HT
Hiroyuki Tomita
Author with expertise in Cancer Stem Cells and Tumor Metastasis
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(78% Open Access)
Cited by:
2,469
h-index:
49
/
i10-index:
151
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Reverberation Measurements of the Inner Radius of the Dust Torus in Nearby Seyfert 1 Galaxies

Masahiro Suganuma et al.Feb 22, 2006
The most intense monitoring observations yet made in the optical and near-infrared wave bands were carried out for Seyfert 1 galaxies NGC 5548, NGC 4051, NGC 3227, and NGC 7469 by the MAGNUM telescope, and clear time-delayed responses of the K-band flux variations to the V-band flux variations were found for all of these galaxies. Their H - K color temperatures of 1500-1800 K, estimated from their observed flux variation gradients, support a view that the bulk of the K flux should originate in the thermal radiation of hot dust surrounding the central engine and that the lag time should correspond to light-travel distance between them. Cross-correlation analysis measures their lag times to be 47-53 (NGC 5548), 11-18 (NGC 4051), about 20 (NGC 3227), and 65-87 (NGC 7469) days. The lag times are tightly correlated with the optical luminosities, as expected from dust reverberation (Δt ∝ L0.5), while weakly with the central virial masses, which suggests that the inner radii of the dust tori around active nuclei have one-to-one correspondences with their central luminosities. In the lag time versus central luminosity diagram, the K-band lag times place an upper boundary on the similar lag times of broad emission lines in the literature, which not only supports the unified scheme of AGNs but also implies a physical transition from the BLR out to the dust torus that encircles the BLR. Correlated short-term V-band and X-ray flux variations in NGC 5548 are also found with a delay of 1 or 2 days, indicating the thermal reprocessing of X-ray emission by the central accretion flow.
0

Possibility of Cell Block Specimens from Overnight-Stored Bile for Next-Generation Sequencing of Cholangiocarcinoma

Mitsuru Okuno et al.May 28, 2024
The identification of anticancer therapies using next-generation sequencing (NGS) is necessary for the treatment of cholangiocarcinoma. NGS can be easily performed when cell blocks (CB) are obtained from bile stored overnight. We compared NGS results of paired CB and surgically resected specimens (SRS) from the same cholangiocarcinoma cases. Of the prospectively collected 64 bile CBs from 2018 to 2023, NGS was performed for three cases of cholangiocarcinoma that could be compared with the SRS results. The median numbers of DNA and RNA reads were 95,077,806 [CB] vs. 93,161,788 [SRS] and 22,101,328 [CB] vs. 24,806,180 [SRS], respectively. We evaluated 588 genes and found that almost all genetic alterations were attributed to single-nucleotide variants, insertions/deletions, and multi-nucleotide variants. The coverage rate of variants in SRS by those found in CB was 97.9–99.2%, and the coverage rate of SRS genes by CB genes was 99.6–99.7%. The NGS results of CB fully covered the variants and genetic alterations observed in paired SRS samples. As bile CB is easy to prepare in general hospitals, our results suggest the potential use of bile CB as a novel method for NGS-based evaluation of cholangiocarcinoma.