YZ
Yan Zhang
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
10
(30% Open Access)
Cited by:
801
h-index:
28
/
i10-index:
76
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Assessment of Polygenic Architecture and Risk Prediction based on Common Variants Across Fourteen Cancers

Yan Zhang et al.Aug 9, 2019
We analyzed summary-level data from genome-wide association studies (GWAS) of European ancestry across fourteen cancer sites to estimate the number of common susceptibility variants (polygenicity) contributing to risk, as well as the distribution of their associated effect sizes. All cancers evaluated showed polygenicity, involving at a minimum thousands of independent susceptibility variants. For some malignancies, particularly chronic lymphoid leukemia (CLL) and testicular cancer, susceptibility variants have a larger proportion of variants with larger effect sizes than those for other cancers. In contrast, most variants for lung and breast cancers have very small associated effect sizes. We estimate a wide range of GWAS sample sizes for different cancer sites required to explain 80% of GWAS heritability, varying from 60,000 cases for CLL to over 1,000,000 cases for lung cancer. The maximum relative risk achievable for subjects at the 99th risk percentile of underlying polygenic risk-scores, compared to average risk, ranges from 12 for testicular to 2.5 for ovarian cancer. We show that polygenic risk scores have substantial potential for risk stratification for relatively common cancers such as breast, prostate and colon, but limited potential for other cancer sites because of modest heritability and lower disease incidence.
0

Identification of Circulating Proteins Associated With Blood Pressure

Siqi Xu et al.Dec 3, 2024
BACKGROUND: Circulating proteins in blood are involved in various physiological processes, but their contributions to blood pressure regulation remain partially understood. In traditional observational studies, identifying circulating proteins causally associated with blood pressure is challenging because of potentially unmeasured confounding and possible reverse causality. METHODS: Two-sample Mendelian randomization analyses were conducted to estimate the causal effects of 2270 circulating proteins (data sourced from 8 genome-wide association studies) on diastolic blood pressure, systolic blood pressure, and pulse pressure. Colocalization analyses were then used to investigate whether the circulating proteins and blood pressure traits shared causal genetic variants. To further verify the findings, we subsequently performed Steiger filtering analyses, annotation of protein-altering variants, assessment of overlap between protein quantitative trait loci and expression quantitative trait loci, protein-protein interaction and functional enrichment analyses, and drug target evaluation. To provide more potential biomarkers, we further evaluated the epidemiological associations of 2923 circulating proteins with blood pressure and hypertension by cross-sectional and longitudinal analyses using individual data in the UK Biobank. RESULTS: Mendelian randomization and colocalization analyses identified 121 circulating proteins with putative causal effects on at least 1 blood pressure trait. Many of the identified proteins are enriched in the pathways relevant to blood pressure regulation, and a majority of these proteins are either known drug targets or druggable candidates. CONCLUSIONS: This study has uncovered numerous circulating proteins potentially causally associated with blood pressure, providing insights into the regulatory mechanisms of blood pressure and potential therapeutic targets to facilitate blood pressure management.
0

Different Internal Fixation Methods for Sanders Type II and III Calcaneal Fractures: A 5‐Year Retrospective Study and Finite Element Analysis

Dewei Kong et al.Jan 18, 2025
Soft tissue defects and postoperative wound healing complications related to calcaneus fractures may result in significant morbidity. The aim of this study was to investigate whether percutaneous minimally invasive screw internal fixation (PMISIF) can change this situation in the treatment of calcaneal fractures, and aimed to explore the mechanical effects of different internal fixation methods on Sanders type III calcaneal fractures through finite element analysis. This retrospective analysis focused on 83 patients with Sanders II and III calcaneal fractures from March 2017 to March 2022. Among them, 32 patients underwent PMISIF, 24 patients underwent tarsal sinus incision plate internal fixation (TSIPIF), and 27 patients underwent extended lateral incision plate internal fixation (ELIPIF). The present study aimed to compare various parameters, including the perioperative hospital stay, intraoperative blood loss, operative time, postoperative drainage volume, incidence of postoperative wound complications, and Gissane angle and Bohler angle data before surgery, after surgery, and at the last follow-up, among the three treatment groups. Additionally, three different finite element models were created to simulate Sanders III calcaneal fractures treated with PMISIF, TSIPIF, and ELIPIF. The models were subjected to longitudinal stresses of 350 and 700 N, and the displacement and stress distribution were analyzed to compare the stability of each model. Compared with ELIPIF and TSIPIF, PMISIF has several advantages, including shorter operative times, smaller incisions, shorter hospital stays, and lower incidences of postoperative complications. At the 12-month time point after the operation, the percentages of patients with excellent and good American Orthopedic Foot and Ankle Society (AOFAS) functional scores were 96.9%, 91.7%, and 96.2%, respectively, for the three methods, demonstrating similar outcomes. Intraoperative blood loss in the PMISIF group was comparable to that in the TSIPIF group and lower than that in the ELIPIF group. There were no significant differences in the Gissane or Bohler angles among the three groups before or after the operation. However, the differences in the Gissane and Bohler angles after the operation within each group were statistically significant compared with those before the operation. Finite element analysis revealed that stress in all three internal fixation models was primarily concentrated on the subtalar articular surface, whereas displacement was mainly observed on the medial side of the subtalar articular surface. The peak stress and displacement of bone fragments and implants in the PMISIF model were lower than those in both the TSIPIF and ELIPIF models. PMISIF can achieve excellent and good rates comparable to those of TSIPIF and ELIPIF. Additionally, this approach offers the advantages of reduced operative trauma, a lower incidence of complications, and shorter preoperative preparation and hospitalization times. Furthermore, this approach can achieve a similar level of biomechanical stability.