Abstract GWAS have identified >200 risk loci for Inflammatory Bowel Disease (IBD). The majority of disease associations are known to be driven by regulatory variants. To identify the putative causative genes that are perturbed by these variants, we generate a large transcriptome data set (nine disease-relevant cell types) and identify 23,650 cis -eQTL. We show that these are determined by ∼9720 regulatory modules, of which ∼3000 operate in multiple tissues and ∼970 on multiple genes. We identify regulatory modules that drive the disease association for 63 of the 200 risk loci, and show that these are enriched in multigenic modules. Based on these analyses, we resequence 45 of the corresponding 100 candidate genes in 6600 Crohn disease (CD) cases and 5500 controls, and show with burden tests that they include likely causative genes. Our analyses indicate that ≥10-fold larger sample sizes will be required to demonstrate the causality of individual genes using this approach.

The best approach for Helicobacter pylori management remains unclear. An audit process is essential to ensure clinical practice is aligned with best standards of care.International multicentre prospective non-interventional registry starting in 2013 aimed to evaluate the decisions and outcomes in H. pylori management by European gastroenterologists. Patients were registered in an e-CRF by AEG-REDCap. Variables included demographics, previous eradication attempts, prescribed treatment, adverse events and outcomes. Data monitoring was performed to ensure data quality. Time-trend and geographical analyses were performed.30 394 patients from 27 European countries were evaluated and 21 533 (78%) first-line empirical H. pylori treatments were included for analysis. Pretreatment resistance rates were 23% to clarithromycin, 32% to metronidazole and 13% to both. Triple therapy with amoxicillin and clarithromycin was most commonly prescribed (39%), achieving 81.5% modified intention-to-treat eradication rate. Over 90% eradication was obtained only with 10-day bismuth quadruple or 14-day concomitant treatments. Longer treatment duration, higher acid inhibition and compliance were associated with higher eradication rates. Time-trend analysis showed a region-dependent shift in prescriptions including abandoning triple therapies, using higher acid-inhibition and longer treatments, which was associated with an overall effectiveness increase (84%-90%).Management of H. pylori infection by European gastroenterologists is heterogeneous, suboptimal and discrepant with current recommendations. Only quadruple therapies lasting at least 10 days are able to achieve over 90% eradication rates. European recommendations are being slowly and heterogeneously incorporated into routine clinical practice, which was associated with a corresponding increase in effectiveness.

ABSTRACT Background The influence of indications for Helicobacter pylori investigation on prescriptions and effectiveness is unknown. The aim of the study was to assess the impact of indications for H. pylori investigation on prescriptions, effectiveness, compliance, and tolerance. Methods International, prospective, non‐interventional registry of the management of H. pylori infection by European gastroenterologists (Hp‐EuReg). Treatment‐näive patients registered from 2013 to 2023 at e‐CRF AEG‐REDCap were analyzed. The effectiveness was assessed by modified intention‐to‐treat analysis. Results Overall, 53,636 treatment‐naïve cases from 34 countries were included. Most frequent indications were: dyspepsia with normal endoscopy (49%), non‐investigated dyspepsia (20%), duodenal ulcer (11%), gastric ulcer (7.7%), and gastroesophageal reflux disease (GERD) (2.6%). Therapy effectiveness varied by indication: duodenal ulcer (91%), gastric ulcer (90%), preneoplastic lesions (90%), dyspepsia with normal endoscopy (89%), GERD (88%), and non‐investigated dyspepsia (87%). Bismuth‐metronidazole‐tetracycline and clarithromycin‐amoxicillin‐bismuth quadruple therapies achieved 90% effectiveness in all indications except GERD. Concomitant clarithromycin‐amoxicillin‐tinidazole/metronidazole reached 90% cure rates except in patients with non‐investigated dyspepsia; whereas sequential clarithromycin‐amoxicillin‐tinidazole/metronidazole proved optimal (≥90%) in patients with gastric ulcer only. Adverse events were higher in patients treated for dyspepsia with normal endoscopy and duodenal ulcer compared with the remaining indications (23% and 28%, p < 0.001). Therapeutic compliance was higher in patients with duodenal ulcer and preneoplastic lesions (98% and 99%, p < 0.001). Conclusion In Europe, patients with gastric or duodenal ulcers and preneoplastic lesions showed higher H. pylori treatment effectiveness. Bismuth and non‐bismuth quadruple therapies achieved optimal results in almost all indications. Trial Registration ClinicalTrials.gov identifier: NCT02328131.

Background: Inflammatory bowel disease (IBD)` may affect organs outside the intestines, it is called extraintestinal manifestations of IBD. Data on the prevalence of mu-cocutaneous manifestations in IBD patients are very limited, therefore, the aim of this study was to assess the prevalence of skin and mucosal lesions and to determine the relationship with demographic factors, clinical features, and systemic treatment.Materials and methods: Prospective study included 162 out-patients with IBD who were managed in the tertiary care center. Ulcerative colitis (UC) was diagnosed in 117 patients, Crohn‘s disease (CD) in 45. Patients completed the questionnaire containing demographic and IBD data, questions about mucocutaneous lesions (in past or present state).Results: Overall mucocutaneous lesions were reported by 48.1% of IBD patients. Skin lesions were reported by 40.7% of patients, oral mucosal lesions were reported by 16.7%, without significant differences between sexes or IBD types. In 47 (29%) of patients, skin lesions appeared together with IBD or during the course of the disease. The most common skin lesions were psoriasis (8.0%), erythema nodosum (5.6%), pyoderma gangrenosum and acne (3.7% each). UC patients mostly reported about psoriasis (9.4%), while CD patients about erythema nodosum (11.1%). There were more frequent skin lesions in patients with more extensive UC type (p = 0.01), while no difference was noticed between different types of CD. The average duration of IBD in patients with skin lesions was similar to those without lesions (9.3±6.7 vs. 9.4±6.7 years).Conclusions: Mucocutaneous lesions were reported by 48.1% of inflammatory bowel disease patients. The frequency of mucocutaneous lesions does not differ significantly between UC and CD, and a longer duration of illness is not a predictive factor for the appearance of lesions. More extensive UC is related to higher frequency of skin lesions. Erratum noteThe title, author's name, and abstract have been updated to reflect the correct information following a typographical error during typesetting. We apologize for any inconvenience caused by these errors. Corrections were made on 2024-09-01.