MR
Mary Robinson
Author with expertise in Hackathons in Biomedical Engineering Education
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
364
h-index:
31
/
i10-index:
67
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

SARS-CoV-2 wastewater variant surveillance: pandemic response leveraging FDA’s GenomeTrakr network

Ruth Timme et al.May 31, 2024
Wastewater surveillance has emerged as a crucial public health tool for population-level pathogen surveillance. Supported by funding from the American Rescue Plan Act of 2021, the FDA's genomic epidemiology program, GenomeTrakr, was leveraged to sequence SARS-CoV-2 from wastewater sites across the United States. This initiative required the evaluation, optimization, development, and publication of new methods and analytical tools spanning sample collection through variant analyses. Version-controlled protocols for each step of the process were developed and published on protocols.io. A custom data analysis tool and a publicly accessible dashboard were built to facilitate real-time visualization of the collected data, focusing on the relative abundance of SARS-CoV-2 variants and sub-lineages across different samples and sites throughout the project. From September 2021 through June 2023, a total of 3,389 wastewater samples were collected, with 2,517 undergoing sequencing and submission to NCBI under the umbrella BioProject, PRJNA757291. Sequence data were released with explicit quality control (QC) tags on all sequence records, communicating our confidence in the quality of data. Variant analysis revealed wide circulation of Delta in the fall of 2021 and captured the sweep of Omicron and subsequent diversification of this lineage through the end of the sampling period. This project successfully achieved two important goals for the FDA's GenomeTrakr program: first, contributing timely genomic data for the SARS-CoV-2 pandemic response, and second, establishing both capacity and best practices for culture-independent, population-level environmental surveillance for other pathogens of interest to the FDA.
0
Citation2
0
Save
0

Prolonged administration of oral phenylbutazone and firocoxib in horses has no impact on selected cytokine and growth factor concentrations in platelet-rich plasma and autologous protein solution

Kara Brown et al.Jun 18, 2024
Abstract OBJECTIVE To determine the effects of prolonged administration of the oral NSAIDs phenylbutazone and firocoxib on concentrations of cytokines and growth factors in platelet-rich plasma (PRP) and autologous protein solution (APS). ANIMALS 6 adult University owned horses. METHODS Horses were randomized to receive phenylbutazone (1 g, orally, q 12 h) or firocoxib (57 mg, orally, q 24 h) for 6 days. Blood was obtained and processed for APS (Pro-Stride) and PRP (Restigen) before the administration of NSAIDs and at 7 days (1 day following cessation of NSAIDs). Horses underwent a two-week washout period, during which blood was obtained at 14 days and 21 days. The protocol was repeated with a crossover design. PRP and APS were analyzed for concentrations of platelets, leukocytes, and several cytokines (IL-1β, IL-10, IL-6, IL-8, and tumor necrosis factor-α) and growth factors (PDGF, FGF-2, and TGF-β1) using immunoassays. Plasma was evaluated for drug concentrations. RESULTS No significant differences existed in concentrations of growth factors and cytokines before or after prolonged administration of NSAIDs. There were significant differences in concentrations of leukocytes and platelets in PRP compared to APS, with higher concentrations of leukocytes at the day 7 time point (T) in APS (phenylbutazone) and in concentrations of platelets in APS at T0 (firocoxib) and in APS at T7 (phenylbutazone). CLINICAL RELEVANCE Veterinarians can recommend the administration of these oral NSAIDs prior to obtaining blood for PRP and APS provided a single-day washout period is instituted.