Accumulating evidence indicates that patient-derived organoids (PDOs) can predict drug responses in the clinic, but the ability of PDOs to predict responses to chemoradiation in cancer patients remains an open question. Here we generate a living organoid biobank from patients with locally advanced rectal cancer (LARC) treated with neoadjuvant chemoradiation (NACR) enrolled in a phase III clinical trial. Our co-clinical trial data confirm that rectal cancer organoids (RCOs) closely recapitulate the pathophysiology and genetic changes of corresponding tumors. Chemoradiation responses in patients are highly matched to RCO responses, with 84.43% accuracy, 78.01% sensitivity, and 91.97% specificity. These data imply that PDOs predict LARC patient responses in the clinic and may represent a companion diagnostic tool in rectal cancer treatment.

Growing evidence suggests that an imbalanced gut microbiota composition plays a crucial role in the development of neuromyelitis optica spectrum disorders (NMOSD), an inflammatory demyelinating disease primarily affecting the optic nerves and central nervous system (CNS). In light of this, we explored the potential therapeutic benefits of GV-971 in NMOSD. GV-971 is a drug used for treating mild-to-moderate Alzheimer's disease, which targets the gut-brain axis and reduces neuroinflammation.

Using nicofluprole as the lead compound, we designed and synthesized a series of new phenylpyrazole analogues through substituting the methyl group on the nitrogen atom of the amide with an acyl group. Bioassay results showed that compounds A12–A17 with a 1-cyanocyclopropimide group exhibited outstanding insecticidal activity. The LC50 values for compounds A12–A17 against Tetranychus cinnabarinus ranged from 0.58 to 0.91 mg/L. Compound A15 showed an LC50 value of 0.29 and 3.10 mg/L against Plutella xylostella and Myzus persicae, respectively. Molecular docking indicated the potential binding interactions of compound A15 with a gamma-aminobutyric acid receptor. Additionally, density functional theory calculations implied that the 1-cyanocyclopropimide structure might be essential for its biological activity. Phenylpyrazole derivatives, containing a 1-cyanocyclopropimide fragment, have the potential for further development as potential insecticides.

The Ptr1 (Pseudomonas tomato race 1) locus in Solanum lycopersicoides confers resistance to strains of Pseudomonas syringae pv. tomato expressing AvrRpt2 and Ralstonia pseudosolanacearum expressing RipBN. Here we describe the identification and phylogenetic analysis of the Ptr1 gene. A single recombinant among 585 F2 plants segregating for the Ptr1 locus was discovered that narrowed the Ptr1 candidates to eight nucleotide-binding leucine-rich repeat protein (NLR)-encoding genes. From analysis of the gene models in the S. lycopersicoides genome sequence and RNA-Seq data, two of the eight genes emerged as the strongest candidates for Ptr1. One of these two candidates was found to encode Ptr1 based on its ability to mediate recognition of AvrRpt2 and RipBN when it was transiently expressed with these effectors in leaves of Nicotiana glutinosa. The ortholog of Ptr1 in tomato and in Solanum pennellii is a pseudogene. However, a functional Ptr1 ortholog exists in N. benthamiana and potato and both mediate recognition of AvrRpt2 and RipBN. In apple and Arabidopsis, recognition of AvrRpt2 is mediated by the Mr5 and RPS2 proteins, respectively. Phylogenetic analysis places Ptr1 in a distinct clade compared to Mr5 and RPS2 and it therefore appears to have arisen by convergent evolution for recognition of AvrRpt2.

