Abstract Identifying tumor antigen-specific T cells from cancer patients has important implications for immunotherapy diagnostics and therapeutics. Here, we show that CD103 + CD39 + tumor-infiltrating CD8 T cells (CD8 TIL) are enriched for tumor-reactive cells both in primary and metastatic tumors. This CD8 TIL subset is found across six different malignancies and displays an exhausted tissue-resident memory phenotype. CD103 + CD39 + CD8 TILs have a distinct T-cell receptor (TCR) repertoire, with T-cell clones expanded in the tumor but present at low frequencies in the periphery. CD103 + CD39 + CD8 TILs also efficiently kill autologous tumor cells in a MHC-class I-dependent manner. Finally, higher frequencies of CD103 + CD39 + CD8 TILs in patients with head and neck cancer are associated with better overall survival. Our data thus describe an approach for detecting tumor-reactive CD8 TILs that will help define mechanisms of existing immunotherapy treatments, and may lead to future adoptive T-cell cancer therapies.

The perfluoroalkyl acid salts (both carboxylates and sulfonates, hereafter designated as PFAAs) and their derivatives are important chemicals that have numerous consumer and industrial applications. However, recent discoveries that some of these compounds have global distribution, environmental persistence, presence in humans and wildlife, as well as toxicity in laboratory animal models, have generated considerable scientific, regulatory, and public interest on an international scale. The Society of Toxicology Contemporary Concepts in Toxicology Symposium, entitled "Perfluoroalkyl Acids and Related Chemistries: Toxicokinetics and Modes-of-Action Workshop" was held February 14-16, 2007 at the Westin Arlington Gateway, Arlington, VA. In addition to the Society of Toxicology, this symposium was sponsored by 3M Company, DuPont, Plastics Europe, and the U.S. Environmental Protection Agency. The objectives of this 3-day meeting were to (1) provide an overview of PFAA toxicity and description of recent findings with the sulfonates, carboxylates, and telomer alcohols; (2) address the toxicokinetic profiles of various PFAAs among animal models and humans, and the biological processes that are responsible for these observations; (3) examine the possible modes of action that determine the PFAA toxicities observed in animal models, and their relevance to human health risks; and (4) identify the critical research needs and strategies to fill the existing informational gaps that hamper risk assessment of these chemicals. This report summarizes the discourse that occurred during the symposium.

PURPOSE Precision therapies and immunotherapies have revolutionized cancer care, with novel genomic biomarker-associated therapies being introduced into clinical practice rapidly, resulting in notable gains in patient survival. Despite this, there is significant variability in the utilization of tumor molecular profiling that spans the timing of test ordering, comprehensiveness of gene panels, and clinical decision support through therapy and trial recommendations. METHODS To standardize testing, we designed a pathologist-directed test ordering system at the time of diagnosis using a 523-gene DNA/RNA hybrid comprehensive genomic profiling (CGP) panel and extensive clinical decision support tools. To comprehensively characterize the clinical impact of this protocol, we developed a novel natural language processing (NLP)–based approach to extract clinical features from physician chart notes. We assessed test actionability rates, therapy choice, and outcomes across a set of 3,216 patients with advanced cancer. RESULTS We observed 49% of patients had at least one actionable genomic biomarker-driven–approved and/or guideline-recommended targeted or immunotherapy (IO) and 53% of patients would have been eligible for a precision therapy clinical trial from three large basket trials. When assessing CGP versus an in silico 50-gene panel, 67% of tumors compared with 33% harbored actionable alterations including clinical trials. Among patients with 6 months or more of follow-up, over 52% received a targeted therapy (TT) or IO, versus 32% who received conventional chemotherapy alone. Furthermore, patients receiving TT had significantly improved overall survival compared with patients receiving chemotherapy alone ( P < .001). CONCLUSION Overall, these data represent a major shift in standard clinical practice toward molecularly guided treatments (targeted and immunotherapies) over conventional systemic chemotherapy. As guidelines continue to evolve and more precision therapeutics gain approval, we expect this gap to continue to widen.