Pediatric low-grade gliomas (pLGG) are frequently driven by genetic alterations in the RAS-mitogen-activated protein kinase (RAS/MAPK) pathway yet show unexplained variability in their clinical outcome. To address this, we characterized a cohort of >1,000 clinically annotated pLGG. Eighty-four percent of cases harbored a driver alteration, while those without an identified alteration also often exhibited upregulation of the RAS/MAPK pathway. pLGG could be broadly classified based on their alteration type. Rearrangement-driven tumors were diagnosed at a younger age, enriched for WHO grade I histology, infrequently progressed, and rarely resulted in death as compared with SNV-driven tumors. Further sub-classification of clinical-molecular correlates stratified pLGG into risk categories. These data highlight the biological and clinical differences between pLGG subtypes and opens avenues for future treatment refinement.

Mutations in leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) are the most common cause of genetic Parkinson disease (PD) known to date. The clinical features of manifesting LRRK2 mutation carriers are generally indistinguishable from those of patients with sporadic PD. However, some PD cases associated with LRRK2 mutations lack Lewy bodies (LBs), a neuropathological hallmark of PD. We investigated whether the presence or absence of LBs correlates with different clinical features in LRRK2-related PD.We describe genetic, clinical, and neuropathological findings of 37 cases of LRRK2-related PD including 33 published and 4 unpublished cases through October 2013. Among the different mutations, the LRRK2 p.G2019S mutation was most frequently associated with LB pathology. Nonmotor features of cognitive impairment/dementia, anxiety, and orthostatic hypotension were correlated with the presence of LBs. In contrast, a primarily motor phenotype was associated with a lack of LBs.To our knowledge, this is the first report of clinicopathological correlations in a series of LRRK2-related PD cases. Findings from this selected group of patients with PD demonstrated that parkinsonian motor features can occur in the absence of LBs. However, LB pathology in LRRK2-related PD may be a marker for a broader parkinsonian symptom complex including cognitive impairment.

We examined recovery from postconcussion syndrome (PCS) in a series of 285 patients diagnosed with concussion based on international sport concussion criteria who received a questionnaire regarding recovery. Of 141 respondents, those with postconcussion symptoms lasting less than 3 months, a positive computed tomography (CT) and/or magnetic resonance imaging (MRI), litigants, and known Test of Memory Malingering (TOMM)-positive cases were excluded, leaving 110 eligible respondents. We found that only 27% of our population eventually recovered and 67% of those who recovered did so within the first year. Notably, no eligible respondent recovered from PCS lasting 3 years or longer. Those who did not recover (n = 80) were more likely to be non-compliant with a do-not-return-to-play recommendation (p = 0.006) but did not differ from the recovered group (n = 30) in other demographic variables, including age and sex (p ≥ 0.05). Clustergram analysis revealed that symptoms tended to appear in a predictable order, such that symptoms later in the order were more likely to be present if those earlier in the order were already present. Cox proportional hazards model analysis showed that the more symptoms reported, the longer the time to recovery (p = 7.4 × 10-6), with each additional symptom reducing the recovery rate by approximately 20%. This is the first longitudinal PCS study to focus on PCS defined specifically as a minimum of 3 months of symptoms, negative CT and/or MRI, negative TOMM test, and no litigation. PCS may be permanent if recovery has not occurred by 3 years. Symptoms appear in a predictable order, and each additional PCS symptom reduces recovery rate by 20%. More long-term follow-up studies are needed to examine recovery from PCS.

Abstract BACKGROUND High-grade gliomas (HGG) in children are a heterogeneous group of central nervous system (CNS) tumors that are very aggressive and highly malignant. Few patients achieve long-term survival despite decades of clinical trials. International collaborations have sought to better describe and understand the genetic underpinnings of pediatric HGG in hopes to uncover more effective treatment options. We report two HGG cases of young children with a YAP1-MAML2 fusion. METHODS Clinical data was collected retrospectively, and pathology was reviewed to confirm the diagnosis. RNA sequencing was performed using the Illumina TruSight RNA Pan-cancer Next Generation Sequencing Panel. Methylation profiling was completed using the HumanMethylation450 BeadChip platform (Illumina, San Diego, CA). RESULTS Two children ages less than 5 years with HGG were identified to have the YAP1-MAML2 fusion. One child was diagnosed at age 4 years and had an additional somatic BRAF V600D mutation. The child was treated initially with surgical debulking and cisplatin-based chemotherapy but had rapid clinical and radiologic progression. Due to the BRAF V600D mutation, the child started Dabrafenib and Trametinib but continued to have rapid craniospinal dissemination and died within 8 weeks of presentation. The second child was diagnosed at age 2 years and had an additional oncogenic PTENpF341V mutation. DNA methylation profiling on this tumor did not show evidence of clustering with any known CNS tumor entity. This child was treated with surgical debulking, chemotherapy (Baby POG), focal radiation 5400cGy, and maintenance chemotherapy (lomustine and temozolomide as per COG ACNS 0423). This child continues to have stable residual disease 29 months from presentation. CONCLUSION We present two cases of HGG in young children with a unique YAP1-MAML2 fusion. Future studies are needed to further characterize the significance of how this new molecular alteration impacts treatment and long-term outcomes in pediatric HGG.

