YQ
Ye Qiu
Author with expertise in Pharmacological Effects of Licorice Roots
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(33% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
18
/
i10-index:
37
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Ultra‐high‐performance liquid chromatography–mass spectrometry combined with molecular docking and molecular dynamics simulation reveals the source of bitterness in the traditional Chinese medicine formula Runchang‐Tongbian

Na Li et al.Jun 17, 2024
Abstract The Runchang‐Tongbian (RCTB) formula is a traditional Chinese medicine (TCM) formula consisting of four herbs, namely Cannabis Fructus (Huomaren), Rehmanniae Radix (Dihuang), Atractylodis Macrocephalae Rhizoma (Baizhu), and Aurantii Fructus (Zhiqiao). It is widely used clinically because of its beneficial effect on constipation. However, its strong bitter taste leads to poor patient compliance. The bitter components of TCM compounds are complex and numerous, and inhibiting the bitter taste of TCM has become a major clinical challenge. Here, we use ultra‐high‐performance liquid chromatography coupled with mass spectrometry (UPLC–MS) and high‐resolution mass spectrometry to identify 59 chemical components in the TCM compound RCTB formula. Next, four bitter taste receptors, TAS2R39, TAS2R14, TAS2R7, and TAS2R5, which are tightly bound to the compounds in RCTB, were screened as molecular docking receptors using the BitterX database. The top‐three‐scoring receptor‐small‐molecule complexes for each of the four receptors were selected for molecular dynamics simulation. Finally, seven bitter components were identified, namely six flavonoids (rhoifolin, naringin, poncirin, diosmin, didymin, and narirutin) and one phenylpropanoid (purpureaside C). Thus, we proposed a new method for identifying the bitter components in TCM compounds, which provides a theoretical reference for bitter taste inhibition in TCM compounds.
0

Changes in the chemical composition and medicinal effects of black ginseng during processing

Ye Qiu et al.Nov 11, 2024
Aim of the Study To study the changes in the chemical composition and medicinal effects of black ginseng during processing. Materials and Methods The contents of ginsenosides Rg1, Re, Rh1, Rb1, 20-(S)-Rg3, 20-(R)-Rg3, and Rg5 were determined using high-performance liquid chromatography (HPLC), and the percentage of rare saponins was calculated. Furthermore, changes in the contents of reducing sugars and amino acids (i.e., Maillard reaction (MR) substrates) were measured to assess the relationship between processing and the MR. Compounds were identified using HPLC-MS and their cleavage patterns were analyzed. Gene co-expression network bioinformatics techniques were applied to identify the pharmacological mechanism of black ginseng. Results The changes in the physicochemical characteristics of black ginseng during processing were determined based on the MR. Rare saponins accumulated during black ginseng processing. In addition, reducing sugars were produced through polysaccharide pyrolysis and the MR; thus, their content initially increased and then decreased. The amino acid content gradually decreased as the number of evaporation steps increased, indicating that both amino acids and reducing sugars acted as substrates for the MR during black ginseng processing. Thirty-one saponins, 18 sugars, and 58 amino acids were identified based on the MS analysis. Transcriptomics results demonstrated that black ginseng can regulate signaling pathways such as the TNF, IL-17, MAPK, and PI3K-Akt pathways. This finding helps us understand the observed proliferation and differentiation of immune-related cells and positively regulated cell adhesion.
0

Formation and stabilization mechanism of Ginsenoside Rg3 inclusion complexes based on molecular simulation

Shili Pan et al.Jan 2, 2025
The formation of inclusion complexes between Ginsenoside Rg3 and cyclodextrins represents a promising strategy to enhance the solubility of G-Rg3. Nevertheless, the molecular mechanisms underlying the interaction between G-Rg3 and cyclodextrins have yet to be fully elucidated. In this study, we employed a combination of molecular simulation and experimental methodologies to identify the most effective solubilizing carriers among G-Rg3, β-cyclodextrin (β-CD), 2-hydroxypropyl-β-cyclodextrin (HP-β-CD), and 2,6-dimethyl-β-cyclodextrin (DM-β-CD). The inclusion complexes formed with HP-β-CD demonstrates superior stability and water solubility compared to those formed with β-CD and DM-β-CD. The preparation process for the inclusion complexes of G-Rg3 and HP-β-CD was optimized through an orthogonal testing approach. The optimal conditions were determined to be a mass ratio of G-Rg3 to HP-β-CD of 1:125, an inclusion time of 2 h, and an inclusion temperature of 30 °C. The formation of the inclusion complexes was confirmed using DSC, Fourier Transform Infrared FTIR, and XRD techniques. In vitro solubility tests indicated that the solubility of the G-Rg3 inclusion complexes was 2.9 times greater than that of G-Rg3. Molecular dynamics (MD) simulations provided insights into the mechanisms that stabilize the inclusion complexes and enhance their water solubility. The primary interaction force between G-Rg3 and HP-β-CD was identified as the van der Waals force.