NC
Nayantara Coelho‐Prabhu
Author with expertise in Genetics and Treatment of Inflammatory Bowel Disease
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(56% Open Access)
Cited by:
591
h-index:
18
/
i10-index:
31
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Undetected Dysplasia at Colectomy in Patients With Inflammatory Bowel Diseases. What Are We Missing?

Erica Centorrino et al.Nov 28, 2024
Abstract Background and Aims Patients with inflammatory bowel disease (IBD) have a higher risk of developing colorectal dysplasia and colorectal cancer compared to the general population. Although the use of surveillance protocols has improved the ability to detect dysplasia, some lesions are still missed at colonoscopy. This study aims to determine the rate of dysplastic lesions that are undetected at colonoscopies in IBD patients undergoing colectomy and to identify factors associated with missed dysplasia. Methods Patients who had received a total or subtotal colectomy at Mayo Clinic (Rochester, Minnesota), between January 2003 and December 2022, and had a complete colonoscopy within 5 years before surgery were retrospectively enrolled. Data abstracted included demographic information, disease-related data, colonoscopy and pathology reports, and surgery pathology reports. Colonoscopy and surgery findings were compared, and patients were divided into 3 groups: no dysplasia at both, detected dysplasia, and undetected dysplasia. Results Among 1320 IBD patients undergoing colectomy, 5.4% had undetected dysplastic lesions identified only at surgery. Factors independently associated with dysplasia detection were endoscopic remission or mild endoscopic disease activity (odds ratio [OR], 2.326; P = .0081; 95% CI, 1.246-4.342), prior dysplasia detection (OR, 1.876; P = .0491; 95% CI, 1.002-3.511), colonoscopy performed for surveillance (OR, 2.380; P = .0048; 95% CI, 1.302-4.350), and longer disease duration at surgery (OR, 1.039; P = .0085; 95% CI, 1.010-1.070). Conclusions Clinicians should be aware of the risk of missing dysplastic lesions, especially when endoscopic disease activity is moderate/severe, and not only for longstanding disease. Efforts should be made to obtain endoscopic remission to make the “invisible” visible.
0

S8 Cancer-Predisposing Germline Variants in Inflammatory Bowel Disease: A Three-Cohort Comparison of Patients With and Without Primary Sclerosing Cholangitis

Gerardo Calderón et al.Dec 1, 2024
Background: Primary sclerosing cholangitis (PSC) is a significant risk factor for developing colorectal cancer (CRC) in patients with inflammatory bowel disease (IBD). While there are known genetic predispositions to both IBD and CRC individually, the hereditary predisposition to CRC in IBD patients remains underexplored. This study aims to assess the risk posed by germline variants (GVs) in cancer-predisposing genes in IBD patients, including those with IBD-PSC. Methods: We analyzed 3 cohorts of IBD patients (with and without PSC) who underwent whole exome sequencing (WES) at the Mayo Clinic. Patients were initially stratified based on their history of dysplasia, which included CRC, high-grade dysplasia (HGD), low-grade dysplasia (LGD), indefinite for dysplasia (IFD), and no dysplasia. Subjects with multiple types of dysplasia were categorized by the most severe type (CRC/HGD > LGD > IFD). Subsequently, germline variant identification was performed on 96 cancer-predisposing genes from the Mayo Clinic panel in cases (patients with CRC or HGD) and controls (patients without dysplasia). A 2:1 matching was conducted within each cohort. Controls were matched to cases based on age, where case age was defined as the age at dysplasia diagnosis (CRC or HGD), and control age was defined as the age at the last colonoscopy or colectomy (if performed for non-dysplasia indications). Controls with a greater age match than cases were prioritized for selection. Candidate variants were selected based on the following criteria: mean mapping quality ≥30, minimum read depth ≥10, supporting reads ≥5, variant allele frequency (VAF) ≥0.20, and minor allele frequency (MAF) < 0.0001. Results: For the IBD-no PSC cohort, 55 cases were matched with 110 controls, with a mean match age of 59±16 years in cases and 66±13 years in controls (p=0.05). In the IBD-PSC cohort, 72 cases were matched with 150 controls, with a mean match age of 52±15 years in cases and 56±15 years in controls (p=0.004). Analysis of cancer-related genes identified 33 pathogenic/likely pathogenic (P/LP) germline variants in 16 genes. The most commonly affected genes in PSC cases included CHECK2 (3 variants), MC1R (3 variants), BARD1 (2 variants), DIS3L2, LZTR1, NTHL1, MSH6, POT1, and RECQL4. In IBD-no PSC cases, common genes included MC1R, MET, MSH6, NF1, NTHL1, PALB2, and TMEM127 (1 variant each). IBD-PSC and IBD-no PSC cases had more autosomal dominant (AD) variants (12.8% and 12.7%, respectively) than controls (3.9% and 3.6%, respectively). Additionally, rare deleterious variants (RDVs) were observed in 31.9% of IBD-PSC and 27.3% of IBD-no PSC cases, compared to 30% and 21.8% of controls, respectively. Conclusions: Our study demonstrates that germline variants in cancer-predisposing genes are more prevalent in IBD cases, including those with PSC, compared to controls. These findings suggest a potential hereditary predisposition to colorectal cancer in IBD, warranting further investigation into personalized cancer surveillance strategies based on genetic risk.
0

S15 Outcomes of Use of Advanced Therapies in the Management of Inflammatory Bowel Disease Post-liver Transplant

