Degradation of coral reef ecosystems began centuries ago, but there is no global summary of the magnitude of change. We compiled records, extending back thousands of years, of the status and trends of seven major guilds of carnivores, herbivores, and architectural species from 14 regions. Large animals declined before small animals and architectural species, and Atlantic reefs declined before reefs in the Red Sea and Australia, but the trajectories of decline were markedly similar worldwide. All reefs were substantially degraded long before outbreaks of coral disease and bleaching. Regardless of these new threats, reefs will not survive without immediate protection from human exploitation over large spatial scales.

Abstract Intergenerational loss of information about the abundance of exploited species can lead to shifting baselines, which have direct consequences for how species and ecosystems are managed. Historical data provide a means of regaining that information, but they still are not commonly applied in marine conservation and management. Omission of relevant historical information typically results in assessments of conservation status that are more optimistic, recovery targets that are lower, and fisheries quotas that are higher than if long‐term data were considered. Here, we review data and methods that can be used to estimate historical baselines for marine species including bony fishes, sharks, turtles, and mammals, demonstrate how baselines used in management change when historical data are included, and provide specific examples of how data from the past can be applied in management and conservation including extinction risk assessment, recovery target setting, and management of data‐poor fisheries. Incorporating historical data into conservation and management frameworks presents challenges, but the alternative—losing information on past population sizes and ecological variability—represents a greater risk to effective management of marine species and ecosystems.

Abstract Historical information has provided key insights into long‐term ecological change to marine species and ecosystems, with value to fisheries. Yet, pathways to integrate these diverse data sources into fisheries decision‐making have not been clear. Here, we identify an array of biological, ecological, and social information suitable for contemporary science‐based decision‐making, derived from local ecological knowledge, historical archives, archaeological middens and palaeoecological material. We outline two broad pathways to integrate these historical data into fisheries decision‐making, demonstrating that data‐driven use of historical information is relevant across a range of management contexts. First, historical information can inform fisheries assessments that range from simple to complex, affecting indicators of stock status. Second, it can inform estimates of biological potential and social preference, affecting the choice of fisheries reference points. Using the Caribbean Sea as an example, we illustrate these ideas with case studies representing diverse species and historical data types. Integrating historical data can improve indicators of the current state of fish populations and result in management decisions based on a more complete understanding of a potential range of variation, avoiding shifted baselines. The urgency of this work is underscored by accelerating environmental changes and the rapid loss of invaluable historical information sources. By illuminating pathways, our goal is to increase the accessibility of these types of information and to underscore that scientists, managers, and resource users have roles to play in identifying and integrating relevant long‐term data at various spatial and temporal scales to sustainably manage marine fisheries.