Background and Objective Many drugs, including proton pump inhibitors and certain antidepressants, are metabolized by the polymorphic cytochrome P450 (CYP) 2C19 enzyme. A significant portion of extensive metabolizers do not reach appropriate drug levels, and our objective was to investigate any genetic background. Methods The 5′-flanking region of the CYP2C19 gene from subjects with rapid omeprazole metabolism was sequenced, and CYP2C19 phenotype-genotype associations were analyzed in Swedish (n=107) and Ethiopian (n=126) extensive metabolizers. The relationship of the metabolic ratio of omeprazole (omeprazole/5-hydroxyomeprazole in plasma 3 hours after drug intake) with the area under the plasma concentration-time curve was used for prediction studies. Electrophoretic mobility shift assays were conducted by use of human nuclear protein extracts. Hepatic reporter vector transfections were carried out in CD1 mice. Results We identified a novel allele (CYP2C19*17) carrying −806C>T and −3402C>T, with a frequency of 18% in both Swedes and Ethiopians and 4% in Chinese subjects. In Swedes the metabolic ratio of omeprazole was higher in subjects homozygous for CYP2C19*1 (median, 0.50 [interquartile range, 0.37–0.73]) than in those homozygous for CYP2C19*17 (median, 0.25 [interquartile range, 0.15–0.33]) (P = .010). In Ethiopians a similar difference in the S/R-mephenytoin ratio was observed between individuals homozygous for CYP2C19*1 (median, 0.20 [interquartile range, 0.12–0.37]) and those homozygous for CYP2C19*17 (median, 0.05 [interquartile range, 0.03–0.06]) (P=.013). Electrophoretic mobility shift assays showed specific binding of human hepatic nuclear proteins to an element carrying −806T but not −806C. Reporter vector experiments showed an increased transcriptional activity of the CYP2C19*17 allele in vivo in mice. Predictions revealed that CYP2C19*17 homozygotes would attain 35% to 40% lower omeprazole area under the plasma concentration-time curve values than subjects homozygous for CYP2C19*1 taking standard doses of omeprazole. Conclusion CYP2C19*17 is likely to cause therapeutic failures in drug treatment with, for example, proton pump inhibitors and antidepressants. Clinical Pharmacology & Therapeutics (2006) 79, 103–113; doi: 10.1016/j.clpt.2005.10.002

There is limited knowledge about non-tuberculous mycobacteria (NTM) infections in migrants. We aimed to assess the incidence and clinical significance of NTM among migrants in Denmark. Nationwide register-based cohort study of migrants with a positive NTM culture in Denmark from 1991 through 2021, stratified by patient demographics, disease localisation, species, and clinical significance. 433 migrants had a positive NTM culture, resulting in an overall incidence rate (IR) of 3.7 (95%CI 3.3–4.0) per 100,000 migrants. Overall NTM IRs for definite disease were 1.0 (95%CI 0.9–1.2), possible disease 1.0 (95%CI 0.8–1.2), and isolation 1.7 (95%CI 1.4–1.9) per 100,000 migrants. Migrants had considerably higher age- and sex-adjusted NTM IRs of positive cultures (incidence rate ratio [IRR] = 2.1, 95%CI 1.9–2.3, p < 0.001), possible disease (IRR = 2.4, 95%CI 2.0–3.0, p < 0.001), and isolation (IRR = 4.6, 95%CI 3.9–5.4, p < 0.001) compared to Danish-born, but not of definite disease (IRR = 1.1, 95%CI 0.9–1.3, p = 0.562). IRs of migrants with positive NTM cultures did not increase over time (−0.8 %/year, p = 0.133). Migrants have a higher, but stable, burden of NTM compared with Danish-born. The higher rates likely reflect that more specimens are examined for Mycobacterium tuberculosis. Microbiologically classified definite NTM disease is not substantially more common among migrants.

Nontuberculous mycobacteria (NTM) are emerging as notable causative agents of opportunistic infections. To examine clinical significance, species distribution, and temporal trends of NTM in Denmark, we performed a nationwide register-based study of all unique persons with NTM isolated in the country during 1991-2022. We categorized patients as having definite disease, possible disease, or isolation by using a previously validated method. The incidence of pulmonary NTM increased throughout the study period, in contrast to earlier findings. Mycobacterium malmoense, M. kansasii, M. szulgai, and M. avium complex were the most clinically significant species based on microbiologic findings; M. avium dominated in incidence. This study shows the need for surveillance for an emerging infection that is not notifiable in most countries, provides evidence to support clinical decision-making, and highlights the importance of not considering NTM as a single entity.