Siri Urquhart et al.Dec 1, 2024
Background: Patients with inflammatory bowel disease (IBD) and primary sclerosing cholangitis (PSC) may require liver transplantation for management of underlying liver disease. There is overlap in medical therapies used for immunosuppression following liver transplantation and IBD; however, patients often require additional IBD-directed therapies for disease management. Anti-tumor necrosis factor (TNF) agents have been the mainstay of treatment for moderate to severe IBD. However, there is limited data on the effectiveness of other advanced therapies such as anti-integrin and anti-interleukin agents, and Janus kinase inhibitors. As there is limited published data on the management of IBD in the post-liver transplant period, we aimed to describe the outcomes of advanced IBD therapies in the post-transplant setting in patients with PSC and IBD. Methods: Using large prospective registries of patients with PSC with and without IBD at our institution, 526 patients were identified with PSC and IBD who underwent liver transplantation. Relevant demographic and clinical data were abstracted. Results: Two hundred forty-seven patients met inclusion criteria (32.4% female) after excluding patients with prior colectomy predating liver transplant, absence of colonoscopy reports available for review, and/or death within a year of liver transplant. Most had ulcerative colitis (UC) (89.5%) with median age at UC diagnosis of 36 years. Of these, most had extensive colitis (96.4%). IBD was more often diagnosed prior to liver transplant (82.4%). The most common IBD-directed therapy prior to liver transplant was 5-aminosalicylate (5-ASA) agents (56.7%). Only 19 (7.7%) patients were on anti-TNF therapy prior to transplant. Fourteen (5.7%) patients were on >3 or more IBD-related medical therapies prior to transplant. Median age at liver transplantation was 49 years in those with UC. Sixty-six patients with UC (29.9%) had a history of liver allograft-related rejection, 16 (7.2%) required a second liver transplant, and 31 (14%) had recurrent PSC. The most common immunosuppressant agent used following liver transplant was tacrolimus (65.6%). Following liver transplantation, most patients were continued on 5-ASA agents (74.9%) with the addition of vedolizumab in 30 (12.1%) followed by infliximab in 21 (8.5%), adalimumab in 11 (4.5%), ustekinumab in 8 (3.2%), upadacitinib in 4 (1.6%), risankizumab in 2 (0.8%), certolizumab in 1 (0.4%), and golimumab in 1 (0.4%) patient(s). Eighteen (7.3%) patients required more than 1 advanced therapy for management of IBD in the post-transplant period. In those on vedolizumab and infliximab, endoscopic and histologic improvements were demonstrated on follow-up. Thirty-one (12.6%) patients required colectomy following liver transplant for colorectal dysplasia. Conclusions: There are currently no randomized controlled studies or retrospective comparative studies evaluating the use of advanced therapies in patients with IBD after liver transplant. Based on the current literature and with the findings in this study, use of anti-TNF and anti-integrin therapy seem to be safe and effective after liver transplantation. It is unclear if endoscopic and/or histologic response rates are higher in the transplant population in comparison to the general IBD population without liver transplant in the setting of baseline immunosuppression post-transplant. Further studies comparing response and remission rates between these populations are needed.
0

S46 Influence of Primary Sclerosing Cholangitis on Colorectal Cancer Characteristics in Patients With Inflammatory Bowel Disease: A Retrospective Study

Gerardo Calderón et al.Dec 1, 2024
Background: Inflammatory bowel diseases (IBD) and primary sclerosing cholangitis (PSC) are associated with an elevated risk of colorectal cancer (CRC). While ongoing colonic inflammation is a recognized risk factor for CRC in IBD patients, the impact of concomitant PSC on CRC characteristics and outcomes is not fully understood. This study aimed to compare the clinical features between IBD patients with and without PSC who developed CRC. Methods: We conducted a retrospective study of IBD patients with CRC who had at least 1 colonoscopy at Mayo Clinic within 5 years prior to their CRC diagnosis. These patients were further divided into 2 groups based on the presence of PSC. We collected data on demographics, IBD duration, CRC diagnosis and location, cholangiocarcinoma diagnosis, and liver transplant status. CRC located in the cecum, ascending colon, and transverse colon was classified as right-sided, while CRC in the descending colon, sigmoid colon, and rectum was classified as left-sided. Statistical analyses included Student's t-test for continuous variables and the chi-squared test for categorical data. Results: A total of 119 IBD patients met the inclusion criteria, of whom 50 had concomitant PSC, diagnosed at a mean age of 41 ± 12 years. CRC presented as a single lesion in 96% of cases in both groups. The most common site for CRC was the ascending colon in the IBD-PSC group (32%) and the rectum in the non-PSC group (33%). Right-sided CRCs were more prevalent in the IBD-PSC group (74%) compared to the non-PSC group (50%; p=0.008). Patients in the IBD-PSC group were diagnosed with IBD at a younger age (mean age 32 ± 13 years vs 40 ± 18 years; p=0.01) and also developed CRC earlier (mean age 52 ± 13 years vs 62 ± 16 years; p=0.001) than those in the non-PSC group. Notably, the duration of IBD before CRC diagnosis was not significantly different between the groups. Among the IBD-PSC patients, 44% were diagnosed with CRC after liver transplantation, with an average time gap of 10 ± 7 years. Additionally, 24% of IBD-PSC patients developed concomitant cholangiocarcinoma, whereas no cases were observed in the non-PSC group (P< 0.001). Conclusions: This study demonstrates that IBD patients with concomitant PSC exhibit distinct clinical features compared to those without PSC, including a younger age of onset for both IBD and CRC, and a higher prevalence of right-sided CRCs. The presence of PSC appears to influence the pattern of CRC development, with a significant number of these patients developing CRC after liver transplantation and a notable risk of concomitant cholangiocarcinoma. These findings underscore the need for vigilant CRC surveillance and tailored management strategies in IBD patients with PSC.