XZ
Xiang Zhou
Author with expertise in Insulin-like Growth Factors in Health and Disease
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(100% Open Access)
Cited by:
5
h-index:
28
/
i10-index:
61
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Single nucleus multi-omics regulatory atlas of the murine pituitary

Frederique Ruf-Zamojski et al.Jun 7, 2020
Abstract The pituitary regulates growth, reproduction and other endocrine systems. To investigate transcriptional network epigenetic mechanisms, we generated paired single nucleus (sn) transcriptome and chromatin accessibility profiles in single mouse pituitaries and genome-wide sn methylation datasets. Our analysis provided insight into cell type epigenetics, regulatory circuit and gene control mechanisms. Latent variable pathway analysis detected corresponding transcriptome and chromatin accessibility programs showing both inter-sexual and inter-individual variation. Multi-omics analysis of gene regulatory networks identified cell type-specific regulons whose composition and function were shaped by the promoter accessibility state of target genes. Co-accessibility analysis comprehensively identified putative cis-regulatory regions, including a domain 17kb upstream of Fshb that overlapped the fertility-linked rs11031006 human polymorphism. In vitro CRISPR-deletion at this locus increased Fshb levels, supporting this domain’s inferred regulatory role. The sn pituitary multi-omics atlas (snpituitaryatlas.princeton.edu) is a public resource for elucidating cell type-specific gene regulatory mechanisms and principles of transcription circuit control.
0
Citation3
0
Save
0

Exosomal PSM-E inhibits macrophage M2 polarization to suppress prostate cancer metastasis through the RACK1 signaling axis

Xingliang Qin et al.Nov 14, 2024
Abstract Background It is well-established that understanding the mechanism of prostate cancer (PCa)-associated metastasis is paramount for improving its prognosis. Metastasis is known to involve the communication between tumor-associated macrophages (TAMs) and tumor cells. Exosomes are crucial in mediating this intercellular communication within the tumor microenvironment. Nonetheless, the role of exosomal proteins in PCa metastasis is not yet fully understood. Here, we investigated the mechanisms of prostate cancer-derived exosomal PSM-E on regulating macrophage M2 polarization to suppress tumor invasion and metastasis. Methods PSM-E levels in exosomes were detected by transmission electron microscopy and Western blotting analysis. The diagnostic value of urine-derived exosomal PSM-E in PCa were evaluated by LC-MS/MS, correlation analysis, and ROC curves analysis. The mechanisms underlying the inhibitory effect of exosomal PSM-E on the M2 polarization of macrophages was investigated by co-IP, IHC staining, and PCa tumorigenesis model, etc. Results We revealed that exosomal PSM-E is upregulated in exosomes derived from the serum and urine of PCa patients. Clinically, an elevated exosomal PSM-E expression in urine is significantly correlated with an advanced pathological tumor stage and a high Gleason score. Our research also revealed that exosomal PSM-E inhibits prostate cancer cell proliferation, invasion, and metastasis by suppressing macrophage polarization in vitro and in vivo. Furthermore, we provided compelling evidence that exosomal PSM-E inhibits M2 polarization of macrophages by recruiting RACK1 and suppressing the FAK and ERK signaling pathways, consequently suppressing PCa invasion and metastasis. Furthermore, we found that the protease-associated domain of PSM-E and the fourth tryptophan-aspartate repeat of RACK1 are crucial for the interaction between PSM-E and RACK1. Conclusions Notably, exosomes carrying PSM-E from PCa urine could potentially serve as a biomarker for PCa, and targeting exosomal PSM-E may represent a strategy for preventing tumor progression in this patient population.