Motivation: Time-diffusion-dependent diffusion MRI (t-dMRI)provides quantitative imaging of cellular microstructure; however, its value in diagnosing molecular subtypes of IDH in gliomas remains unknown.<stork-writing-assistant></stork-writing-assistant><stork-writing-assistant></stork-writing-assistant>Goal(s): Molecular subtypes of IDH were diagnosed using quantitative time-dependent diffusion imaging parameters.<stork-writing-assistant></stork-writing-assistant><stork-writing-assistant></stork-writing-assistant>Approach: t-dMRI was acquired using OGSE and PGSE sequences, and quantitative parameters were then fitted using the Imaging Microstructural Parameters Using Limited spectrally edited diffusion(IMPULSED) method and evaluated for diagnostic potency for molecular subtypes of IDH in gliomas. <stork-writing-assistant></stork-writing-assistant><stork-writing-assistant></stork-writing-assistant>Results: t-dMRI can identify IDH genotypes, and intracellular fraction (fin) reflects the actual state of tumor cells.<stork-writing-assistant></stork-writing-assistant><stork-writing-assistant></stork-writing-assistant>Impact: t-dMRI can non-invasively identify IDH genotype.<stork-writing-assistant></stork-writing-assistant><stork-writing-assistant></stork-writing-assistant>

The chemical composition of Ganoderma lucidum ethanol extracts was systematically analyzed and identified by ultra-high performance liquid chromatography-quadrupole electrostatic field orbitrap high-resolution mass spectrometry(UPLC-Orbitrap-HRMS). The fragmentation pattern of the representative chemical compounds was summarized, and the potential anti-liver fibrosis active compounds of G. lucidum acting on the farnesoid X receptor(FXR) target were studied to elucidate its pharmacodynamic substance basis. Preliminarily, 95 chemical constituents of G. lucidum ethanol extracts were identified, including 24 ganoderic acids, 9 ganoderenic acids, 13 lucidenic acids, 3 ganolucidic acids, 1 ganoderma lactone, 40 other triterpenoids, 4 fatty acids, and 1 other constituent. In addition, the fragmentation patterns of the representative compounds were also analyzed. The structural characteristics of ganoderic acids and ganoderenic acids were the C30 skeleton, containing free-COOH and-OH groups, which could easily lose H_2O and CO_2 to form fragment ions. The D-ring was mostly a five-membered ring, which was prone to breakage. Lucidenic acids were the lanosterolane-type of the C27 skeleton, and the side-chain structure became shorter and contained the same free-COOH and-OH compared with ganoderic acids, which had been reduced from 8 to 5 cartons and prone to lose H_2O and CO_2. Then, six reported FXR receptor agonists were selected to form a training set for establishing a pharmacophore model based on FXR ligands. The 95 identified chemical constituents of G. lucidum were matched with the pharmacophore, and the optimal pharmacophore model 02(sensitivity=0.750 00, specificity=0.555 56, ROC=0.750) was selected for the virtual screening of the G. lucidum compound library through the validation of the test set. Finally, 31 potential G. lucidum active constituents were screened and chosen to activate the FXRs. The ADMET results showed that ganoderic acid H and lucidenic acid J had less than 90% plasma protein binding rate and no hepatotoxicity, which could be used as FXR activators for developing clinical drugs for the treatment of liver fibrosis, either alone or in combination.

Intervertebral disk degeneration (IDD) is a common clinical spinal disease and one of the main causes of low back pain (LBP). Generally speaking, IDD is considered a natural degenerative process with age. However, with the deepening of research, people have discovered that IDD is not only related to age, but also has many factors that can induce and accelerate its progression. In addition, the pathogenesis of IDD remains unclear, resulting in limited traditional treatment methods that cannot effectively prevent and treat IDD. Conservative treatment may lead to patients’ dependence on drugs, and the pain relief effect is not obvious. Similarly, surgical treatment is highly invasive, with a longer recovery time and a higher recurrence rate. With the deepening of exploration, people have discovered that intestinal microorganisms are an important symbiotic microbial community in the human body and are closely related to the occurrence and development of various diseases. Changes in intestinal microorganisms and their metabolites may affect the body’s inflammatory response, immune regulation, and metabolic processes, thereby affecting the health of the intervertebral disk. In this context, the gut microbiota has received considerable attention as a potential target for delaying or treating IDD. This article first introduces the impact of gut microbes on common distal organs, and then focuses on three potential mechanisms by which gut microbes and their metabolites influence IDD. Finally, we also summarized the methods of delaying or treating IDD by interfering with intestinal microorganisms and their metabolites. Further understanding of the potential mechanisms between intestinal microorganisms and IDD will help to formulate reasonable IDD treatment strategies to achieve ideal therapeutic effects.