Abstract Background Progressive supranuclear palsy (PSP) is a rare neurodegenerative disease characterized by the accumulation of aggregated tau proteins in astrocytes, neurons, and oligodendrocytes. Previous genome-wide association studies for PSP were based on genotype array, therefore, were inadequate for the analysis of rare variants as well as larger mutations, such as small insertions/deletions (indels) and structural variants (SVs). Method In this study, we performed whole genome sequencing (WGS) and conducted association analysis for single nucleotide variants (SNVs), indels, and SVs, in a cohort of 1,718 cases and 2,944 controls of European ancestry. Of the 1,718 PSP individuals, 1,441 were autopsy-confirmed and 277 were clinically diagnosed. Results Our analysis of common SNVs and indels confirmed known genetic loci at MAPT , MOBP , S TX6 , SLCO1A2 , DUSP10 , and SP1 , and further uncovered novel signals in APOE , FCHO1/MAP1S, KIF13A, TRIM24, TNXB, and ELOVL1 . Notably, in contrast to Alzheimer’s disease (AD), we observed the APOE ε2 allele to be the risk allele in PSP. Analysis of rare SNVs and indels identified significant association in ZNF592 and further gene network analysis identified a module of neuronal genes dysregulated in PSP. Moreover, seven common SVs associated with PSP were observed in the H1/H2 haplotype region (17q21.31) and other loci, including IGH , PCMT1 , CYP2A13 , and SMCP . In the H1/H2 haplotype region, there is a burden of rare deletions and duplications ( P = 6.73 × 10 –3 ) in PSP. Conclusions Through WGS, we significantly enhanced our understanding of the genetic basis of PSP, providing new targets for exploring disease mechanisms and therapeutic interventions.

Abstract The molecular mechanisms underlying L-dihydroxyphenylalanine (LDOPA) induced dyskinesia in Parkinson’s disease are poorly understood. Here we employ two transgenic mouse lines, combining translating ribosomal affinity purification (TRAP) with bacterial artificial chromosome expression (Bac), to selectively isolate RNA from either DRD1A expressing striatonigral, or DRD2 expressing striatopallidal medium spiny neurons (MSNs) of the direct and indirect pathways respectively, to study changes in translational gene expression following repeated LDOPA treatment. 6-OHDA lesioned DRD1A and DRD2 BacTRAP mice were treated with either saline or LDOPA bi-daily for 21 days over which time they developed abnormal involuntary movements reminiscent of dyskinesia. On day 22, all animals received LDOPA 40 minutes prior to sacrifice. The striatum of the lesioned hemisphere was dissected and subject to TRAP. Extracted ribosomal RNA was amplified, purified and gene expression was quantified using microarray. 195 significantly varying transcripts were identified among the 4 treatment groups. Pathway analysis revealed an overrepresentation of calcium signaling and long-term potentiation in the DRD1A expressing MSNs of the direct pathway, with significant involvement of long-term depression in the DRD2 expressing MSNs of the indirect pathway following chronic treatment with LDOPA. Several MAPK associated genes ( NR4A1 , GADD45G , STMN1 , FOS and DUSP1 ) differentiated the direct and indirect pathways following both acute and chronic LDOPA treatment. However, the MAPK pathway activator PAK1 was downregulated in the indirect pathway and upregulated in the direct pathway, strongly suggesting a role for PAK1 in regulating the opposing effects of LDOPA on these two pathways in dyskinesia. Future studies will assess the potential of targeting these genes and pathways to prevent the development of LDOPA-induced dyskinesia.