Abstract We accessed a 50K Illumina SNP genotype dataset from two important goat breeds of the Brazilian semi- arid region to analyze the abundance and length of runs of homozygosity (ROH). This analysis aims to elucidate the importance of adaptation history in the genome of the Brazilian goat populations and to measure genomic inbreeding. Heterozygosity-rich regions (HRR) or genome regions of high genetic variability provide clues about how diversity might be associated with increased fitness, avoiding deleterious homozygous alleles. Overall, 22,872 ROH were identified. The average number of ROH per individual ranged from 74.73 (Anglo-Nubian commercial breed) to 173.85 (Marota landrace). Analysis of the distribution of runs of homozygosity according to their size showed that, for both breeds, the majority of ROH were in the short (<2.0 Mb) category (65.6%). ROH-based inbreeding (F ROH ) revealed low levels in Anglo-Nubian (0.0627) and high levels in Marota (0.1419), likely due to a reduction in effective population size over generations in the Marota landrace. We defined islands of ROH and HRR and identified common regions in the Marota goat, where genes related to various traits such as embryonic development, body growth, lipid homeostasis, and brain functions are located. These results indicate that such regions are associated with many traits and have therefore been under selective pressure in these goat breeds reared for different purposes.

Tuberculosis (TB) is an infectious disease caused by Mycobacterium tuberculosis (Mtb), which remains a significant global health challenge. The emergence of multidrug-resistant (MDR) Mtb strains imposes the development of new therapeutic strategies. This study focuses on the identification and evaluation of potential inhibitors against Mtb H37Ra through a comprehensive screening of an in-house chemolibrary. Subsequently, a promising pyrimidine derivative (LQM495) was identified as promising and then further investigated by experimental and in silico approaches. In this context, computational techniques were used to elucidate the potential molecular target underlying the inhibitory action of LQM495. Then, a consensus reverse docking (CRD) protocol was used to investigate the interactions between this compound and several Mtb targets. Out of 98 Mtb targets investigated, the enhanced intracellular survival (Eis) protein emerged as a target for LQM495. To gain insights into the stability of the LQM495-Eis complex, molecular dynamics (MD) simulations were conducted over a 400 ns trajectory. Further insights into its binding modes within the Eis binding site were obtained through a Quantum mechanics (QM) approach, using density functional theory (DFT), with B3LYP/D3 basis set. These calculations shed light on the electronic properties and reactivity of LQM495. Subsequently, inhibition assays and kinetic studies of the Eis activity were used to investigate the activity of LQM495. Then, an IC50 value of 11.0 ± 1.4 µM was found for LQM495 upon Eis protein. Additionally, its Vmax, Km, and Ki parameters indicated that it is a competitive inhibitor. Lastly, this study presents LQM495 as a promising inhibitor of Mtb Eis protein, which could be further explored for developing novel anti-TB drugs in the future.