National Cancer Center (NCC) of China annually reports the nationwide statistics for cancer incidence and mortality using population-based cancer registry data from all available cancer registries in China. There were a total of 487 registries which reported high quality data of cancer incidence and mortality across China in 2016. The nationwide numbers of new cancer cases and deaths were estimated using the pooled cancer registry data, which were stratified by area (urban/rural), sex, age group (0, 1-4, 5-9, 10-14…85+) and cancer site for incidence and mortality, and then multiplied by corresponding national population. The world Segi's population was applied for the calculation of age-standardized rates. About 4,064,000 new cancer cases and 2,413,500 new cancer deaths occurred in China in 2016. Cancers of the lung, colon-rectum, stomach, liver and female breast were the top five common cancers, accounting for 57.4% of total cancer new cases. Cancers of the lung, liver, stomach, colon-rectum and esophagus were the five leading causes of cancer deaths, accounting for 69.3% of total cancer deaths. The crude and age-standardized incidence rates (ASIR) were 293.91 and 186.46 per 100,000 population, respectively. The crude mortality rate was 174.55/100,000 and the age-standardized mortality rate (ASMR) was 105.19/100,000. The ASIR was higher but the ASMR was lower in urban areas than that in rural areas. In past decades, the ASIR was relatively stable in males, but significantly increased by about 2.3% per year in females for overall cancers combined. In contrast, the ASMR significantly decreased by about 1.2% per year for both sexes during 2000-2016. Notably, the cancer-specific ASIR and ASMR of esophageal, stomach, and liver cancers decreased significantly, whereas both rates for cancers of the colon-rectum, prostate, female breast, cervix, and thyroid increased significantly. Cancer remains a major public health problem in China, which demands long-term collaborative efforts of a broad community. With the national guideline on cancer prevention and control, tailored cancer prevention and control programs are needed in different regions to help reduce the burden of these highly fatal diseases in China.

Immune homeostasis is essential for the normal functioning of the immune system, and its breakdown leads to fatal inflammatory diseases. We report here the identification of a member of the tumor necrosis factor-alpha-induced protein-8 (TNFAIP8) family, designated TIPE2, that is required for maintaining immune homeostasis. TIPE2 is preferentially expressed in lymphoid tissues, and its deletion in mice leads to multiorgan inflammation, splenomegaly, and premature death. TIPE2-deficient animals are hypersensitive to septic shock, and TIPE2-deficient cells are hyper-responsive to Toll-like receptor (TLR) and T cell receptor (TCR) activation. Importantly, TIPE2 binds to caspase-8 and inhibits activating protein-1 and nuclear factor-kappaB activation while promoting Fas-induced apoptosis. Inhibiting caspase-8 significantly blocks the hyper-responsiveness of TIPE2-deficient cells. These results establish that TIPE2 is an essential negative regulator of TLR and TCR function, and its selective expression in the immune system prevents hyperresponsiveness and maintains immune homeostasis.

The echinoderm microtubule-associated protein-like 4-anaplastic lymphoma kinase (EML4-ALK) fusion gene has been identified as an oncogene in a subset of non-small cell lung cancers (NSCLC). We used profiling of cancer genomes on an exon array to develop a novel computational method for the global search of gene rearrangements. This approach led to the detection of EML4-ALK fusion in breast and colorectal carcinomas in addition to NSCLC. Screening of a large collection of patient tumor samples showed the presence of EML4-ALK fusion in 2.4% of breast (5 of 209), 2.4% of colorectal (2 of 83), and in 11.3% of NSCLC (12 of 106). Besides previously known EML4-ALK variants 1 (E13; A20) and 2 (E20; A20), a novel variant E21; A20 was found in colorectal carcinoma. The presence of an EML-ALK rearrangement was verified by identifying genomic fusion points in tumor samples representative of breast, colon, and NSCLC. EML4-ALK translocation was also confirmed by fluorescence in situ hybridization assay, which revealed its substantial heterogeneity in both primary tumors and tumor-derived cell lines. To elucidate the functional significance of EML4-ALK, we examined the growth of cell lines harboring the fusion following EML4 and ALK silencing by small interfering RNA. Significant growth inhibition was observed in some but not all cell lines, suggesting their variable dependence on ALK-mediated cell survival signaling. Collectively, these findings show the recurrence of EML4-ALK fusion in multiple solid tumors and further substantiate its role in tumorigenesis.

Mutations in PINK1 (PTEN-induced putative kinase 1) cause early onset familial Parkinson's disease (PD). PINK1 accumulates on the outer membrane of damaged mitochondria followed by recruiting parkin to promote mitophagy. Here, we demonstrate that BCL2/adenovirus E1B 19-kDa interacting protein 3 (BNIP3), a mitochondrial BH3-only protein, interacts with PINK1 to promote the accumulation of full-length PINK1 on the outer membrane of mitochondria, which facilitates parkin recruitment and PINK1/parkin-mediated mitophagy. Inactivation of BNIP3 in mammalian cells promotes PINK1 proteolytic processing and suppresses PINK1/parkin-mediated mitophagy. Hypoxia-induced BNIP3 expression results in increased expression of full-length PINK1 and mitophagy. Consistently, expression of BNIP3 in Drosophila suppresses muscle degeneration and the mitochondrial abnormality caused by PINK1 inactivation. Together, the results suggest that BNIP3 plays a vital role in regulating PINK1 mitochondrial outer membrane localization, the proteolytic process of PINK1 and PINK1/parkin-mediated mitophagy under physiological conditions. Functional up-regulation of BNIP3 may represent a novel therapeutic strategy to suppress the progression of PD.

