FL
Fengping Liu
Author with expertise in Diversity and Function of Gut Microbiome
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(100% Open Access)
Cited by:
234
h-index:
16
/
i10-index:
20
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Alterations of gastric mucosal microbiota across different stomach microhabitats in a cohort of 276 patients with gastric cancer

Xiaosun Liu et al.Dec 21, 2018
As part of the tumor microenvironment, the gastric microbiota play vital roles in tumor initiation, progression and metastasis, but stomach microhabitats are not always uniform. We aimed to characterize differences of gastric microbiota in stomach microhabitats associated with gastric cancer (GC) development.A cohort of 276 GC patients without preoperative chemotherapy was enrolled retrospectively, and 230 normal, 247 peritumoral and 229 tumoral tissues were obtained for gastric microbiota analysis targeting the 16S rRNA gene by MiSeq sequencing. The microbial diversity and composition, bacterial co-occurrence correlations and predictive functional profiles were compared across different microhabitats.GC-specific stomach microhabitats, not GC stages or types, determine the composition and diversity of the gastric microbiota. Most notably, bacterial richness was decreased in peritumoral and tumoral microhabitats, and the correlation network of abundant gastric bacteria was simplified in tumoral microhabitat. Helicobacter pylori (HP), Prevotella copri and Bacteroides uniformis were significantly decreased, whereas Prevotella melaninogenica, Streptococcus anginosus and Propionibacterium acnes were increased in tumoral microhabitat. Higher HP colonisation influenced the overall structure of the gastric microbiota in normal and peritumoral microhabitats. PiCRUSt analysis revealed that genes associated with nucleotide transport and metabolism and amino acid transport and metabolism were significantly enriched in tumoral microbiota, while gastric acid secretion was significantly higher in HP positive group of the tumoral microbiota.Our present study provided new insights into the roles of gastric microbiota in different stomach microhabitats in gastric carcinogenesis, especially the pathogenesis of HP. FUND: National Natural Science Foundation of China.
3

The bladder microbiome, metabolome, cytokines, and phenotypes in patients with systemic lupus erythematosus

Fengping Liu et al.Jan 14, 2022
Abstract Background and aims Emerging studies reveal a unique bacterial community in the human bladder, with alteration of composition associated to disease states. Systemic lupus erythematosus (SLE) is a complex autoimmune disease that is characterized by frequent impairment of the kidney. Here, we explored the bladder microbiome, metabolome, and cytokine profiles in SLE patients, as well as correlations between microbiome and metabolome, cytokines, and disease profiles. Methods and materials We recruited a cohort of 50 SLE patients and 50 individually matched asymptomatic controls. We used transurethral catheterization to collect urine samples, 16S rRNA gene sequencing to profile bladder microbiomes, and LC-MS/MS to perform untargeted metabolomic profiling. Results Compared to controls, SLE patients possessed a unique bladder microbial community and increased alpha diversity. These differences were accompanied by differences in urinary metabolomes, cytokines, and patients’ disease profiles. The SLE-enriched genera, including Bacteroides , were positively correlated with several SLE-enriched metabolites, including olopatadine. The SLE-depleted genera, such as Pseudomonas , were negatively correlated to SLE-depleted cytokines, including IL-8. Alteration of the bladder microbiome was associated with disease profile. For example, the genera Megamonas and Phocaeicola were negatively correlated with serum complement C3, and Streptococcus was positively correlated with IgG. Conclusions Our present study reveals associations between the bladder microbiome and the urinary metabolome, cytokines, and disease phenotypes. Our results could help identify biomarkers for SLE.
3
Citation1
0
Save
0

Psychological Responses of Chinese Medical Students to the COVID-19 Pandemic: Empirical Research Qualitative

