (rwOS) and time on treat (ToT) obtained from insurance claims data and calculated from first treatment to last contact or last of treatment, respectively. Results: L536, Y537, and D538 were the most common ESR1 hotspot mutations. ESR1mt (EC: 2.38%, OC: 0.22%) were more prevalent in endometrioid EC tumors (4.2%) compared to other EC histologies (1.7%)(p<0.05). Compared to high-grade serous (HGS) OC tumors (0.07%), ESR1mtmore prevalent in in low-grade serous (1.08%) and endometrioid (1.48%) (p<0.05). ESR1mt was associated with higher ESR1 RNA expression (EC: 1.19-fc, OC: 1-.28-fc), ER+ (EC: 94.1% vs 63%, OC: 80.9% vs 49.3%), and PR+ (EC: 90.8% vs 46.7%, OC: 36% vs 24.5%) (q<0.05). ESR1mt were associated with decreased TP53 mt (EC: 10.7% vs 50.9%, OC: 16.7% vs 78.3%), but increased PI3K pathway alterations (EC: PTEN mt: 70.4% vs 40%, PIK3R1 mt: 34.1% vs 19.6%, PIK3CA mt: 47.9% vs 36.6%, AKT1 mt: 11% vs 2.8%; OC: PTEN mt: 36.2% vs 4.%, PIK3CA mt: 32.7% vs 8.97%, AKT1 mt: 8.33% vs 0.62%), CTNNB1 mt (EC: 52.5% vs 13.9%; OC: 39.6% vs 3.09%), ARID1A mt (EC: 56% vs 32.2%; OC:28.6% vs 8.04%) and TGFBR1 mt (EC: 55.6% vs 9.16%) (q<0.05). ESR1mt was associated with TMB high (30.7% vs 21.6%) and high median IFN score (EC: -0.42 vs -0.35, OC: -0.48 vs -0.27) (q<0.05). ESR1mt enriched in patients with prior AI treatment (EC: 6.38% vs 2.65%, q=0.02; OC: 1.26% vs 0.18%), especially in EOC (14.7% vs 3.37%) (q<0.05). Conclusions: ESR1mt were more common in EC and were enriched in the endometrioid subtype, and in general associated with increased molecular alterations but a more cold immune microenvironment. Hotspot mutations known to confer endocrine resistance were most common and enrichment was observed in cases previously exposed to AIs, suggesting this may be a mechanism of resistance to endocrine therapy for some gynecologic malignancies.
0

The molecular landscape of pembrolizumab and lenvatinib treatment in endometrial cancer.

Erica Carballo et al.Jun 1, 2024
5612 Background: Pembrolizumab and lenvatinib in combination (pembro-lenv) has resulted in improved outcomes compared to standard chemotherapy for second-line treatment of endometrial cancer. Lenvatinib currently is only indicated for microsatellite stable (MSS) tumors as it is associated with significant toxicities, and microsatellite instability high (MSI-H) tumors respond to pembrolizumab alone. We seek to further specify which patients benefit from the addition of lenvatinib through analysis of outcomes by genomic subtypes and immune microenvironments. Methods: 2,532 endometrial cancer patients who received pembro or pembro-lenv were analyzed using NGS (NextSeq, 592 genes or NovaSeq, WES) and RNA (NovaSeq, WTS) (Caris Life Sciences, Phoenix, AZ). Overall survival (OS) was obtained from insurance claims data and calculated from first treatment to last contact. Hazard ratio (HR) was calculated by Cox proportional hazards, with p-value calculated by log-rank test. Responders (R) and non-responders (NR) were determined as those with above and below median survival, respectively. Immune-cell infiltrates calculated by Quantiseq. Statistical significance calculated by Mann-Whitney U test. Results: There were 37 POLE-mt, 724 MSI-H (POLE-wt), 1,222 TP53-mt (POLE-wt and MSS), and 549 TP53-wt (POLE-wt and MSS) patients treated with pembro alone or with lenvatinib. When comparing pembro-lenv vs pembro in the POLE-mt and MSI-H cohorts, there was no significant difference in OS (p=0.70 and p=0.60). There was also no significant difference in the TP53-mt cohort (17.2 vs 15.2 mo; HR 0.91 (95%CI 0.77-1.08), p=0.28). In the TP53-wt cohort, the addition of lenvatinib was associated with longer median OS (31.6 vs 26 mo; HR 0.73 (95%CI 0.54-0.99), p=0.039). Among the TP53 mutated (POLE-wt/MSS) cohort we sought to identify potential molecular differences associated with response in patients who were treated with pembro-lenv compared to pembro alone: ARID1A-mt (17.3% vs 6%, p<0.05) and ERBB3-mt (4.31% vs 0%, p<0.05) were associated with R vs NR in patients treated with pembro-lenv but not pembro alone (ARID1A-mt: 7.7% vs 9.8%, ERBB3-mt: 1.7% vs 2.4%) (p>0.05). ARID1A-mt trended towards improved post-pembro-lenv survival (28.5 vs 15.6 mo; HR 0.91 (95% CI 0.37-1.15), p=0.14) whereas ARID1A-mt was associated with worse post-pembro survival (9.57 vs 15.4 mo; HR 1.44 (95% CI 1.0 -2.06), p=0.048). Conclusions: Among POLE-wt/MSS patients, TP53 wild type patients have longer OS after pembrolizumab with lenvatinib compared to pembrolizumab alone, but in the TP53 mutated cohort, there was no difference. Among TP53-mt patients, ARID1A-mt is associated with improved pembro-lenv survival but not in pembro alone. Our findings suggest a need to readdress when to use lenvatinib in TP53-mt patients and further explore genomic alterations that may promote treatment response to optimize use of this agent in endometrial cancer.
0

