YL
Yifei Li
Author with expertise in Natural Killer Cells in Immunity
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
1
h-index:
1
/
i10-index:
0
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Low‐intensity pulsed ultrasound improves myocardial ischaemia‒reperfusion injury via migrasome‐mediated mitocytosis

Jiawei Tian et al.Jul 1, 2024
Abstract During myocardial ischaemia‒reperfusion injury (MIRI), the accumulation of damaged mitochondria could pose serious threats to the heart. The migrasomes, newly discovered mitocytosis‐mediating organelles, selectively remove damaged mitochondria to provide mitochondrial quality control. Here, we utilised low‐intensity pulsed ultrasound (LIPUS) on MIRI mice model and demonstrated that LIPUS reduced the infarcted area and improved cardiac dysfunction. Additionally, we found that LIPUS alleviated MIRI‐induced mitochondrial dysfunction. We provided new evidence that LIPUS mechanical stimulation facilitated damaged mitochondrial excretion via migrasome‐dependent mitocytosis. Inhibition the formation of migrasomes abolished the protective effect of LIPUS on MIRI. Mechanistically, LIPUS induced the formation of migrasomes by evoking the RhoA/Myosin II/F‐actin pathway. Meanwhile, F‐actin activated YAP nuclear translocation to transcriptionally activate the mitochondrial motor protein KIF5B and Drp1, which are indispensable for LIPUS‐induced mitocytosis. These results revealed that LIPUS activates mitocytosis, a migrasome‐dependent mitochondrial quality control mechanism, to protect against MIRI, underlining LIPUS as a safe and potentially non‐invasive treatment for MIRI.
0
Citation1
0
Save
0

Integrative analyses of multi-omics data constructing tumor microenvironment and immune-related molecular prognosis model in human colorectal cancer

Yifei Li et al.Jun 1, 2024
The increasing prevalence and incidence of colorectal cancer (CRC), particularly in young adults, underscore the imperative to comprehend its fundamental mechanisms, discover novel diagnostic and prognostic markers, and enhance therapeutic strategies. Here, we integrated multi-omics data, including gene expression, somatic mutation data and DNA methylation data, to unravel the intricacies of tumor microenvironment (TME) in CRC and search for novel prognostic markers. By calculating the immune score for each patient from the expression profile, we delineated the differential immune cell fraction, constructed an immune-related multi-omics atlas, and identified molecular characteristics. The entire colorectal dataset (n = 343) was randomly divided into training (n = 249) and testing datasets (n = 94). We screened 144 immune-related genes, 6 mutant genes, and 38 methylation probes associated with overall survival (OS). These makers were then incorporated into a 10-gene prognostic model using Lasso and Cox regression in the training dataset, and the model's performance was evaluated in an independent validation dataset. The model exhibited satisfactory results (average concordance index [C-index] = 0.77), with the average 1-year, 3-year, and 5-year AUCs being 0.79, 0.76, and 0.76 in the training dataset and 0.74, 0.80, and 0.90 in the testing dataset. Furthermore, the prognostic model demonstrated applicability in guiding chemotherapy for CRC patients and exhibited a degree of pan-cancer utility in risk stratification. In conclusion, our integrated analysis of multi-omics data revealed immune-related genetic and epigenetic characteristics of the TME. We propose an integrative prognostic model that can stratify risk and guide chemotherapy for CRC patients. The generalizability of the model in risk stratification across different cancer types was validated in Pan-Cancer cohort.