Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
AA
Andrew Aronsohn
Author with expertise in Epidemiology and Management of NAFLD
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(75% Open Access)
Cited by:
1,406
h-index:
18
/
i10-index:
22
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Changes in the Prevalence of Hepatitis C Virus Infection, Nonalcoholic Steatohepatitis, and Alcoholic Liver Disease Among Patients With Cirrhosis or Liver Failure on the Waitlist for Liver Transplantation

David Goldberg et al.Jan 11, 2017
Background & AimsConcurrent to development of more effective drugs for treatment of hepatitis C virus (HCV) infection, there has been an increase in the incidence of nonalcoholic fatty liver disease. Data indicate that liver transplantation prolongs survival times of patient with acute hepatitis associated with alcoholic liver disease (ALD). We compared data on disease prevalence in the population with data from liver transplantation waitlists to evaluate changes in the burden of liver disease in the United States.MethodsWe collected data on the prevalence of HCV from the 2010 and 2013–2014 cycles of the National Health and Nutrition Examination Survey. We also collected data from the HealthCore Integrated Research Database on patients with cirrhosis and chronic liver failure (CLF) from 2006 through 2014, and data on patients who received transplants from the United Network for Organ Sharing from 2003 through 2015. We determined percentages of new waitlist members and transplant recipients with HCV infection, stratified by indication for transplantation, modeling each calendar year as a continuous variable using the Spearman rank correlation, nonparametric test of trends, and linear regression models.ResultsIn an analysis of data from the National Health and Nutrition Examination Survey (2013–2014), we found that the proportion of patients with a positive HCV antibody who had a positive HCV RNA was 0.5 (95% confidence interval, 0.42−0.55); this value was significantly lower than in 2010 (0.64; 95% confidence interval, 0.59−0.73) (P = .03). Data from the HealthCore database revealed significant changes (P < .05 for all) over time in percentages of patients with compensated cirrhosis (decreases in percentages of patients with cirrhosis from HCV or ALD, but increase in percentages of patients with cirrhosis from nonalcoholic steatohepatitis [NASH]), CLF (decreases in percentages of patients with CLF from HCV or ALD, with an almost 3-fold increase in percentage of patients with CLF from NASH), and hepatocellular carcinoma (HCC) (decreases in percentages of patients with HCC from HCV or ALD and a small increase in HCC among persons with NASH). Data from the United Network for Organ Sharing revealed that among patients new to the liver transplant waitlist, or undergoing liver transplantation, for CLF, there was a significant decrease in the percentage with HCV infection and increases in percentages of patients with nonalcoholic fatty liver disease or ALD. Among patients new to the liver transplant waitlist or undergoing liver transplantation for HCC, proportions of those with HCV infection, nonalcoholic fatty liver disease, or ALD did not change between 2003 and 2015.ConclusionsIn an analysis of 3 different databases (National Health and Nutrition Examination Survey, HealthCore, and United Network for Organ Sharing), we found the proportion of patients on the liver transplant waitlist or undergoing liver transplantation for chronic HCV infection to be decreasing and fewer patients to have cirrhosis or CLF. However, the percentages of patients on the waitlist or receiving liver transplants for NASH or ALD are increasing, despite different relative burdens of disease among the entire population of patients with cirrhosis. Concurrent to development of more effective drugs for treatment of hepatitis C virus (HCV) infection, there has been an increase in the incidence of nonalcoholic fatty liver disease. Data indicate that liver transplantation prolongs survival times of patient with acute hepatitis associated with alcoholic liver disease (ALD). We compared data on disease prevalence in the population with data from liver transplantation waitlists to evaluate changes in the burden of liver disease in the United States. We collected data on the prevalence of HCV from the 2010 and 2013–2014 cycles of the National Health and Nutrition Examination Survey. We also collected data from the HealthCore Integrated Research Database on patients with cirrhosis and chronic liver failure (CLF) from 2006 through 2014, and data on patients who received transplants from the United Network for Organ Sharing from 2003 through 2015. We determined percentages of new waitlist members and transplant recipients with HCV infection, stratified by indication for transplantation, modeling each calendar year as a continuous variable using the Spearman rank correlation, nonparametric test of trends, and linear regression models. In an analysis of data from the National Health and Nutrition Examination Survey (2013–2014), we found that the proportion of patients with a positive HCV antibody who had a positive HCV RNA was 0.5 (95% confidence interval, 0.42−0.55); this value was significantly lower than in 2010 (0.64; 95% confidence interval, 0.59−0.73) (P = .03). Data from the HealthCore database revealed significant changes (P < .05 for all) over time in percentages of patients with compensated cirrhosis (decreases in percentages of patients with cirrhosis from HCV or ALD, but increase in percentages of patients with cirrhosis from nonalcoholic steatohepatitis [NASH]), CLF (decreases in percentages of patients with CLF from HCV or ALD, with an almost 3-fold increase in percentage of patients with CLF from NASH), and hepatocellular carcinoma (HCC) (decreases in percentages of patients with HCC from HCV or ALD and a small increase in HCC among persons with NASH). Data from the United Network for Organ Sharing revealed that among patients new to the liver transplant waitlist, or undergoing liver transplantation, for CLF, there was a significant decrease in the percentage with HCV infection and increases in percentages of patients with nonalcoholic fatty liver disease or ALD. Among patients new to the liver transplant waitlist or undergoing liver transplantation for HCC, proportions of those with HCV infection, nonalcoholic fatty liver disease, or ALD did not change between 2003 and 2015. In an analysis of 3 different databases (National Health and Nutrition Examination Survey, HealthCore, and United Network for Organ Sharing), we found the proportion of patients on the liver transplant waitlist or undergoing liver transplantation for chronic HCV infection to be decreasing and fewer patients to have cirrhosis or CLF. However, the percentages of patients on the waitlist or receiving liver transplants for NASH or ALD are increasing, despite different relative burdens of disease among the entire population of patients with cirrhosis.
0

The Perils of Pathogen Discovery: Origin of a Novel Parvovirus-Like Hybrid Genome Traced to Nucleic Acid Extraction Spin Columns

Samia Naccache et al.Sep 12, 2013
Next-generation sequencing was used for discovery and de novo assembly of a novel, highly divergent DNA virus at the interface between the Parvoviridae and Circoviridae. The virus, provisionally named parvovirus-like hybrid virus (PHV), is nearly identical by sequence to another DNA virus, NIH-CQV, previously detected in Chinese patients with seronegative (non-A-E) hepatitis. Although we initially detected PHV in a wide range of clinical samples, with all strains sharing ∼99% nucleotide and amino acid identity with each other and with NIH-CQV, the exact origin of the virus was eventually traced to contaminated silica-binding spin columns used for nucleic acid extraction. Definitive confirmation of the origin of PHV, and presumably NIH-CQV, was obtained by in-depth analyses of water eluted through contaminated spin columns. Analysis of environmental metagenome libraries detected PHV sequences in coastal marine waters of North America, suggesting that a potential association between PHV and diatoms (algae) that generate the silica matrix used in the spin columns may have resulted in inadvertent viral contamination during manufacture. The confirmation of PHV/NIH-CQV as laboratory reagent contaminants and not bona fide infectious agents of humans underscores the rigorous approach needed to establish the validity of new viral genomes discovered by next-generation sequencing.
0
Citation233
0
Save