KRAS mutations and their prognostic implications in appendiceal cancers.

Snigdha Nutalapati et al.Jun 1, 2024
4177 Background: Despite shared embryonic origin, appendiceal cancers (AC) have distinct clinical and molecular features compared to colorectal cancers (CRC). Detection of mutant KRAS has been associated with worse survival in CRC, whereas in AC the prognostic significance of mutant KRAS (55-65% prevalence) has yet to be characterized. Methods: AC tissues from 852 individual patients that underwent DNA (592, NextSeq, or whole exome sequencing) and whole transcriptome sequencing (NovaSeq) at Caris Life Sciences (Phoenix, AZ) were analyzed. Low-grade appendiceal mucinous neoplasms were excluded. Chi-square, Fishers-exact, and Mann Whitney U tests were used to determine statistical significance and were adjusted for multiple hypothesis testing (p< 0.05). Real-world overall survival (OS) was calculated using insurance claims of AC patients from time of sample collection to last contact. Hazard ratios (HRs) were calculated using the Cox proportional hazards model (log-rank test). Multivariate regression analysis was performed on age, sex, histology, site, comutations and KRAS mut vs. KRAS wt . Results: AC histological subtypes comprised mucinous adenocarcinoma (37.9%), goblet cell carcinoma (19.6%), signet ring cell carcinoma (12.1%), and adenocarcinoma- not otherwise specified (NOS, 30.4%). Among all AC specimens, KRAS was the most common mutation (49%). KRAS mut vs. KRAS wt tumors were more frequently associated with TP53 mut (51.2% vs. 36.8%, respectively; p< 0.01) and GNAS mut (41.1% vs. 5.7%, respectively; p < 0.00001). Most frequent co-mutant gene with KRAS was TP53 (61.2%) in adenocarcinoma-NOS, and GNAS (46.9%) in mucinous adenocarcinomas.Median OS among KRAS mut vs. KRAS wt was 33.3 vs. 25.1 months, respectively (HR 0.68, 95% CI: 0.58-0.80, p < 0.00001). KRAS mut was associated with improved survival in mucinous adenocarcinomas (HR 0.71; 95% CI: 0.52-0.96, p = 0.028) and adenocarcinoma-NOS (HR 0.77; 95% CI: 0.62-0.97, p = 0.025), but not with signet ring cell (HR 1.92; 95% CI: 0.90-4.10, p = 0.087) or goblet cell carcinoma (HR 1.39; 95% CI: 0.50-3.91, p = 0.536). Multivariate analysis showed KRAS mut was an independent prognostic factor for improved survival among all AC (HR 0.77, 95% CI: 0.64-0.93, p = 0.007) and mucinous adenocarcinoma (HR 0.60, 95% CI: 0.42-0.84, p<0.0001).Notably, GNAS mut was associated with improved survival (HR 0.57, 95% CI: 0.47-0.70, p < 0.00001), while TP53 mut was associated with poorer survival (HR 1.58, 95% CI: 1.35-1.86, p < 0.00001) among all AC. Conclusions: KRAS was one of most frequently mutated genes in ACs. In contrast to CRC, KRAS mut was associated with significantly improved survival. This observed survival advantage remained consistent in the histologic subgroup of mucinous adenocarcinoma, but not in goblet and signet ring cell cancers. Further studies with population level data understanding the molecular profiles and their survival implications in histologically distinct AC are needed.
0