Shiyong Fan et al.Jun 1, 2024
Aim: This study aims to explore the psychological reactions of medical students during the pandemic. Design: A qualitative study. Methods: A purposive sampling technique was employed, and a qualitative approach was adopted. Semi-structured questionnaires were utilized, and online interviews were conducted. Forty medical students were selected as participants for the interviews. The interview data were analyzed using Colaizzi's seven-step analysis method. Results: The study identified five themes related to the psychological reactions of medical students during the pandemic. Firstly, COVID-19's influence on medical careers was characterized by increased interest and determination in pursuing medical professions, heightened admiration for frontline workers, reinforced commitment to a medical career due to the pandemic, and recognition of the significance of medical education. Secondly, challenges and concerns in medical career pursuit were identified, including negative sentiments towards medical careers during COVID-19 and hesitations and concerns about entering the medical field amidst the pandemic. Thirdly, the impact on mental well-being encompassed diverse anxieties expressed by participants regarding control, transmission, treatment, and intentional spreading of the virus. Participants experienced an emotional progression from calmness to fear and anxiety, with heightened anxiety when relatives or acquaintances contracted COVID-19. Academic delays also contributed to anxiety among medical students. Fourthly, changes in behaviors and mindset were observed, including altered behaviors and mindset in response to the pandemic, as well as increased attention to personal hygiene and disease prevention measures. Lastly, expectations of medical students from government, public, and parents were explored. Conclusion: Understanding the psychological reactions of medical students during public health emergencies is crucial for their well-being and professional development. The findings have implications for medical education and the development of strategies to enhance the psychological well-being of medical students during similar crises. Keywords: COVID-19, medical students, psychological reactions, pandemic, mental health
2

An endolysosome membrane transformation process for engulfment of autophagosomes independently of ESCRT

Zhe Wu et al.May 5, 2022
Abstract Endolysosome, usually regarded as the cellular recycling bin, digests materials from multiple origins. The materials from different origins are delivered to endolysosome through the vesicle fusion, kiss-and-run mechanisms, CMA or microautophagy. However, it remains unknown whether endolysosome can receive cargo via other ways. Here, we reported another endolysosomal process for receiving materials. In this, endolysosome receives materials by extending two arms which embraces autophagosomes and engulfs the autophagosomes ultimately, but not via the conventional fusion of autophagosomes with endolysosomes. We named this process as LEA (lysosome eats autophagosome) and the endolysosome arms as LF (endolysosome filopodia) provisionally. The endolysosomes with engulfed autophagosomes (LEA endolysosomes) get more autophagosomes via the fusion with other LEA endolysosomes. The engulfed autophagosomes are labelled by F-actin on their membranes and have ER protein Sec61β and peroxisome protein Pex14 inside their lumens, but mitochondria are excluded outside endolysosome. Our discovery of LEA and LF reveal an unidentified endolysosome transformation process which is responsible for receiving cargoes.
0

Exploring Factors Affecting Acceptance of Fecal Microbiota Transplantation for Patients with Recurrent Urinary Tract Infections: a Descriptive Qualitative Study

Hongyuan Liu et al.Jun 1, 2024
Purpose: Patients with recurrent urinary tract infections face complex management challenges. Fecal microbiota transplantation is a superior treatment for chronic infectious diseases, but limited patient knowledge affects treatment decisions. This study aims to identify factors associated with hesitancy towards fecal microbiota transplantation among patients with recurrent urinary tract infections, to help physicians and nurses in providing accurate and useful information to patients. Patients and Methods: A descriptive qualitative approach was employed, utilizing semi-structured interviews conducted with patients experiencing recurrent urinary tract infections who expressed hesitancy towards fecal microbiota transplantation. The interviews took place between September 2021 and December 2022. Thematic analysis was conducted on the semi-structured interviews to identify perceived facilitators and barriers associated with fecal microbiota transplantation. Results: The analysis included interviews with thirty adult female patients with recurrent urinary tract infections. Four facilitators influencing patients' decision-making regarding fecal microbiota transplantation were identified: (1) the motivating role of hope and expectations for active patient participation; (2) the influence of healthcare providers, as well as family members and friends on patients' decisions to pursue fecal microbiota transplantation; (3) the patients' perception of fecal microbiota transplantation as a low-risk treatment option; and (4) the dedication to the advancement of medical treatments. In contrast, two primary barriers to accepting fecal microbiota transplantation were identified: (1) that conventional treatment controls disease activity, while fecal microbiota transplantation effects remain uncertain; and (2) that safety concerns surrounding fecal microbiota transplantation. Conclusion: Comprehensive information about fecal microbiota transplantation, including donor selection, sample processing, the procedure, and potential discomfort, is essential for patients and families to make informed treatment decisions. Registration: CHiCTR2100048970. Keywords: barriers, decision making, facilitators, fecal microbiota transplantation, qualitative study, recurrent urinary tract infections