ME
Mohamed El‐Shazly
Author with expertise in Computational Methods in Drug Discovery
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
8
(25% Open Access)
Cited by:
832
h-index:
40
/
i10-index:
151
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Anti-inflammatory effects of thymol: an emphasis on the molecular interactions through in vivo approach and molecular dynamic simulations

Muhammad Islam et al.Jun 25, 2024
Thymol (THY), as the natural monoterpene phenol, acts against oxidative stress and inflammatory processes. This study aimed to evaluate the anti-inflammatory effects and possible molecular mechanisms of THY via formalin-induced mouse and egg albumin-induced chick models alongside molecular docking and molecular dynamic (MD) simulations. THY (7.5, 15, and 30 mg/kg) was investigated, compared to celecoxib and ketoprofen (42 mg/kg), as anti-inflammatory standards. THY dose-dependently and significantly ( p &lt; 0.05) decreased paw-licking and edema diameter parameters in formalin (phases I and II) and egg albumin-induced models. Moreover, THY (15 mg/kg) exerted better anti-inflammatory effects in combination with the standard drug ketoprofen than alone and with celecoxib. In silico studies demonstrated elevated binding affinities of THY with cyclooxygenase-2 (COX-2) than the COX-1 enzyme, and the ligand binds at a similar location where ketoprofen and celecoxib interact. The results of MD simulations confirmed the stability of the test ligand. THY exerted anti-inflammatory effects on Swiss mice and young chicks, possibly by interacting with COX-2. As a conclusion, THY might be a hopeful drug candidate for the management of inflammatory disorders.
0

Exploring the healing power of Pistacia lentiscus stems: insights into extraction methods, polyphenolic composition, and health-promoting activities

Abdessamad Beraich et al.May 27, 2024
This work aimed to evaluate the effect of different extraction solvents on the polyphenolic content, antioxidant and antibacterial activity of Pistacia lentiscus stems. The results obtained show that the extraction yield depends strongly on the polarity of the solvent and the extraction method. The ethanolic extract had the highest yield in both extraction methods investigated, namely Soxhlet (R = 9.89%) and cold maceration (R = 9.20%). The free radical scavenging activity of the extracts showed that the ethanolic extract had the highest antioxidant activity in both extraction methods with an IC50 = 0.023 mg/mL (cold maceration) and an IC50 = 0.034 mg/ml (Soxhlet). The HPLC analysis of the extracts indicates that gallic acid and catechin are the major phenolic compounds. The FTIR results showed that the shift of the stretching is responsible for O-H and C-H bonding. The GC-MS analysis revealed the presence of stearic acid and palmitic acid methyl ester as main compounds. The bacterial analysis of the extracts showed that the aqueous extract represents the most active one against Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa; on the other hand, no antifungal activity was appreciated. Overall, the results indicate that the investigated extracts might be considered valuable sources of bioactive compounds.
0

Uncovering the Natural Inhibitors From Medicinal Plants to Alleviate Human Cancers Targeting the p53 Protein: An In Silico Approach

Md. Islam et al.Jan 1, 2025
Abstract The tumor suppressor p53 protein plays a key role in controlling several essential cellular responses, including cell growth, development, and apoptosis, helping to prevent cancer development. In various cancers, loss of p53 function results in prolonged cell replication and inhibition of programmed cell death. There are a few options available to target p53, but they come with limitations. For this reason, there is a need for novel drug candidates to maintain p53 functionality. Therefore, our study aims to identify potential natural bioactive compounds through comprehensive in silico methods such as molecular docking, MM/GBSA (molecular mechanics generalized born surface area), ADME/T (absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity), and molecular dynamics (MD) simulation against the targeted protein p53. Initially, 462 phytochemicals from 23 medicinal plants were screened using molecular docking and MM‐GBSA studies to find potential phytochemicals. From the studies, the top three compounds, CID‐3469, CID‐5280372, and CID‐591524, were selected based on their good binding affinities for further investigation, where all the compounds showed better drug‐likeness with no toxicity in ADME/T analysis. MD simulation depicted better structural stability of phytocompounds in complexes with p53 protein. This study shows novel insights into the development of novel bioactive compounds as drug candidates for cancer treatment.