Abstract The mammalian spinal cord functions as a community of glial and neuronal cell types to accomplish sensory processing, autonomic control, and movement; conversely, the dysfunction of these cell types following spinal cord injury or disease states can lead to chronic pain, paralysis, and death. While we have made great strides in understanding spinal cellular diversity in animal models, it is crucial to characterize human biology directly to uncover specialized features of basic function and to illuminate human pathology. Here, we present a cellular taxonomy of the adult human spinal cord using single nucleus RNA-sequencing with spatial transcriptomics and antibody validation. We observed 29 glial clusters, including rare cell types such as ependymal cells, and 35 neuronal clusters, which we found are organized principally by anatomical location. To demonstrate the potential of this resource for understanding human disease, we analyzed the transcriptome of spinal motoneurons that are prone to degeneration in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and other diseases. We found that, compared with all other spinal neurons, human motoneurons are defined by genes related to cell size, cytoskeletal structure, and ALS, thereby supporting a model of a specialized motoneuron molecular repertoire that underlies their selective vulnerability to disease. We include a publicly available browsable web resource with this work, in the hope that it will catalyze future discoveries about human spinal cord biology.

ABSTRACT Low‐temperature stress limits plant growth, and reduces aesthetics of many ornamental plants. Plants have developed different adaptive mechanisms to cope with low‐temperature stress, in which NAC transcription factor family members playing an important role in low‐temperature tolerance. However, their roles in petunia in response to low temperature are still largely unknown. Here, we found that a NAC transcription factor, namely, PhNH10, negatively regulates low‐temperature response in petunia. PhNH10 ‐silenced and ‐ CRISPR/Cas9 mutant plants displayed higher survival rate, anthocyanin content and abscisic acid concentration than PhNH10 ‐overexpression and wild‐type plants under low‐temperature condition. PhNH10 can directly bind to the PhABA8ox promoter to active its expression, which further promotes the abscisic acid catabolism, while silencing of PhABA8ox increased the ABA concentration and low‐temperature tolerance. In addition, PhNH10 interact with a low‐temperature‐related E2 ubiquitin‐conjugating enzyme, PhUBC2‐1, which in turn inhibited the binding capacity of PhNH10 on PhABA8ox promoter. Our research has elucidated an extensive mechanistic network underlying the PhNH10‐mediated regulation of low‐temperature response in petunia. This finding not only presents a new viewpoint in understanding the low‐temperature tolerance mechanisms but also delineates a promising pathway for transgenic petunia with improved low‐temperature resistance.

Abstract We developed an automated high-throughput Smart-seq3 (HT Smart-seq3) workflow that integrates best practices and an optimized protocol to enhance efficiency, scalability, and method reproducibility. This workflow consistently produces high-quality data with high cell capture efficiency and gene detection sensitivity. In a rigorous comparison with the 10X platform using human primary CD4 + T-cells, HT Smart-seq3 demonstrated higher cell capture efficiency, greater gene detection sensitivity, and lower dropout rates. Additionally, when sufficiently scaled, HT Smart-seq3 achieved a comparable resolution of cellular heterogeneity to 10X. Notably, through T-cell receptor (TCR) reconstruction, HT Smart-seq3 identified a greater number of productive alpha and beta chain pairs without the need for additional primer design to amplify full-length V(D)J segments, enabling more comprehensive TCR profiling across a broader range of species. Taken together, HT Smart-seq3 overcomes key technical challenges, offering distinct advantages that position it as a promising solution for the characterization of single-cell transcriptomes and immune repertoires, particularly well-suited for low-input, low-RNA content samples.

Titanium dioxide nanoparticles (TiO

Abstract Inflammatory bowel disease (IBD) poses a significant challenge due to its intricate pathogenesis. NSD2, a histone methyltransferase responsible for dimethylating histone 3 at lysine 36, is associated with transcriptional activation. However, the precise role of NSD2 in IBD remains unexplored. In this study, we discovered a downregulation of NSD2 in both the intestinal epithelial cells (IECs) of patients and the IBD mouse model. Deficiency of NSD2 in mouse IECs aggravated epithelial barrier disruption and inflammatory response in IBD. Mechanically, NSD2 loss downregulated H3K36me2 and FMO (taurine-synthesis enzyme) mRNA in IECs, resulting in decreased taurine biosynthesis in IECs. Importantly, supplementation with taurine significantly attenuated the symptoms of NSD2 deficiency-induced IBD. These data demonstrate that NSD2 plays a pivotal role in maintaining FMOs-mediated taurine biosynthesis to prevent intestinal inflammation. Our findings also underscore the importance of NSD2-H3K36me2-mediated taurine biosynthesis in maintaining intestinal mucosal barrier homeostasis.