Summary Immune checkpoint inhibitors (ICIs) are a breakthrough in oncology treatment, and studies of screening predictive biomarkers of ICIs are emerging. We developed a web server named IMPACT ( http://impact.brbiotech.com/ ) to thoroughly explore immunotherapeutic predictive or prognostic biomarkers. IMPACT contains a large dataset of 6,276 patients treated with ICIs and integrates 11 well-designed function modules, enabling an in-depth solution for biomarkers exploration. Compared with the existing tools, IMPACT was implemented with one exclusive module for interaction analysis and several optimized conventional functions for discovering novel biomarkers. Specifically, the interaction analysis of biomarker-treatment effect is essential to determine whether a biomarker is predictive and/or prognostic for ICIs. Moreover, several optimized functions allow complicated biomarker exploration, including customized selections of variant types in more detail, automatically screening meaningful co-mutations among multiple genes, and selecting cut-off values for gene expression biomarkers. In summary, IMPACT is a comprehensive analysis resource to facilitate biomarker research of ICIs.

Abstract Small cell lung cancer (SCLC) is a highly aggressive malignancy characterized by rapid growth and early metastasis and is susceptible to treatment resistance and recurrence. Understanding the intra‐tumoral spatial heterogeneity in SCLC is crucial for improving patient outcomes and clinically relevant subtyping. In this study, a spatial whole transcriptome‐wide analysis of 25 SCLC patients at sub‐histological resolution using GeoMx Digital Spatial Profiling technology is performed. This analysis deciphered intra‐tumoral multi‐regional heterogeneity, characterized by distinct molecular profiles, biological functions, immune features, and molecular subtypes within spatially localized histological regions. Connections between different transcript‐defined intra‐tumoral phenotypes and their impact on patient survival and therapeutic response are also established. Finally, a gene signature, termed ITHtyper, based on the prevalence of intra‐tumoral heterogeneity levels, which enables patient risk stratification from bulk RNA‐seq profiles is identified. The prognostic value of ITHtyper is rigorously validated in independent multicenter patient cohorts. This study introduces a preliminary tumor‐centric, regionally targeted spatial transcriptome resource that sheds light on previously unexplored intra‐tumoral spatial heterogeneity in SCLC. These findings hold promise to improve tumor reclassification and facilitate the development of personalized treatments for SCLC patients.

Abstract Background The management of severe immune-related hepatotoxicity (irH) needs to be further optimized. This study aims to analyze the clinical characteristics of severe irH; improve the therapeutic strategy, especially salvage treatment in steroid-refractory irH; and determine the safety of immune checkpoint inhibitor (ICPi)-rechallenge. Methods This multicenter retrospective study included patients who developed severe irH and those without irH after immunotherapy between May 2019 and June 2023. Propensity score matching was used to match these two cohorts with similar baseline characteristics. Results Among 5,326 patients receiving ICPis, 51 patients developed severe irH. irH occurred after a median duration of 36 days and a median of two doses after the first ICPi administration. Patients receiving PD-L1 inhibitors faced a lower risk of developing severe irH. A higher dose of glucocorticoids (GCS) was administered to grade 4 irH than grade 3 irH. For steroid-sensitive patients, grade 4 irH individuals received a higher dosage of GCS than those with grade 3 irH, with no difference in time to resolution. Meanwhile, a significantly higher dose of GCS plus immunosuppression was needed in the steroid-refractory group. Liver biopsy of the steroid-refractory patients exhibited heterogeneous histological features. Twelve patients were retreated with ICPi. No irH reoccurred after a median follow-up of 9.3 months. Conclusion irH requires multidimensional evaluation. PD-L1 inhibitors correlated with a lower risk of severe irH. Grade 4 irH demands a higher dose of GCS than recommended. Pathology may guide the salvage treatment for steroid-refractory irH. ICPi rechallenge in severe irH is feasible and safe.

