Current staging methods are inadequate for predicting the outcome of treatment of non–small-cell lung cancer (NSCLC). We developed a five-gene signature that is closely associated with survival of patients with NSCLC.

SummaryWe investigated whether microRNA expression profiles can predict clinical outcome of NSCLC patients. Using real-time RT-PCR, we obtained microRNA expressions in 112 NSCLC patients, which were divided into the training and testing sets. Using Cox regression and risk-score analysis, we identified a five-microRNA signature for the prediction of treatment outcome of NSCLC in the training set. This microRNA signature was validated by the testing set and an independent cohort. Patients with high-risk scores in their microRNA signatures had poor overall and disease-free survivals compared to the low-risk-score patients. This microRNA signature is an independent predictor of the cancer relapse and survival of NSCLC patients.

Schizophrenia is a debilitating psychiatric disorder with approximately 1% lifetime risk globally. Large-scale schizophrenia genetic studies have reported primarily on European ancestry samples, potentially missing important biological insights. Here, we report the largest study to date of East Asian participants (22,778 schizophrenia cases and 35,362 controls), identifying 21 genome-wide-significant associations in 19 genetic loci. Common genetic variants that confer risk for schizophrenia have highly similar effects between East Asian and European ancestries (genetic correlation = 0.98 ± 0.03), indicating that the genetic basis of schizophrenia and its biology are broadly shared across populations. A fixed-effect meta-analysis including individuals from East Asian and European ancestries identified 208 significant associations in 176 genetic loci (53 novel). Trans-ancestry fine-mapping reduced the sets of candidate causal variants in 44 loci. Polygenic risk scores had reduced performance when transferred across ancestries, highlighting the importance of including sufficient samples of major ancestral groups to ensure their generalizability across populations.

Background. The study aimed to evaluate the risk of hepatitis C virus (HCV) infection on hepatic and extrahepatic deaths.

Rare coding variation has historically provided the most direct connections between gene function and disease pathogenesis. By meta-analysing the whole exomes of 24,248 schizophrenia cases and 97,322 controls, we implicate ultra-rare coding variants (URVs) in 10 genes as conferring substantial risk for schizophrenia (odds ratios of 3–50, P < 2.14 × 10−6) and 32 genes at a false discovery rate of <5%. These genes have the greatest expression in central nervous system neurons and have diverse molecular functions that include the formation, structure and function of the synapse. The associations of the NMDA (N-methyl-d-aspartate) receptor subunit GRIN2A and AMPA (α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole propionic acid) receptor subunit GRIA3 provide support for dysfunction of the glutamatergic system as a mechanistic hypothesis in the pathogenesis of schizophrenia. We observe an overlap of rare variant risk among schizophrenia, autism spectrum disorders1, epilepsy and severe neurodevelopmental disorders2, although different mutation types are implicated in some shared genes. Most genes described here, however, are not implicated in neurodevelopment. We demonstrate that genes prioritized from common variant analyses of schizophrenia are enriched in rare variant risk3, suggesting that common and rare genetic risk factors converge at least partially on the same underlying pathogenic biological processes. Even after excluding significantly associated genes, schizophrenia cases still carry a substantial excess of URVs, which indicates that more risk genes await discovery using this approach. Whole-exome sequencing identifies ten risk genes for schizophrenia implicated by rare protein-coding variants, a subset of which overlap with risk genes in other neurodevelopmental disorders.

There is a growing need for multicultural collaboration in child mental health services, training, and research. To facilitate such collaboration, this study tested the 8-syndrome structure of the Child Behavior Checklist (CBCL) in 30 societies. Parents' CBCL ratings of 58,051 6- to 18-year-olds were subjected to confirmatory factor analyses, which were conducted separately for each society. Societies represented Asia; Africa; Australia; the Caribbean; Eastern, Western, Southern, and Northern Europe; the Middle East; and North America. Fit indices strongly supported the correlated 8-syndrome structure in each of 30 societies. The results support use of the syndromes in diverse societies.

