TB
Thomas Bird
Author with expertise in Molecular Mechanisms of Neurodegenerative Diseases
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(58% Open Access)
Cited by:
3,554
h-index:
65
/
i10-index:
147
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Axonal neuropathy with optic atrophy is caused by mutations in mitofusin 2

Stephan Züchner et al.Jan 25, 2006
Abstract Objective Charcot‐Marie‐Tooth (CMT) neuropathy with visual impairment due to optic atrophy has been designated as hereditary motor and sensory neuropathy type VI (HMSN VI). Reports of affected families have indicated autosomal dominant and recessive forms, but the genetic cause of this disease has remained elusive. Methods Here, we describe six HMSN VI families with a subacute onset of optic atrophy and subsequent slow recovery of visual acuity in 60% of the patients. Detailed clinical and genetic studies were performed. Results In each pedigree, we identified a unique mutation in the gene mitofusin 2 ( MFN2 ). In three families, the MFN2 mutation occurred de novo; in two families the mutation was subsequently transmitted from father to son indicating autosomal dominant inheritance. Interpretation MFN2 is a mitochondrial membrane protein that was recently reported to cause axonal CMT type 2A. It is intriguing that MFN2 shows functional overlap with optic atrophy 1 (OPA1), the protein underlying the most common form of autosomal dominant optic atrophy, and mitochondrial encoded oxidative phosphorylation components as seen in Leber's hereditary optic atrophy. We conclude that autosomal dominant HMSN VI is caused by mutations in MFN2 , emphasizing the important role of mitochondrial function for both optic atrophies and peripheral neuropathies. Ann Neurol 2006;59:276–281
0
Citation353
0
Save
0

Actionable exomic incidental findings in 6503 participants: challenges of variant classification

Laura Amendola et al.Jan 30, 2015
Recommendations for laboratories to report incidental findings from genomic tests have stimulated interest in such results. In order to investigate the criteria and processes for assigning the pathogenicity of specific variants and to estimate the frequency of such incidental findings in patients of European and African ancestry, we classified potentially actionable pathogenic single-nucleotide variants (SNVs) in all 4300 European- and 2203 African-ancestry participants sequenced by the NHLBI Exome Sequencing Project (ESP). We considered 112 gene-disease pairs selected by an expert panel as associated with medically actionable genetic disorders that may be undiagnosed in adults. The resulting classifications were compared to classifications from other clinical and research genetic testing laboratories, as well as with in silico pathogenicity scores. Among European-ancestry participants, 30 of 4300 (0.7%) had a pathogenic SNV and six (0.1%) had a disruptive variant that was expected to be pathogenic, whereas 52 (1.2%) had likely pathogenic SNVs. For African-ancestry participants, six of 2203 (0.3%) had a pathogenic SNV and six (0.3%) had an expected pathogenic disruptive variant, whereas 13 (0.6%) had likely pathogenic SNVs. Genomic Evolutionary Rate Profiling mammalian conservation score and the Combined Annotation Dependent Depletion summary score of conservation, substitution, regulation, and other evidence were compared across pathogenicity assignments and appear to have utility in variant classification. This work provides a refined estimate of the burden of adult onset, medically actionable incidental findings expected from exome sequencing, highlights challenges in variant classification, and demonstrates the need for a better curated variant interpretation knowledge base.
0
Citation323
0
Save
0

C9orf72 Hexanucleotide Repeat in Huntington-Like Patients: Systematic Review and Meta-Analysis

Carlos Alva‐Díaz et al.Nov 2, 2020
Introduction: Patients with Huntington-Like disorders (HLD) comprise a variety of allelic disorders sharing a Huntington phenotype. The hexanucleotide repeat expansion of the C9orf72 gene could explain part of the HLD etiology. Our aim was to conduct a systematic review and meta-analysis looking for the frequency of the hexanucleotide repeat expansion of the C9orf72 gene in patients with Huntington-Like disorders. Methods: The protocol was registered on the International Prospective Register of Systematic Reviews database (PROSPERO) (registration number: CRD42018105465). The search was carried out in Medline, Scopus, Web of Science, and Embase in April 2018. Observational studies reporting patients with HLD carrying the hexanucleotide repeat expansion in the C9orf72 gene were selected and revised; this process was carried out in duplicate. The cutoff threshold for considering the hexanucleotide expansion as a pathogenic variant was equal to or greater than 30 G4C2 repeats. Pooled frequency and 95% CI were calculated using random-effects models. Results: Nine out of 212 studies were selected, reporting a total of 1421 affected individuals with HLD. Among them, 24 individuals carried C9orf72 expansion, representing a 1% (95%CI: 0-2%, I2=55.3%) of the pooled frequency. Seven selected studies came from European centers, one was reported at a US center, and one came from a South-African center. Individuals carrying the C9orf72 repeat expansion experienced psychiatric and chorea-type motor and parkinsonism symptoms. Conclusions: The estimated frequency of C9orf72 unstable hexanucleotide repeat expansion in patients with HLD is very low.
0
Citation6
0
Save
1

CCG•CGG interruptions in high penetrance SCA8 families increase RAN translation and protein toxicity

Bárbaro Pérez et al.Feb 10, 2021
Abstract Spinocerebellar ataxia type 8 (SCA8), a dominantly inherited neurodegenerative disorder caused by a CTG•CAG expansion, is unusual because most individuals that carry the mutation do not develop ataxia. To understand the variable penetrance of SCA8 we studied the molecular differences between highly penetrant families and more common sporadic cases (82%) using a large cohort of SCA8 families (N=77). We show that repeat expansion mutations from individuals with two or more affected family members have CCG•CGG interruptions at a higher frequency than sporadic SCA8 cases and that the number of CCG•CGG interruptions correlates with age at onset. At the molecular level, CCG•CGG interruptions increase RNA hairpin stability and steady state levels of SCA8 RAN polyAla and polySer proteins. Additionally, the CCG•CGG interruptions, which encode arginine interruptions in the polyGln frame increase the toxicity of the resulting proteins. In summary, CCG•CGG interruptions increase polyAla and polySer RAN protein levels, polyGln protein toxicity and disease penetrance and provide novel insight into the molecular differences between SCA8 families with high vs. low disease penetrance.
1
Citation1
0
Save
Load More