e14689 Background: Intra-tumor heterogeneity (ITH) is a hallmark of cancer and plays a significant role in tumor evolution, treatment response, and the development of drug resistance. However, there is currently no standardized metric for assessing ITH in clinical practice. Several recent studies have proposed different algorithms of ITH based on multi-omics data. In this study, we have developed a web-based tool for analyzing tumor heterogeneity using diverse omics data and investigated the correlation between different ITH algorithms using TCGA data. Methods: We collected previously published ITH algorithms based on single-/multi-region genomic, transcriptomic, and proteomic data. We integrated these algorithms into a web server called ITHindex, which utilizes Shiny framework. TCGA data was employed for a comprehensive comparison of five ITH algorithms including MATH, CNH, DEPTH2, Shannon index and DITHER. Results: ITHindex (https://xwen.shinyapps.io/ithindex/) is an open-access online tool that encompasses a total of eight algorithms. Based on the type of input data, these algorithms can be categorized into SNV, cancer cell fraction (CCF), copy number variations segment, bulk or single-cell RNAseq, and multi-region mass spectrometry of protein. According to the calculation principles, these algorithms include those based on Shannon entropy, MAD, tumor clonality, ratio, and distance. To demonstrate the practicality of ITHindex, we employed TCGA data to calculate ITH values using five algorithms. The analysis unveiled that the distribution of the same algorithm differs across various tumor types. When considering the same type of input data, different algorithms exhibited a strong correlation. Furthermore, with the exception of MATH, the other ITH values displayed a negative correlation with overall survival. Conclusions: ITHindex is a user-friendly web-based tool that quantifies intra-tumor heterogeneity, empowering researchers to investigate the role of ITH in oncologic biology.

5551 Background: RC88 is a first-in-class, antibody-drug conjugate (ADC) targeting mesothelin (MSLN) with the payload of Monomethyl auristatin E. MSLN, a glycosylphosphatidylinositol-anchored protein, is overexpressed in several solid tumors with limited expression in normal tissues. RC88-C001 is a single-arm, open-label, multi-center phase 1/2 study evaluating RC88 in patients (pts) with MSLN-expressing advanced solid tumor (NCT04175847). This abstract mainly reports the efficacy results from the dose expansion part (phase 2) of the study. Methods: Pts with MSLN-expressing advanced malignant solid tumors that have failed after standard therapies were enrolled in this study. MSLN was tested by IHC. For phase 2 study, the primary endpoint was ORR by investigator per RECIST v1.1 with secondary endpoints including DCR, PFS, and safety. Results: As of 19 December, 2023, 164 pts with advanced solid tumor were enrolled. Dose escalation phase was completed, and 2.0 mg/kg and 2.5 mg/kg Q3W were expanded in phase 2. In ovarian cancer cohort, 60 pts were enrolled and all with 2+ or 3+ MSLN expression. Forty-two (70%) were FIGO stage IV. Thirty-three (55%) had prior bevacizumab, and 29 (48.3%) had prior PARPi. The number of previous lines of systemic therapy were 2-7. Fifty-four (90%) pts were platinum-resistant. Among the 43 pts with at least one post-baseline tumor assessment, the ORR was 37.2% (16/43). In pts with prior 2-4 lines of therapies, the ORR was 45.5% (10/22) in 2.0 mg/kg and 33.3% (2/6) in 2.5mg/kg. In non-squamous-non-small-cell lung-carcinoma, 26 pts progressed on previous systemic therapy were enrolled and 23 (88.4%) had received ≥ 2 lines of prior therapies. Twenty-three pts had one post-baseline tumor assessment; the ORR was 21.7% (5/23). Among the 15 pts without driver gene mutations, 11 (73%) had received prior platinum-doublet chemotherapy and PD-(L)1 inhibitor. The ORR was 33.3% (5/15) with 1 CR. In cervical cancer, 18 pts progressed on previous systemic therapy were enrolled. In 17 pts with one post-baseline tumor assessment, 11 (64.7%) had received ≥ 2 lines of prior therapies; 12 (70.5%) had prior platinum-doublet chemotherapy and PD-(L)1 inhibitor. The ORR was 35.3% (6/17). TEAEs were reported in 161 pts (98.2%), with 40.2% ≥grade 3 TEAEs. Twenty-three pts (14%) had SAE related to RC88. The most frequent TRAEs were white blood cell count decreased (46.3%), neutrophil count decreased (42.1%), anemia (34.1%), nausea (32.3%), and aspartate aminotransferase increased (31.1%). The overall safety profile was better in 2.0mg/kg than 2.5mg/kg, therefore 2.0mg/kg was chosen as RP2D in further studies in China. Conclusions: RC88 demonstrated tolerable safety and encouraging preliminary efficacy in MSLN-expressing solid tumors, warranting further investigations. Clinical trial information: NCT04175847 .