Abstract Essential thrombocythemia (ET) and prefibrotic primary myelofibrosis (pre-PMF) are Philadelphia chromosome-negative myeloproliferative neoplasms. These conditions share overlapping clinical presentations; however, their prognoses differ significantly. Current morphological diagnostic methods lack reliability in subtype differentiation, underlining the need for improved diagnostics. The aim of this study was to investigate the multi-omics alterations in bone marrow biopsies of patients with ET and pre-PMF to improve our understanding of the nuanced diagnostic characteristics of both diseases. We performed proteomic analysis with 4D direct data-independent acquisition and microbiome analysis with 2bRAD-M sequencing technology to identify differential protein and microbe levels between untreated patients with ET and pre-PMF. Laboratory and multi-omics differences were observed between ET and pre-PMF, encompassing diverse pathways, such as lipid metabolism and immune response. The pre-PMF group showed an increased neutrophil-to-lymphocyte ratio and decreased high-density lipoprotein and cholesterol levels. Protein analysis revealed significantly higher CXCR2, CXCR4, and MX1 levels in pre-PMF, while APOC3, APOA4, FABP4, C5, and CFB levels were elevated in ET, with diagnostic accuracy indicated by AUC values ranging from 0.786 to 0.881. Microbiome assessment identified increased levels of Mycobacterium, Xanthobacter, and L1I39 in pre-PMF, whereas Sphingomonas, Brevibacillus, and Pseudomonas_E were significantly decreased, with AUCs for these genera ranging from 0.833 to 0.929. Our study provides preliminary insights into the proteomic and microbiome variations in the bone marrow of patients with ET and pre-PMF, identifying specific proteins and bacterial genera that warrant further investigation as potential diagnostic indicators. These observations contribute to our evolving understanding of the multi-omics variations and possible mechanisms underlying ET and pre-PMF.

Hemophilia is a hemorrhagic disease caused by a lack of clotting factors due to genetic mutations, and is a representative of rare diseases. The prevalence rate of hemophilia is about 2.73∼3.09/100,000 in China, and the absolute number of patients with hemophilia is large given a huge population base. As a part of the Healthy China initiative, prevention and treatment of hemophilia has attracted much attention in the country. With comprehensive promotion of the construction of the grading diagnosis and treatment system for hemophilia, China requires hospitals applying for comprehensive management centers and diagnosis and treatment centers for hemophilia to be able to independently carry out screening and confirming tests related to hemophilia diagnosis. Identifying the type of pathogenic mutation through genetic diagnosis is of great value for assessing the risk of clinical bleeding in hemophilia patients, studying the induction mechanism of clotting factor inhibitors, conducting gene therapy and promoting eugenics. The mutation types of F8 gene are similar in Chinese patients to international data reports. The F9 gene mutations are mainly single-base point mutations, with no mutation hotspots found in Chinese patients. Historically in China, the treatment of hemophilia has gone through insufficient on-demand treatment and exploration of low-dose prophylaxis, and currently, it is moving towards high-dose prophylaxis with better efficacy and individualized prophylaxis, achieving more ideal treatment effects, reducing patient inconvenience and discomfort, and avoiding high treatment costs as much as possible. Based on related registration data and literature, this report comprehensively summarizes the progress and points out the shortcomings in clinical research and medical care as regards hemophilia in China, in the hope of helping further improve the diagnosis and treatment of hemophilia in the country.

Acute myeloid leukemia (AML) and myelodysplastic syndrome (MDS) constitute myeloid malignancies, and allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (allo-HSCT) is considered as a potentially optimal approach for achieving a long term cure. However, post-allo-HSCT relapse remains a leading cause of mortality and therapeutic failure.