Addresses a class of statistical models that generalizes classical linear models-extending them to include many other models useful in statistical analysis. Incorporates numerous exercises, both theoretical and data-analytic Discusses quasi-likelihood functions and estimating equations, models for dispersion effect, components of dispersion, and conditional likelihoods Holds particular interest for statisticians in medicine, biology, agriculture, social science, and engineering

SUMMARY Nonproportional hazards can often be expressed by extending the Cox model to include time varying coefficients; e.g., for a single covariate, the hazard function for subject i is modelled as exp { fl(t)Zi(t)}. A common example is a treatment effect that decreases with time. We show that the function /3(t) can be directly visualized by smoothing an appropriate residual plot. Also, many tests of proportional hazards, including those of Cox (1972), Gill & Schumacher (1987), Harrell (1986), Lin (1991), Moreau, O'Quigley & Mesbah (1985), Nagelkerke, Oosting & Hart (1984), O'Quigley & Pessione (1989), Schoenfeld (1980) and Wei (1984) are related to time-weighted score tests of the proportional hazards hypothesis, and can be visualized as a weighted least-squares line fitted to the residual plot.

Patients with nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) and advanced liver fibrosis are at the highest risk for progressing to end-stage liver disease. We constructed and validated a scoring system consisting of routinely measured and readily available clinical and laboratory data to separate NAFLD patients with and without advanced fibrosis. A total of 733 patients with NAFLD confirmed by liver biopsy were divided into 2 groups to construct (n = 480) and validate (n = 253) a scoring system. Routine demographic, clinical, and laboratory variables were analyzed by multivariate modeling to predict presence or absence of advanced fibrosis. Age, hyperglycemia, body mass index, platelet count, albumin, and AST/ALT ratio were independent indicators of advanced liver fibrosis. A scoring system with these 6 variables had an area under the receiver operating characteristic curve of 0.88 and 0.82 in the estimation and validation groups, respectively. By applying the low cutoff score (−1.455), advanced fibrosis could be excluded with high accuracy (negative predictive value of 93% and 88% in the estimation and validation groups, respectively). By applying the high cutoff score (0.676), the presence of advanced fibrosis could be diagnosed with high accuracy (positive predictive value of 90% and 82% in the estimation and validation groups, respectively). By applying this model, a liver biopsy would have been avoided in 549 (75%) of the 733 patients, with correct prediction in 496 (90%). Conclusion: a simple scoring system accurately separates patients with NAFLD with and without advanced fibrosis, rendering liver biopsy for identification of advanced fibrosis unnecessary in a substantial proportion of patients. (HEPATOLOGY 2007;45:846–854.)

Under the current liver-transplantation policy, donor organs are offered to patients with the highest risk of death.

The prevalence of monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS), a premalignant plasma-cell disorder, among persons 50 years of age or older has not been accurately determined. We used sensitive laboratory techniques to ascertain the prevalence of MGUS in a large population in a well-defined geographic area.

Graphical methods based on the analysis of residuals are considered for the setting of the highly-used Cox (1972) regression model and for the Andersen-Gill (1982) generalization of that model. We start with a class of martingale-based residuals as proposed by Barlow & Prentice (1988). These residuals and/or their transforms are useful for investigating the functional form of a covariate, the proportional hazards assumption, the leverage of each subject upon the estimates of β, and the lack of model fit to a given subject.

Purpose Primary systemic amyloidosis (AL) is a multisystemic disorder resulting from an underlying plasma cell dyscrasia. There is no formal staging system for AL, making comparisons between studies and treatment centers difficult. Our group previously identified elevated serum cardiac troponin T (cTnT) as the most powerful predictor of overall survival. Others have reported that N-terminal pro-brain natriuretic peptide (NT-proBNP) is a valuable prognostic marker. We sought to develop a staging system for patients with AL. Patients and Methods Two hundred forty-two patients with newly diagnosed AL who were seen at the Mayo Clinic between April 1979 and November 2000, and who had echocardiograms and stored serum samples at presentation were eligible for this retrospective review. NT-proBNP measurements were performed on 242 patients in whom cTnT and cardiac troponin I (cTnI) had been previously run. Two prognostic models were designed using threshold values of NT-proBNP and either cTnT or cTnI (NT-proBNP < 332 ng/L, cTnT < 0.035 μg/L, and cTnI < 0.1 μg/L). Depending on whether NT-proBNP and troponin levels were both low, were high for only one level, or were both high, patients were classified as stage I, II, or III, respectively. Results Using the cTnT+NT-proBNP model 33%, 30%, and 37% of patients were stages I, II, and III, respectively, with median survivals of 26.4, 10.5, and 3.5 months, respectively. The alternate cTnI+NT-proBNP model predicted median survivals of 27.2, 11.1, and 4.1 months, respectively. Conclusion Stratification of AL patients into three stages is possible with two readily available and reproducible tests setting the stage for more consistent and reliable cross comparisons of therapeutic outcomes.

Smoldering (asymptomatic) multiple myeloma is an asymptomatic plasma-cell proliferative disorder associated with a high risk of progression to symptomatic multiple myeloma or amyloidosis. Prognostic factors for the progression and outcome of this disease are unclear.

The POEMS syndrome (coined to refer to polyneuropathy, organomegaly, endocrinopathy, M protein, and skin changes) remains poorly understood. Ambiguity exists over the features necessary to establish the diagnosis, treatment efficacy, and prognosis. We identified 99 patients with POEMS syndrome. Minimal criteria were a sensorimotor peripheral neuropathy and evidence of a monoclonal plasmaproliferative disorder. To distinguish POEMS from neuropathy associated with monoclonal gammopathy of undetermined significance, additional criteria were included: a bone lesion, Castleman disease, organomegaly (or lymphadenopathy), endocrinopathy, edema (peripheral edema, ascites, or effusions), and skin changes. The median age at presentation was 51 years; 63% were men. Median survival was 165 months. With the exception of fingernail clubbing (P = .03) and extravascular volume overload (P = .04), no presenting feature, including the number of presenting features, was predictive of survival. Response to therapy (P < .001) was predictive of survival. Pulmonary hypertension, renal failure, thrombotic events, and congestive heart failure were observed and appear to be part of the syndrome. In 18 patients (18%), new disease manifestations developed over time. More than 50% of patients had a response to radiation, and 22% to 50% had responses to prednisone and a combination of melphalan and prednisone, respectively. We conclude that the median survival of patients with POEMS syndrome is 165 months, independent of the number of syndrome features, bone lesions, or plasma cells at diagnosis. Additional features of the syndrome often develop, but the complications of classic multiple myeloma rarely develop.