Molecular and immune characterization of squamous cell ovarian cancers for identification of therapeutic targets.

Jessie Hollingsworth et al.Jun 1, 2024
5584 Background: Squamous cell carcinoma (SCC) represents <1% of all Ovarian cancers (OC) and is associated with poor prognosis. This study seeks to identify prognostic factors and molecular markers associated with OSCC compared to Endometrioid OC (EOC), Clear Cell OC (CCOC), HPV16/18-negative vulvar SCC (VSCC) and HPV16/18-negative cervical SCC (CSCC). Methods: 812 EOC, 846 CCOC, 32 OSCC, 15 malignant BT, 500 HPV16/18- CSCC, and 472 HPV16/18- VSC were analyzed using next-generation sequencing of DNA (NextSeq, 592 genes and NovaSeq, WES) and RNA (NovaSeq, WTS) (Caris Life Sciences, Phx, AZ). Tumor mutational burden (TMB) was measured by totaling all somatic mutations (mt) per tumor (TMB-H: > 10 mt/MB). PD-L1 IHC positivity was determined by a cut-off of >1% CPS (22c3, Agilent) and >2|5% (SP142, Spring Biosciences). HPV status determined by WES for HPV16 and 18. Statistical significance determined using chi-square and Mann-Whitney U test and adjusted for multiple comparisons (q<0.05). UMAP was used to visualize differences or similarities in transcriptomic profiles. Real-world overall survival (rwOS) obtained from insurance claims data and calculated from first treatment to last contact. Hazard ratio (HR) was calculated by Cox proportional hazards, with p-value calculated using log-rank test. Results: OSCC had the highest rate of TP53-mt and CDKN2A-mt compared to BT, EOC, CCOC, and CSCC (TP53-mt: 71.9%, 33.3%, 25.1%, 11.6% and 27.1%, CDKN2A-mt: 25%, 0%, 1.49%, 0.48%, and 4.45%) but lower than VSCC (TP53-mt: 80%, CDKN2A-mt: 38.9%). OSCC had lower mt of Chromatin Remodeling (CR) genes ARID1A (3.13%) compared to EOC (39.3%) and CCOC (58.2%) but higher mt of CR gene KMT2D (19.4%) compared to CCOC (3.62%) (q<0.05). OSCC had increased TMB-H than EOC, CCOC and VSCC (41.9% vs 13.6% vs 5.7% vs 8.84%) and PD-L1 IHC (all q<0.05). There was no ER/PR staining in OSCC. Median interferon (IFN) score was higher in OSCC compared to EOC, CCOC and BT (-0.24 vs -0.44 vs -0.46 vs -0.51, q<0.05) but similar to CSCC (-0.29) and VSCC (-0.17). Pathway analysis showed enrichment of IFNγ Response, Inflammatory Response, EMT and TNFα Signaling (NES: 1.53-2.05, FDR<0.25) in OSCC compared to EOC and CCOC. UMAP showed OSCC clustering more closely with CSCC and VSCC compared to EOC and CCOC. OSCC had worse post-Carboplatin survival (19.6 mo) compared to EOC (71.6 mo, p<0.01) and CCOC (46.9 mo, p<0.01), similar post-Carbo survival to TP53-mt CSCC (22.5 mo; p=0.80) but improved post-Carbo survival compared to TP53-mt VSCC (9.05 mo; p=0.01). Conclusions: The molecular and transcriptomic profile of OSCC is distinct from EOC, CCOC, and BT but similar to CSCC and VSCC. OSCC demonstrated a more immune hot phenotype. Further studies are needed to investigate the potential use of immunotherapy in OSCC.