YL
Yixin Li
Author with expertise in Wound Healing and Regeneration
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(100% Open Access)
Cited by:
4
h-index:
9
/
i10-index:
9
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Spike N354 glycosylation augments SARS-CoV-2 fitness for human adaptation through multiple mechanisms

Pan Liu et al.Jan 30, 2024
SUMMARY Selective pressures have given rise to a number of SARS-CoV-2 variants during the prolonged course of the COVID-19 pandemic. Recently evolved variants differ from ancestors in additional glycosylation within the spike protein receptor-binding domain (RBD). Details of how the acquisition of glycosylation impacts viral fitness and human adaptation are not clearly understood. Here, we dissected the role of N354-linked glycosylation, acquired by BA.2.86 sub-lineages, as a RBD conformational control element in attenuating viral infectivity. The reduced infectivity could be recovered in the presence of heparin sulfate, which targets the “N354 pocket” to ease restrictions of conformational transition resulting in a “RBD-up” state, thereby conferring an adjustable infectivity. Furthermore, N354 glycosylation improved spike cleavage and cell-cell fusion, and in particular escaped one subset of ADCC antibodies. Together with reduced immunogenicity in hybrid immunity background, these indicate a single spike amino acid glycosylation event provides selective advantage in humans through multiple mechanisms. HIGHLIGHTS N354 glycosylation acts as a conformational control element to modulate infectivity Reduced infectivity could be recovered by altered binding mode of heparin sulfate N354 glycosylation improved fusogenicity and conferred escape from ADCC antibodies N354 glycosylation reduced immunogenicity and conferred immune evasion
0
Citation2
0
Save
0

Acoustic virtual 3D scaffold for direct-interacting tumor organoid–immune cell coculture systems

Shan Han et al.Nov 22, 2024
Three-dimensional (3D) cell culture has revolutionized life sciences, particularly in organoid technologies. Traditional bioscaffold materials, however, complicate the detachment of tumor organoids and hamper the routine use of organoid–immune cell cocultures. Here, we show an acoustic virtual 3D scaffold (AV-Scaf) method to achieve 3D tumor organoid culture, enabling a direct-interacting tumor organoid–immune cell coculture system. The self-organization process of tumor cells is facilitated by a vortex acoustic field, which enables the cell bioassembly and ion channel activation. This approach can significantly enhance the influx of calcium ions, thereby accelerating intercellular interactions of cellular assemblies. We established scaffold-free melanoma and breast cancer organoids using AV-Scaf and cocultured melanoma organoids with T cells. We found that our coculture system resulted in a high activation state of T cells, characterized by notable up-regulation of granzyme B (2.82 to 17.5%) and interferon-γ (1.36 to 16%). AV-Scaf offers an efficient method for tumor organoid–immune cell studies, advancing cancer research and immunotherapy development.
0
Citation2
0
Save