WS
Wei Shen
Author with expertise in Diversity and Function of Gut Microbiome
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(67% Open Access)
Cited by:
257
h-index:
12
/
i10-index:
12
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Multi-center Phase II Trial of Weekly Paclitaxel Plus Cisplatin Combination Chemotherapy in Patients with Advanced Gastric and Gastro-esophageal Cancer

Qing Sun et al.Feb 3, 2009
This study is performed to evaluate the response rate, time to progression and safety of the combination chemotherapy with weekly paclitaxel plus cisplatin in advanced gastric and gastro-esophageal cancer. The paclitaxel 100 mg/m2 was administered through a 1 h intravenous infusion on Days 1 and 8. The cisplatin 30 mg/m2 was also administered along with a program of forced diuresis that included at least 2000 ml of fluids after the paclitaxel infusion over 30 min on Days 1 and 8. The chemotherapy was given every 21 days and continued until disease progression, patient refusal or an unacceptable toxicity up to nine cycles. Forty-seven (95.9%) of the 49 patients were assessable for response. Two cases of complete response and 19 cases of partial response were confirmed, giving an overall response rate of 42.9% (95% CI, 29.0–56.8%). The median time to progression and overall survival for all patients were 5.9 months (95% CI, 1.6–9.1 months) and 11.2 months (95% CI, 6.1–21.3 months). The most severe hematologic adverse event was neutropenia, which occurred with a Grade 3 intensity in 17.0% and Grade 4 in 4.3%. Grade 3 vomiting, peripheral neuropathy and elevated transaminase were observed in 4.3%, 4.3% and 2.1% of patients. Combination of weekly paclitaxel plus cisplatin is an active regimen with excellent tolerability as a first-line treatment of advanced gastric and gastro-esophageal cancer.
0
Citation13
0
Save
0

Bacteroides fragilis alleviates necrotizing enterocolitis through restoring bile acid metabolism balance using bile salt hydrolase and inhibiting FXR-NLRP3 signaling pathway

Zhenhui Chen et al.Jul 16, 2024
Necrotizing enterocolitis (NEC) is a leading cause of morbidity and mortality in premature infants with no specific treatments available. We aimed to identify the molecular mechanisms underlying NEC and investigate the therapeutic effects of Bacteroides fragilis on NEC. Clinical samples of infant feces, bile acid-targeted metabolomics, pathological staining, bioinformatics analysis, NEC rat model, and co-immunoprecipitation were used to explore the pathogenesis of NEC. Taxonomic characterization of the bile salt hydrolase (bsh) gene, enzyme activity assays, 16S rRNA sequencing, and organoids were used to explore the therapeutic effects of B. fragilis on NEC-related intestinal damage. Clinical samples, NEC rat models, and in vitro experiments revealed that total bile acid increased in the blood but decreased in feces. Moreover, the levels of FXR and other bile acid metabolism-related genes were abnormal, resulting in disordered bile acid metabolism in NEC. Taurochenodeoxycholic acid accelerated NEC pathogenesis and taurodeoxycholate alleviated NEC. B. fragilis displayed bsh genes and enzyme activity and alleviated intestinal damage by restoring gut microbiota dysbiosis and bile acid metabolism abnormalities by inhibiting the FXR-NLRP3 signaling pathway. Our results provide valuable insights into the therapeutic role of B. fragilis in NEC. Administering B. fragilis may substantially alleviate intestinal damage in NEC.
0
Citation1
0
Save
0

Real-time predictive model of extrauterine growth retardation in preterm infants with gestational age less than 32 weeks

Liang Gao et al.Jun 5, 2024
Abstract The aim of this study was to develop a real-time risk prediction model for extrauterine growth retardation (EUGR). A total of 2514 very preterm infants were allocated into a training set and an external validation set. The most appropriate independent variables were screened using univariate analysis and Lasso regression with tenfold cross-validation, while the prediction model was designed using binary multivariate logistic regression. A visualization of the risk variables was created using a nomogram, while the calibration plot and receiver operating characteristic (ROC) curves were used to calibrate the prediction model. Clinical efficacy was assessed using the decision curve analysis (DCA) curves. Eight optimal predictors that namely birth weight, small for gestation age (SGA), hypertensive disease complicating pregnancy (HDCP), gestational diabetes mellitus (GDM), multiple births, cumulative duration of fasting, growth velocity and postnatal corticosteroids were introduced into the logistic regression equation to construct the EUGR prediction model. The area under the ROC curve of the training set and the external verification set was 83.1% and 84.6%, respectively. The calibration curve indicate that the model fits well. The DCA curve shows that the risk threshold for clinical application is 0–95% in both set. Introducing Birth weight, SGA, HDCP, GDM, Multiple births, Cumulative duration of fasting, Growth velocity and Postnatal corticosteroids into the nomogram increased its usefulness for predicting EUGR risk in very preterm infants.
0

Integrative analysis of histone acetylation regulated CYP4F12 in esophageal cancer development

