XL
Xiaojie Liu
Author with expertise in Ecological Dynamics of Marine Environments
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(60% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
15
/
i10-index:
17
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Nitrite and sulfide stress affects physiological and metabolic functions of gills in crab Eriocheir sinensis

Yi-fu Xing et al.Jan 1, 2025
Nitrite and sulfide are environmental factors that affect crabs survival and immunity. Gills are important respiratory and immune organs of Chinese mitten crabs Eriocheir sinensis, and both nitrite and sulfide can affect the physiological function stability of gill tissues. The present study investigated the acute toxicity of 10 mg/L nitrite and 5 mg/L sulfide, single and in combination, on the morphological, immune, osmoregulatory, and metabolic functions of the gill tissues of Chinese mitten crab. Both single and combined stressors were observed to disrupt the structural integrity of gill tissues. Oxidative stress-related indicators, including MDA, H2O2, and ·O2− content, exhibited an increase in all stress groups. The activities of antioxidant enzymes such as CAT and SOD and the expression levels of antioxidant genes fluctuated to varying degrees in all stress groups. The expression levels of osmotic regulating genes such as aqp, vatp, and nhe increased, as did the expression levels of lipid metabolism-related genes such as pparγ, rxr, fabp1, gyk, and dgat1. Furthermore, nitrite and sulfide stress affected the functions of metabolic pathways related to arachidonic acid, linoleic acid, D-amino acids, phenylalanine, and other substances in Chinese mitten crabs gill tissues. Additionally, the study identified 18 potential biomarkers related to stress responses. The nitrite and sulfide stressors disrupt the structure of crab gill tissues, cause osmoregulation disturbances, immune dysfunction, induce amino acid and lipid metabolic changes in gill tissue.
25

A molecular toolkit for the green seaweed Ulva mutabilis

Jonas Blomme et al.Dec 15, 2020
Abstract The green seaweed Ulva is an ecologically-important marine primary producer as well as a promising cash crop cultivated for multiple uses. Despite its importance, several molecular tools are still needed to better understand seaweed biology. Here, we report the development of a flexible and modular molecular cloning toolkit for the green seaweed Ulva mutabilis based on a Golden Gate cloning system. The toolkit presently contains 125 entry vectors, 26 destination vectors and 107 functionally validated expression vectors. We demonstrate the importance of endogenous regulatory sequences for transgene expression and characterize three endogenous promoters suitable to drive transgene expression. We describe two vector architectures to express transgenes via two expression cassettes or a bicistronic approach. The majority of selected transformants (50-80%) consistently give clear visual transgene expression. Furthermore, we made different marker lines for intracellular compartments after evaluating 13 transit peptides and 11 tagged endogenous Ulva genes. Our molecular toolkit enables the study of Ulva gain-of-function lines and paves the way for gene characterization and large-scale functional genomics studies in a green seaweed. One-sentence summary Molecular cloning tools allow to generate gain-of-function seaweed lines that will help to study seaweed biology.
1

Gametogenesis in the green seaweed Ulva mutabilis coincides with massive transcriptional restructuring

X Liu et al.Aug 13, 2021
Abstract The molecular mechanism underlying sexual reproduction in land plants is well understood in model plants and is a target for crop improvement. However, unlike land plants, the genetic basis involved in triggering reproduction and gamete formation remains elusive in most seaweeds, which are increasingly viewed as an alternative source of functional food and feedstock for energy applications. Here, gametogenesis of Ulva mutabilis , a model organism for green seaweeds, is studied. We analyze transcriptome dynamics at different time points during gametogenesis following induction of reproduction by fragmentation and removal of sporulation inhibitors. Analyses demonstrate that 45% of the genes in the genome are differentially expressed during gametogenesis. We identified several transcription factors that potentially play a key role in the early gametogenesis of Ulva given the function of their homologs in higher plants and microalgae. In particular, the detailed expression pattern of an evolutionary conserved transcription factor containing an RWP-RK domain suggests a key role during Ulva gametogenesis. The identification of putative master regulators of gametogenesis provides a starting point for further functional characterization. Highlight Transcriptomic analyses of gametogenesis in the green seaweed Ulva highlight the importance of a conserved RWP-RK transcription factor in induction of sexual reproduction.