This study compared parents' ratings of behavioral and emotional problems on the Child Behavior Checklist (Achenbach, 1991;Achenbach & Rescorla, 2001) for general population samples of children ages 6 to 16 from 31 societies ( N = 55,508). Effect sizes for society ranged from .03 to .14. Effect sizes for gender were ≤ .01, with girls generally scoring higher on Internalizing problems and boys generally scoring higher on Externalizing problems. Effect sizes for age were ≤ .01 and varied across types of problems.Total Problems scores for 19 of 31 societies were within 1 SD of the overall mean of 22.5. Bisociety correlations for mean item scores averaged .74. The findings indicate that parents' reports of children's problems were similar in many ways across highly diverse societies. Nonetheless, effect sizes for society were larger than those for gender and age, indicating the need to take account of multicultural variations in parents' reports of children's problems.

Polygenic risk scores (PRS) have attenuated cross-population predictive performance. As existing genome-wide association studies (GWAS) have been conducted predominantly in individuals of European descent, the limited transferability of PRS reduces their clinical value in non-European populations, and may exacerbate healthcare disparities. Recent efforts to level ancestry imbalance in genomic research have expanded the scale of non-European GWAS, although most remain underpowered. Here, we present a new PRS construction method, PRS-CSx, which improves cross-population polygenic prediction by integrating GWAS summary statistics from multiple populations. PRS-CSx couples genetic effects across populations via a shared continuous shrinkage (CS) prior, enabling more accurate effect size estimation by sharing information between summary statistics and leveraging linkage disequilibrium diversity across discovery samples, while inheriting computational efficiency and robustness from PRS-CS. We show that PRS-CSx outperforms alternative methods across traits with a wide range of genetic architectures, cross-population genetic overlaps and discovery GWAS sample sizes in simulations, and improves the prediction of quantitative traits and schizophrenia risk in non-European populations. PRS-CSx is a polygenic risk score construction method that improves cross-population polygenic prediction by integrating GWAS summary statistics from multiple populations.

A variable (0.2 to 5 MHz) repetition rate femtosecond laser was applied to delineate the role of thermal diffusion and heat accumulation effects in forming low-loss optical waveguides in borosilicate glass across a broad range of laser exposure conditions. For the first time, a smooth transition from diffusion-only transport at 200 kHz repetition rate to strong heat accumulation effects at 0.5 to 2 MHz was observed and shown to drive significant variations in waveguide morphology, with rapidly increasing waveguide diameter that accurately followed a simple thermal diffusion model over all exposure variables tested. Amongst these strong thermal trends, a common exposure window of 200 mW average power and approximately 15-mm/s scan speed was discovered across the range of 200 kHz to 2 MHz repetition rates for minimizing insertion loss despite a 10-fold drop in laser pulse energy. Waveguide morphology and thermal modeling indicate that strong thermal diffusion effects at 200 kHz give way to a weak heat accumulation effect at approximately 1 microJ pulse energy for generating low loss waveguides, while stronger heat accumulation effects above 1-MHz repetition rate offered overall superior guiding. A comprehensive characterization of waveguide properties is presented for laser writing in the thermal diffusion and heat accumulation regimes. The waveguides are shown to be thermally stable up to 800 degrees C and can be written in a convenient 520 microm depth range with low spherical aberration.

Author summary Schizophrenia is a severe psychiatric disorder with a lifetime risk of about 1% world-wide. Most large schizophrenia genetic studies have studied people of primarily European ancestry, potentially missing important biological insights. Here we present a study of East Asian participants (22,778 schizophrenia cases and 35,362 controls), identifying 21 genome-wide significant schizophrenia associations in 19 genetic loci. Over the genome, the common genetic variants that confer risk for schizophrenia have highly similar effects in those of East Asian and European ancestry (r g =0.98), indicating for the first time that the genetic basis of schizophrenia and its biology are broadly shared across these world populations. A fixed-effect meta-analysis including individuals from East Asian and European ancestries revealed 208 genome-wide significant schizophrenia associations in 176 genetic loci (53 novel). Trans-ancestry fine-mapping more precisely isolated schizophrenia causal alleles in 70% of these loci. Despite consistent genetic effects across populations, polygenic risk models trained in one population have reduced performance in the other, highlighting the importance of including all major ancestral groups with sufficient sample size to ensure the findings have maximum relevance for all populations.