YS
Yanfeng Sun
Author with expertise in Avian Vocal Communication and Evolutionary Implications
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(60% Open Access)
Cited by:
496
h-index:
2
/
i10-index:
1
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genome sequence of the model medicinal mushroom Ganoderma lucidum

Shilin Chen et al.Jun 26, 2012
Ganoderma lucidum is a widely used medicinal macrofungus in traditional Chinese medicine that creates a diverse set of bioactive compounds. Here we report its 43.3-Mb genome, encoding 16,113 predicted genes, obtained using next-generation sequencing and optical mapping approaches. The sequence analysis reveals an impressive array of genes encoding cytochrome P450s (CYPs), transporters and regulatory proteins that cooperate in secondary metabolism. The genome also encodes one of the richest sets of wood degradation enzymes among all of the sequenced basidiomycetes. In all, 24 physical CYP gene clusters are identified. Moreover, 78 CYP genes are coexpressed with lanosterol synthase, and 16 of these show high similarity to fungal CYPs that specifically hydroxylate testosterone, suggesting their possible roles in triterpenoid biosynthesis. The elucidation of the G. lucidum genome makes this organism a potential model system for the study of secondary metabolic pathways and their regulation in medicinal fungi. Ganoderma lucidumis a macrofungus in traditional Chinese medicine known to produce different bioactive compounds. In this study, the genome ofG. lucidumis sequenced, making this organism a potential model system for future studies of secondary metabolic pathways and their regulation in medicinal fungi.
0
Citation496
0
Save
4

Complex rules of vocal sequencing in marmoset monkeys

Junfeng Huang et al.Aug 4, 2022
ABSTRACT Vocal sequencing is a key element in human speech. Songbirds have been widely studied as an animal model to investigate neural mechanisms of vocal sequencing, due to the complex syntax of syllable sequences in their songs. However, songbirds are phylogenetically distant from humans. So far, there is little evidence of complex syntactic vocalizations in non-human primates. Here, we analyze phee sounds produced by 160 marmoset monkeys either in isolation or during vocal turn-taking and reveal complex sequencing rules at multiple levels. First, phee syllables exhibited consistent interval patterns among different marmosets, allowing categorization of calls with single and closely spaced 2-4 syllables into 4 grades. Second, the ordering of sequential calls followed distinct probabilistic rules that preferring repetition of the same-grade call and then transition between calls of adjacent grades, but not skip-grade transition. Moreover, inter-call intervals depended on the transition direction. Third, specific AB n A call patterns were discovered to be prominent in long call sequences, and their occurrence exhibited a power-law decrease with increasing “n”, reflecting a long-range sequencing rule in the dependence of later calls on the pattern of earlier calls. Finally, syllable and call intervals as well as call compositions were significantly modified during vocal turn-taking. This complex syntax of vocal sequences in marmosets offers opportunities for understanding the evolutionary origin and neural mechanisms of grammatical complexity in human language.
0

Minute-Cadence Observations of the LAMOST Fields with the TMTS: IV—Catalog of Cataclysmic Variables from the First 3-yr Survey

Qichun Liu et al.Aug 23, 2024
The Tsinghua University–Ma Huateng Telescopes for Survey (TMTS) started to monitor the LAMOST plates in 2020, leading to the discovery of numerous short-period eclipsing binaries, peculiar pulsators, flare stars, and other variable objects. Here, we present the uninterrupted light curves for a sample of 64 cataclysmic variables (CVs) observed/discovered using the TMTS during its first three-year observations, and we introduce new CVs and new light-variation periods (from known CVs) revealed through the TMTS observations. Thanks to the high-cadence observations of TMTS, diverse light variations, including superhumps, quasi-periodic oscillations, large-amplitude orbital modulations, and rotational modulations, are able to be detected in our CV samples, providing key observational clues for understanding the fast-developing physical processes in various CVs. All of these short-timescale light-curve features help further classify the subtypes of CV systems. We highlight the light-curve features observed in our CV sample and discuss further implications of minute-cadence light curves for CV identifications and classifications. Moreover, we examine the Hα emission lines in the spectra from our nonmagnetic CV samples (i.e., dwarf novae and nova-like subclasses) and find that the distribution of Hα emission strength shows significant differences between the sources with orbital periods above and below the period gap, which agrees with the trend seen from the SDSS nonmagnetic CV sample.
0

V-shaped effect of primary and secondary airflow momentum ratio on performance of a 660 MW tangentially fired lignite boiler: Identification and verification

Zixiang Li et al.May 31, 2024
To explore how the primary and secondary air ratios affect the overall performance of lignite-fired power generation boilers, a 660 MW wall-tangentially fired lignite boiler was chosen as research subject. 17 combustion scenarios were designed and then numerically simulated through a validated model, and the in-furnace coal combustion behavior, heat transfer process, and NOx conversion characteristics under various conditions were analyzed in detail. Results show that, except for the monotonous increase in NOx emission, the overall boiler performance follows a V-shaped trend with the continuous increase in primary air ratio (PAR). Initially, as PAR is slightly increased, the in-furnace combustion temperature, heat transfer intensity and coal utilization rate notably decrease, followed by a subsequent increase in these parameters as PAR is significantly increased. The separated over fire air (SOFA) ratio doesn't alter this V-shaped pattern; however, a higher SOFA ratio does reduce the critical PAR at which the overall boiler performance is most compromised. This is attributed to changes in the momentum ratio between primary and secondary airflow caused by varying PAR. Boiler performance deteriorate significantly when their momentum ratios are nearly equal, and a higher SOFA ratio makes it easier. These observations are confirmed under different thermal load conditions, where the close proximity of primary and secondary air momentum is avoided by reducing SOFA ratio. Based on these findings, a substantial increase in PAR should be avoided in practice, if necessary, lowering the SOFA ratio helps mitigate significant deterioration in boiler performance.