UA
Usman Arif
Author with expertise in Phytochemical and Pharmacological Studies of Hibiscus sabdariffa L.
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
6
/
i10-index:
3
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Virtual screening assisted identification of a phytocompound as potent inhibitor against Candida lusitaniae; an in-silico study

Rimsha Timotheous et al.Jan 6, 2025
Candida lusitaniae is one of the fungal species which causes serious health illnesses including peritonitis, vaginitis and fungemia, among others. Several antifungal drugs have been designed to tackle its infections but their efficacy is still questionable due to their associated side effects. Hence, there is a need to design those drugs which possess comparatively higher degree of therapeutic potential. Phytochemicals were selected in this regard because these compounds which satisfactorily follow this criteria as, their therapeutic index is comparatively larger than the synthetic drugs. Considering this fact, different phyto-compounds were opted in this research work to estimate their therapeutic efficiency against the secreted aspartyl proteinase (SAP) of C. lusitaniae since, it assists this pathogen in developing the infections. Initially, the structure of SAP was modelled for subsequent docking analysis. The results of molecular docking suggested that three compounds, opelconazole, daidzin 4'0-glucuronide and naringin exhibited better docking scores. Afterwards, ADME analysis of all these four compounds was performed to comprehend their drug-likeness attributes. The results of ADME analysis revealed that only the daidzin 4'0-glucuronide followed all the required parameters. Lastly, MD simulations were conducted in which top three compounds in context of docking scores along three approved anti-fungal drugs in complex with SAP were incorporated for the comparative analysis. The overall results of MD simulations suggested that daidzin 4'0-glucuronide exhibited comparatively better results. This outcome indicated that this particular compound not only showed better binding affinity with SAP during docking analysis and fulfilled all of the drug-likeness moieties among other compounds but also, displayed better simulation results, leading to a conclusion that daidzin 4'0-glucuronide could be a potential drug candidate against C. lusitaniae. However, its real-time efficacy could only be validated in clinical settings.
0

Over expression of modified Isomaltulose Synthase Gene II (ImSyGII) under single and double promoters drive unprecedented sugar contents in sugarcane

Mudassar Awan et al.Nov 19, 2024
Sugarcane has been grown all around the world to meet sugar demands for industrial sector. The current sugar recovery percentage in sugarcane cultivars is dismally low which demands scientific efforts for improvements. Multiple approaches were adopted to enhance sugar contents in commercial sugarcane plants in contrast to conventional plant breeding methods. The exploitation of biotechnological methods and exploration of isomaltulose synthetic genes presented a promising solution to increase the existing low level of sugar recovery percentage in Saccharum officinarum L. Isomaltulose synthase gene II was employed and integrated into plant expression vector driven under the leaf and stem specific promoters terminated by nopaline synthase gene in a cloning strategy shown in the present study. Three gene constructs were developed in various combinations driven under promoters Zea mays ubiquitin and Cestrum Yellow Leaf Curl virus in the single and double combined stacked system. The transformation was executed in multiple formats with single transformed events, double promoter transformation events and triple construct stacked promoters in sugarcane induced calli via the particle gene gun. The transformation of ImSyGII in sugarcane genotype HSF-240 was confirmed by molecular gene analysis while expression quantification was determined through Real Time PCR. Furthermore, HPLC was also done to harvest the increased amounts of Isomaltulose in transgenic sugarcane juice. The present work upheld the enhanced ImSyGII expression in leaves owing to the exploitation of ubiquitin, while the Cestrum Yellow Leaf Curl virus promoter enhanced gene expression in sugarcane stems. The employment of three gene constructs collectively produced elite sugar lines producing more than 78% enhancements in whole sugar recovery percentage. The mature internode proved highly efficient and receptive regarding the production of isomaltulose. Quantifications and sugar contents evaluations upheld an increased Brix ratio of transgenic sugarcane lines than control lines.