To estimate the minimal gene set required to sustain bacterial life in nutritious conditions, we carried out a systematic inactivation of Bacillus subtilis genes. Among ≈4,100 genes of the organism, only 192 were shown to be indispensable by this or previous work. Another 79 genes were predicted to be essential. The vast majority of essential genes were categorized in relatively few domains of cell metabolism, with about half involved in information processing, one-fifth involved in the synthesis of cell envelope and the determination of cell shape and division, and one-tenth related to cell energetics. Only 4% of essential genes encode unknown functions. Most essential genes are present throughout a wide range of Bacteria, and almost 70% can also be found in Archaea and Eucarya. However, essential genes related to cell envelope, shape, division, and respiration tend to be lost from bacteria with small genomes. Unexpectedly, most genes involved in the Embden–Meyerhof–Parnas pathway are essential. Identification of unknown and unexpected essential genes opens research avenues to better understanding of processes that sustain bacterial life.

Summary Salt tolerance quantitative trait loci analysis of rice has revealed that the SKC 1 locus, which is involved in a higher K + /Na + ratio in shoots, corresponds to the Os HKT 1;5 gene encoding a Na + ‐selective transporter. However, physiological roles of Os HKT 1;5 in rice exposed to salt stress remain elusive, and no Os HKT 1;5 gene disruption mutants have been characterized to date. In this study, we dissected two independent T‐ DNA insertional Os HKT 1;5 mutants. Measurements of ion contents in tissues and 22 Na + tracer imaging experiments showed that loss‐of‐function of Os HKT 1;5 in salt‐stressed rice roots triggers massive Na + accumulation in shoots. Salt stress‐induced increases in the Os HKT 1;5 transcript were observed in roots and basal stems, including basal nodes. Immuno‐staining using an anti‐Os HKT 1;5 peptide antibody indicated that Os HKT 1;5 is localized in cells adjacent to the xylem in roots. Additionally, direct introduction of 22 Na + tracer to leaf sheaths also demonstrated the involvement of Os HKT 1;5 in xylem Na + unloading in leaf sheaths. Furthermore, Os HKT 1;5 was indicated to be present in the plasma membrane and found to localize also in the phloem of diffuse vascular bundles in basal nodes. Together with the characteristic 22 Na + allocation in the blade of the developing immature leaf in the mutants, these results suggest a novel function of Os HKT 1;5 in mediating Na + exclusion in the phloem to prevent Na + transfer to young leaf blades. Our findings further demonstrate that the function of Os HKT 1;5 is crucial over growth stages of rice, including the protection of the next generation seeds as well as of vital leaf blades under salt stress.

Abstract Cisplatin is an effective chemotherapeutic agent widely used for the treatment of various solid tumors. However, cisplatin has an important limitation in its use; currently, there is no method to ameliorate cisplatin-induced acute kidney injury (AKI). Thrombomodulin (TM) is well known not only for its role as a cofactor in the clinically important natural anticoagulation pathway but also for its anti-inflammatory properties. Here, we investigated the effects of TM in cisplatin-induced AKI. In mice intraperitoneally injected with 15 mg/kg cisplatin, TM (10 mg/kg) or PBS was administered intravenously at 24 h after cisplatin injection. TM significantly attenuated cisplatin-induced nephrotoxicity with the suppressed elevation of blood urea nitrogen and serum creatinine, and reduced histological damages. Actually, TM treatment significantly alleviated oxidative stress-induced apoptosis by reducing reactive oxygen species (ROS) levels in cisplatin-treated renal proximal tubular epithelial cells (RPTECs) in vitro. Furthermore, TM clarified cisplatin-induced apoptosis by reducing caspase-3 levels. In addition, TM attenuated the endoplasmic reticulum (ER) stress signaling pathway in both renal tissues and RPTECs to protect the kidneys from cisplatin-induced AKI. These findings suggest that TM is a potential protectant against cisplatin-induced nephrotoxicity through suppressing ROS generation and ER stress in response to cisplatin.

Developing F

It has been reported that the good correlation in sensitivity and resolution between EUV exposure and EB exposure because of the similar mechanism of the photochemical-reaction in photoresists during exposure. However, in the early stages of EUV resist development, there are problems on the points of the cost and time-consuming to evaluate all EUV resist materials by EB exposure. Therefore, we investigated the possibility of using KrF exposure as the initial screening of EUV resists. In former report, we evaluated the correlation of sensitivity between KrF and EUV exposure, KrF and EB exposure, EB and EUV exposure respectively by using various type of resists. Then we could find there is some correlation between each exposure. In this report, we formulated some types of KrF resist and investigated whether there is a correlation of sensitivity between KrF and EUV exposures.

For the realization of further miniaturization at scale of 10 nm and below in semiconductor devices, it is essential to understand the dissolution kinetics of resist films in developer. In this study, the change in molecular weight and dissolution kinetics induced by ionizing radiation in poly(methyl methacrylate) (PMMA) resist films were studied using a quartz crystal microbalance method and gel permeation chromatography. The weight-averaged molecular weight Mw was changed from 50000 to 996000. Three types of developers (o-xylene and 1:3 and 1:7 mixing solutions of methyl isobutyl ketone and isopropanol) were examined. The kinetics during the development of PMMA films was classified into three patterns. In low Mw region, only dissolution was observed. In middle Mw region, both swelling and dissolution were observed. In high Mw region, only swelling was observed. The boundaries between regions were dependent of the developer and independent of the initial molecular weight of PMMA.