Bat Genomes Bats are of great interest because of their ability to fly and as hosts for infectious disease. Zhang et al. (p. 456 , published online 20 December) sequenced the genomes of two distantly related bat species, David's Myotis and Black flying fox. Analysis of the two genomes revealed likely changes that accompanied the evolution of bats, including selection for increased expression of genes involved in the oxidative phosphorylation pathway needed to generate the energy required for flight. Furthermore, while some immune genes have been lost, others are under positive selection, which may potentially explain bats' status as viral reservoirs.

We report the isolation and characterization of a novel bat coronavirus which is much closer to the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) in genomic sequence than others previously reported, particularly in its S gene. Cell entry and susceptibility studies indicated that this virus can use ACE2 as a receptor and infect animal and human cell lines. Our results provide further evidence of the bat origin of the SARS-CoV and highlight the likelihood of future bat coronavirus emergence in humans.

Abstract Posttranslational neddylation of cullins in the Cullin-Ring E3 ligase (CRL) complexes is needed for proteolytic degradation of CRL substrates, whose accumulation induces cell-cycle arrest, apoptosis, and senescence. The Nedd8-activating enzyme (NAE) is critical for neddylation of CRL complexes and their growth-promoting function. Recently, the anticancer small molecule MLN4924 currently in phase I trials was determined to be an inhibitor of NAE that blocks cullin neddylation and inactivates CRL, triggering an accumulation of CRL substrates that trigger cell-cycle arrest, apoptosis, and senescence in cancer cells. Here, we report that MLN4924 also triggers autophagy in response to CRL inactivation and that this effect is important for the ability of MLN4924 to suppress the outgrowth of liver cancer cells in vitro and in vivo. MLN4924-induced autophagy was attributed partially to inhibition of mTOR activity, due to accumulation of the mTOR inhibitory protein Deptor, as well as to induction of reactive oxygen species stress. Inhibiting autophagy enhanced MLN4924-induced apoptosis, suggesting that autophagy is a survival signal triggered in response to CRL inactivation. In a xenograft model of human liver cancer, MLN4924 was well-tolerated and displayed a significant antitumor effect characterized by CRL inactivation and induction of autophagy and apoptosis in liver cancer cells. Together, our findings support the clinical investigation of MLN4924 for liver cancer treatment and provide a preclinical proof-of-concept for combination therapy with an autophagy inhibitor to enhance therapeutic efficacy. Cancer Res; 72(13); 3360–71. ©2012 AACR.

Abstract Generative drug design facilitates the creation of compounds effective against pathogenic target proteins. This opens up the potential to discover novel compounds within the vast chemical space and fosters the development of innovative therapeutic strategies. However, the practicality of generated molecules is often limited, as many designs focus on a narrow set of drug-related properties, failing to improve the success rate of subsequent drug discovery process. To overcome these challenges, we develop TamGen, a method that employs a GPT-like chemical language model and enables target-aware molecule generation and compound refinement. We demonstrate that the compounds generated by TamGen have improved molecular quality and viability. Additionally, we have integrated TamGen into a drug discovery pipeline and identified 7 compounds showing compelling inhibitory activity against the Tuberculosis ClpP protease, with the most effective compound exhibiting a half maximal inhibitory concentration (IC 50 ) of 1.9 μM. Our findings underscore the practical potential and real-world applicability of generative drug design approaches, paving the way for future advancements in the field.

Mounting evidence in animal experiments proves that early life stage exposure to organophosphate flame retardants (OPFRs) affects the locomotor behavior and changes the transcriptions of central nervous system genes. Unfortunately, their effect on human motor neuron (MN) development, which is necessary for body locomotion and survival, has not yet characterized. Here, we utilized a spinal cord MN differentiation model from human embryonic stem cells (ESCs) and adopted this model to test the effects of two typical OPFRs tris (2-butoxyethyl) phosphate (TBEP) and tris (2-chloroethyl) phosphate (TCEP), on MN development and the possible mechanisms underlying. Our findings revealed TBEP exerted a much more inhibitory effect on MN survival, while TCEP exhibited a stronger stimulatory effect on ESCs differentiation into MN, and thus TBEP exhibited a stronger inhibition on MN development than TCEP. RNA sequencing analysis identified TBEP and TCEP inhibited MN survival mainly by disrupting extracellular matrix (ECM)-receptor interaction. Focusing on the pathway guided MN differentiation, we found both TBEP and TCEP activated BMP signaling, whereas TCEP simultaneously downregulated Wnt signaling. Collectively, this is the first study demonstrated TBEP and TCEP disrupted human MN development by affecting their survival and differentiation, thereby raising concern about their potential harm in causing MN disorders.