Yanhong Chen et al.May 29, 2024
Current therapeutic strategies for esophageal cancer (EC) patients have yielded limited improvements in survival rates. Recent research has highlighted the influence of drug metabolism enzymes on both drug response and EC development. Our study aims to identify specific drug metabolism enzymes regulated by histone acetylation and to elucidate its molecular and clinical features. CYP4F12 exhibited a notable upregulation subsequent to trichostatin A treatment as evidenced by RNA sequencing analysis conducted on the KYSE-150 cell line. The change in gene expression was associated with increased acetylation level of histone 3 K18 and K27 in the promoter. The regulation was dependent on p300. In silicon analysis of both The Cancer Genome Atlas esophageal carcinoma and GSE53624 dataset suggested a critical role of CYP4F12 in EC development, because CYP4F12 was downregulated in tumor tissues and predicted better disease-free survival. Gene ontology analysis has uncovered a robust correlation between CYP4F12 and processes related to cell migration, as well as its involvement in cytosine-mediated immune activities. Further investigation into the relationship between immune cells and CYP4F12 expression has indicated an increased level of B cell infiltration in samples with high CYP4F12 expression. CYP4F12 was also negatively correlated with the expression of inhibitory checkpoints. An accurate predictive nomogram model was established combining with clinical factors and CYP4F12 expression. In conclusion, CYP4F12 was crucial in EC development, and targeting CYP4F12 may improve the therapeutic efficacy of current treatment in EC patients. SIGNIFICANCE STATEMENT: CYP4F12 expression was downregulated in esophageal cancer (EC) patients and could be induced by trichostatin A. During EC development, CYP4F12 was linked to reduced cell migration and increased infiltration of B cells. CYP4F12 also is a biomarker as prognostic predictors and therapeutic guide in EC patients.
0

Maternal prepregnancy overweight/obesity increase the risk of low Apgar scores in twins: a population-based cohort study in China

Zhoushan Feng et al.Jan 17, 2025
Objective While prepregnancy overweight or obesity is known to negatively impact maternal health, its effect on twin infants is not well understood. Therefore, we conducted a nationwide, multicenter retrospective study to investigate the association between maternal prepregnancy weight and health outcomes in twins. Study design This study collected data from 22 healthcare units across 12 regions in China between January 2018 and December 2020. To control for confounding factors, multiple logistic regression, propensity score matching (PSM), inverse probability of treatment weighting (IPTW), and overlapping weighting models (OW) were applied to explore the effects of prepregnancy BMI on Apgar scores and other outcomes. Results After screening, a total of 4,724 women with twin pregnancies and 9,448 newborns were included in the study. Compared to normal prepregnancy weight, prepregnancy overweight/obesity significantly increased the risk of gestational hypertension and gestational diabetes in mothers [adjusted OR (95% CI): 1.85 (1.55–2.21) and 1.49 (1.27–1.74), respectively]. It also increased the incidence of twins with a 1-min Apgar score ≤7, whether they were larger or smaller [1.60 (1.20–2.13) and 1.45 (1.09–1.92), respectively]. Sensitivity analyses using PSM [1.60 (1.20–2.13) and 1.55 (1.07–2.25)], IPTW [1.67 (1.31–2.12) and 1.48 (1.17–1.87)], and OW [1.65 (1.08–2.57) and 1.47 (0.97–2.25)] confirmed the stability of these results. However, it did not affect the likelihood of a 5-min Apgar score ≤7 [adjusted OR (95% CI): 0.82 (0.24–2.17) and 1.40 (0.70–2.73)]. In contrast, prepregnancy underweight was associated with a reduced incidence of twins with a 1-min Apgar score ≤7 [adjusted OR (95% CI): 0.56 (0.32–0.92) and 0.58 (0.34–0.94)], but had no effect on the 5-min Apgar score ≤7 [adjusted OR (95% CI): 0.82 (0.24–2.17) and 0.22 (0.01–1.08)]. Prepregnancy BMI did not significantly affect twin birth weight discordance, NICU admission, preterm birth, or low birth weight. Conclusion Maternal overweight/obesity before pregnancy increases the risk of hypertensive disorders and gestational diabetes in twin pregnancies and significantly raises the likelihood of twins having a low 1-min Apgar score. However, no significant impact on 5-min Apgar scores was observed. These findings highlight the importance of managing weight before pregnancy and ensuring readiness for neonatal resuscitation during delivery.
0

Genetic associations between gut microbiota and allergic rhinitis: an LDSC and MR analysis

XuWen Zheng et al.May 24, 2024
Background Several studies have suggested a potential link between allergic rhinitis (AR) and gut microbiota. In response, we conducted a meta-analysis of Linkage Disequilibrium Score Regression (LDSC) and Mendelian randomization (MR) to detect their genetic associations. Methods Summary statistics for 211 gut microbiota taxa were gathered from the MiBioGen study, while data for AR were sourced from the Pan-UKB, the FinnGen, and the Genetic Epidemiology Research on Aging (GERA). The genetic correlation between gut microbiota and AR was assessed using LDSC. The principal estimate of causality was determined using the Inverse-Variance Weighted (IVW) method. To assess the robustness of these findings, sensitivity analyses were conducted employing methods such as the weighted median, MR-Egger, and MR-PRESSO. The summary effect estimates of LDSC, forward MR and reverse MR were combined using meta-analysis for AR from different data resources. Results Our study indicated a significant genetic correlation between genus Sellimonas (Rg = −0.64, p = 3.64 × 10 −5 , Adjust_ P = 3.64 × 10 −5 ) and AR, and a suggestive genetic correlation between seven bacterial taxa and AR. Moreover, the forward MR analysis identified genus Gordonibacter , genus Coprococcus2 , genus LachnospiraceaeUCG010 , genus Methanobrevibacter , and family Victivallaceae as being suggestively associated with an increased risk of AR. The reverse MR analysis indicated that AR was suggestively linked to an increased risk for genus Coprococcus2 and genus RuminococcaceaeUCG011 . Conclusion Our findings indicate a causal relationship between specific gut microbiomes and AR. This enhances our understanding of the gut microbiota’s contribution to the pathophysiology of AR and lays the groundwork for innovative approaches and theoretical models for future prevention and treatment strategies in this patient population.