JM
Jamie Murkey
Author with expertise in Health Effects of Air Pollution
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
724
h-index:
5
/
i10-index:
5
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis

Michael Wilson et al.Jun 12, 2019
Metagenomic next-generation sequencing (NGS) of cerebrospinal fluid (CSF) has the potential to identify a broad range of pathogens in a single test.In a 1-year, multicenter, prospective study, we investigated the usefulness of metagenomic NGS of CSF for the diagnosis of infectious meningitis and encephalitis in hospitalized patients. All positive tests for pathogens on metagenomic NGS were confirmed by orthogonal laboratory testing. Physician feedback was elicited by teleconferences with a clinical microbial sequencing board and by surveys. Clinical effect was evaluated by retrospective chart review.We enrolled 204 pediatric and adult patients at eight hospitals. Patients were severely ill: 48.5% had been admitted to the intensive care unit, and the 30-day mortality among all study patients was 11.3%. A total of 58 infections of the nervous system were diagnosed in 57 patients (27.9%). Among these 58 infections, metagenomic NGS identified 13 (22%) that were not identified by clinical testing at the source hospital. Among the remaining 45 infections (78%), metagenomic NGS made concurrent diagnoses in 19. Of the 26 infections not identified by metagenomic NGS, 11 were diagnosed by serologic testing only, 7 were diagnosed from tissue samples other than CSF, and 8 were negative on metagenomic NGS owing to low titers of pathogens in CSF. A total of 8 of 13 diagnoses made solely by metagenomic NGS had a likely clinical effect, with 7 of 13 guiding treatment.Routine microbiologic testing is often insufficient to detect all neuroinvasive pathogens. In this study, metagenomic NGS of CSF obtained from patients with meningitis or encephalitis improved diagnosis of neurologic infections and provided actionable information in some cases. (Funded by the National Institutes of Health and others; PDAID ClinicalTrials.gov number, NCT02910037.).
0
Citation724
0
Save
0

Industry of employment and occupational class in relation to cardiovascular health by race/ethnicity, sex/gender, age and income among adults in the USA: a cross-sectional study

Jamie Murkey et al.Jul 1, 2024
Background Racially minoritised groups tend to have poorer cardiovascular health (CVH) than non-Hispanic (NH)-White adults and are generally more likely to work in labourer or support service positions where job strain—associated with cardiovascular disease—is often high. Yet, few studies have included racially/ethnically diverse samples. Methods Using 2004–2018 National Health Interview Survey cross-sectional data, we investigated standardised occupational classifications in relation to ‘ideal’ CVH using a modified ‘ideal’ CVH (mICVH) metric among US adults (n=230 196) by race/ethnicity, sex/gender, age, and income. mICVH was defined as a report of ‘yes’ to the following: never smoked/former smoker; body mass index (≥18.5–25 kg/m 2 ); physical activity (≥150–300 min/week moderate or ≥75–150 min/week vigorous); sleep duration (7–9 hours/night); and no prior diagnosis of dyslipidaemia, hypertension, or diabetes/pre-diabetes. Adjusting for sociodemographic, clinical factors, and health behaviour confounders, we used Poisson regression with robust variance to estimate prevalence ratios (PRs) and 95% CIs of mICVH overall and by race/ethnicity and performed Wald tests for interaction. Results Latinx (53%) and NH-Black (37%) adults were more likely than NH-White adults (29%) to report labourer positions and had the lowest prevalence of mICVH (5.2% (Latinx) and 3.9% (NH-Black)). Labourer versus professional/management occupational class positions were associated with a lower mICVH prevalence among NH-Asian (PR=0.60 (0.46–0.79)), NH-White (PR=0.80 (0.74–0.87)) and NH-Black (PR=0.77 (0.58–1.01)), but with no evidence of an association among Latinx (PR=0.94 (0.78–1.14) adults; p interaction <0.001). Conclusions In conclusion, working in labourer versus professional/management positions was associated with lower mICVH, except among Latinx adults. Given the higher likelihood of labourer occupations and lower prevalence of mICVH among minoritised racial/ethnic groups, social determinants related to occupational class should be considered in future studies of racial and ethnic disparities in CVH.