The lack of therapeutics along with complex pathophysiology made non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) a research hotspot. Studies showed that the deficiency of Vitamin D plays a vital role in NAFLD pathogenesis. While several research studies focused on vitamin D supplementation in NAFLD, there is still a need to understand the regulatory mechanism of direct vitamin D receptor activation in NAFLD. In the present study, we explored the role of direct Vitamin D receptor activation using paricalcitol in choline-deficient high-fat diet-induced NAFLD rat liver and its modulation on protein acetylation. Our results showed that paricalcitol administration significantly reduced the fat accumulation in HepG2 cells and the liver of NAFLD rats. Paricalcitol attenuated the elevated serum level of alanine transaminase, aspartate transaminase, insulin, low-density lipoprotein, triglyceride, and increased high-density lipoprotein in NAFLD rats. Paricalcitol significantly decreased the increased total protein acetylation by enhancing the SIRT1 and SIRT3 expression in NAFLD liver. Further, the study revealed that paricalcitol reduced the acetylation of NFκB and FOXO3a in NAFLD liver along with a decrease in the mRNA expression of IL1β, NFκB, TNFα, and increased catalase and MnSOD. Moreover, total antioxidant activity, glutathione, and catalase were also elevated, whereas lipid peroxidation, myeloperoxidase, and reactive oxygen species levels were significantly decreased in the liver of NAFLD after paricalcitol administration. The study concludes that the downregulation of SIRT1 and SIRT3 in NAFLD liver was associated with an increased acetylated NFκB and FOXO3a. Paricalcitol effectively reversed hepatic inflammation and oxidative stress in NAFLD rats through transcriptional regulation of NFκB and FOXO3a, respectively, by inhibiting their acetylation.

Abstract Untargeted LC/HRMS assays in metabolomics and exposomics aim to characterize the small molecule chemical space in a biospecimen. To gain maximum biological insights from these datasets, LC/HRMS peaks should be annotated with chemical and functional information including molecular formula, structure, chemical class and metabolic pathways. Among these, molecular formulas may be assigned to LC/HRMS peaks through matching theoretical and observed isotopic profiles (MS1) of the underlying ionized compound. For this, we have developed the Integrated Data Science Laboratory for Metabolomics and Exposomics – United Formula Annotation (IDSL.UFA) R package. In the untargeted metabolomics validation tests, IDSL.UFA assigned 54.31%-85.51% molecular formula for true positive annotations as the top hit, and 90.58%-100% within the top five hits. Molecular formula annotations were also supported by MS/MS data. We have implemented new strategies to 1) generate formula sources and their theoretical isotopic profiles 2) optimize the formula hits ranking for the individual and the aligned peak lists and 3) scale IDSL.UFA-based workflows for studies with larger sample sizes. Annotating the raw data for a publicly available pregnancy metabolome study using IDSL.UFA highlighted hundreds of new pregnancy related compounds, and also suggested presence of chlorinated perfluorotriether alcohols (Cl-PFTrEAs) in human specimens. IDSL.UFA is useful for human metabolomics and exposomics studies where we need to minimize the loss of biological insights in untargeted LC/HRMS datasets. The IDSL.UFA package is available in the R CRAN repository https://cran.r-project.org/package=IDSL.UFA . Detailed documentation and tutorials are also provided at www.ufa.idsl.me .

Various zinc anodes with increasing calcium zincate (0%, 30%, 70%, 100%) were cycled at 50% theoretical Zn utilization to investigate cycle life and estimated cost. Failure mechanisms of majority 70% Zn/30% CaZn anodes are compared with pure CaZn.