Hydrothermal vents and methane seeps are extreme deep-sea ecosystems that support dense populations of specialized macro-benthos such as mussels. But the lack of genome information hinders the understanding of the adaptation of these animals to such inhospitable environments. Here we report the genomes of a deep-sea vent/seep mussel (Bathymodiolus platifrons) and a shallow-water mussel (Modiolus philippinarum). Phylogenetic analysis shows that these mussel species diverged approximately 110.4 million years ago. Many gene families, especially those for stabilizing protein structures and removing toxic substances from cells, are highly expanded in B. platifrons, indicating adaptation to extreme environmental conditions. The innate immune system of B. platifrons is considerably more complex than that of other lophotrochozoan species, including M. philippinarum, with substantial expansion and high expression levels of gene families that are related to immune recognition, endocytosis and caspase-mediated apoptosis in the gill, revealing presumed genetic adaptation of the deep-sea mussel to the presence of its chemoautotrophic endosymbionts. A follow-up metaproteomic analysis of the gill of B. platifrons shows methanotrophy, assimilatory sulfate reduction and ammonia metabolic pathways in the symbionts, providing energy and nutrients, which allow the host to thrive. Our study of the genomic composition allowing symbiosis in extremophile molluscs gives wider insights into the mechanisms of symbiosis in other organisms such as deep-sea tubeworms and giant clams.

Confrontation between predator and prey, driven by the innate survival instincts in both predator and prey, constitute the most significant form of competition in evolution. Yet, understanding how survival skills can benefit from such confrontations remains limited, despite its critical importance for animal survival. We have developed an interactive platform to investigate confrontations between a hungry mouse and an escaping bait. This robotic bait is controlled magnetically through a closed-loop system to continually evade the approaching mouse. Meanwhile, the mouse must capture the escaping bait to receive a food reward. Through analysis of angles, speeds, and other kinematic parameters of both the mouse and the bait, we observed that confrontation experiences can notably enhance mice performance. Compared with novice mice, veteran mice enhanced predation efficiency primarily by optimizing the pursuit phase, significantly reducing time costs, mainly by minimizing pauses in movement. Additionally, experience strengthened the navigation strategies used by mice to better track evading bait. Finally, we validated the impact of empirically induced changes in speed distribution and pursuit methods on predation efficiency through modeling of the pursuit phase. In conclusion, this study reveals that confrontation experience could improve pursuit strategy in mice by altering the speed control and pursuit method, providing new insights into these crucial behavioral interactions in nature.