YL
Yiting Liu
Author with expertise in The p53 Signaling Network in Cancer Research
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(67% Open Access)
Cited by:
3
h-index:
17
/
i10-index:
22
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Targeting MDM2-p53 interaction in Glioblastoma: Transcriptomic analysis and Peptide-Based inhibition strategy

NULL AUTHOR_ID et al.Jul 1, 2024
MDM2 is a gene that encodes a protein involved in cell survival, growth, and DNA repair. It has been implicated in the development and progression of glioblastoma (GBM). Inhibition of the MDM2-p53 interaction has emerged as a promising strategy for treating GBM. In this study, we performed comprehensive transcriptomic expression analysis from diverse datasets and observed MDM2 overexpression in a subset of GBM cases. MDM2 negatively regulates the major onco-suppressor p53. The interaction between MDM2 and p53 is a promising target for cancer therapy, as it can trigger p53-mediated cell death in response to different stress conditions, such as oncogene activation or DNA damage. In this study, we have identified a peptide-based inhibition of MDM2 as a therapeutic strategy for GBM. We have further validated the stability of the MDM2-peptide interaction using a molecular structural dynamics approach. The major trajectories, including root mean square of deviation (RMSD), root mean square of fluctuation (RMSF), and radius of gyration (RoG), indicate that the candidate peptides have a more stable binding compared to the native ligand and control drug. The stability of the binding interaction was further estimated by MMGBSA analysis, which also suggests that MDM2 has a stable binding with both peptide molecules. Based on these results, peptides P-1843 and P-3837 could be tested further for experimental validation to confirm their targeted inhibition of MDM-2. This approach could provide a highly selective and efficient inhibitor with potentially fewer side effects and less toxicity compared to small drug-based molecules.
0
Citation1
0
Save
0

Safety and Vision Outcomes Following Gene Therapy for Bietti Crystalline Dystrophy

Xiuju Chen et al.Jan 9, 2025
Importance Bietti crystalline dystrophy (BCD) is a severe genetic retinopathy caused by variants in the CYP4V2 gene. Currently, there is no approved treatment for BCD. Objective To evaluate safety and vision outcomes following gene therapy with adeno-associated virus (AAV) encoding CYP4V2 (rAAV-hCYP4V2, NGGT001 [Next Generation Gene Therapeutics]). Design, Setting, and Participants This open-label, dose-escalation nonrandomized clinical trial was conducted from February 2023 to May 2024 at 2 study sites in China. Patients with genetically confirmed biallelic disease-linked CYP4V2 variants received subretinal injections of rAAV2-hCYP4V2 at 1 of 2 dosage levels and were followed up for 12 months. Intervention A single unilateral injection of 1.5 × 10 11 or 3.0 × 10 11 total vector genomes of recombinant AAV-hCYP4V2 in the worse eye, based on visual acuity letter score. Main Outcomes and Measures The primary outcome was safety, assessed by clinical examination of ocular inflammation and evaluated by routine clinical chemistry and immunogenicity testing. Secondary outcomes were changes in visual function from baseline in best-corrected visual acuity (BCVA), microperimetry, and contrast sensitivity 12 months after treatment. Results Among 12 patients with BCD (6 patients per dose group), mean (SD) patient age was 40.5 (7.1) years, and 5 patients (42%) were female. No severe adverse events related to the treatment were observed. However, mild intraocular inflammation was noted in 1 participant. The median (IQR) baseline BCVA letter score for the study eye was 34 (10-53), equivalent to 20/200 Snellen, while the nonstudy eye had a median (IQR) BCVA of 60 (40-67), equivalent to approximately 20/63 Snellen. At 12 months, the study eye improved by a mean (SD) letter score of 13.9 (13.1) compared with 6.3 (7.4) in the nonstudy eye. The 12-month median (IQR) BCVA for the study eye was 53 (37-64) (equivalent to approximately 20/80 Snellen) and 62 (42-70) (approximately 20/50 Snellen) for the nonstudy eye. Conclusions and Relevance This open-label, exploratory nonrandomized clinical trial identified no serious safety concerns related to gene therapy over 12 months’ follow-up among patients with BCD. While improvement in BCVA was noted, the magnitude was within test-retest values typically noted in eyes with very low levels of visual acuity, and BCVA improvement in both the study and nonstudy eyes could be related to a learning effect, with greater improvement in the study eye possibly related to study eyes’ being the worse-seeing eye. Trial Registration ClinicalTrials.gov Identifier: NCT06302608
0

A Pan-Cancer Analysis of the Oncogenic Role of CD276 in Human Tumors

Lilong Liu et al.Nov 27, 2024
Objectives: B7 homolog 3 protein (B7-H3, also known as CD276) is a member of the B7 family that has been found to be associated with the growth and progression of a variety of tumors, but no pan-cancer evaluations of CD276 have been performed so far. In this study, we aimed to perform a pan-cancer analysis of the oncogenic role of CD276 in human tumors; Methods: We used a series of databases to perform a pan-cancer analysis of CD276, including the expression level of CD276 in pan-cancer and its relationship to tumor progression, patient survival duration, the immune cell infiltration within the tumor, and the potential signaling pathways and molecular mechanisms associated with CD276; Results: We found that CD276 was a potential biomarker for the prognosis of most cancers. The high expression of CD276 was associated with tumor progression, leading to poor survival. Notably, the up-regulation of CD276 expression in tumors increased the tumor infiltration of cancer-associated fibroblasts (CAFs) and myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) and decreased the CD8+ T cells; Conclusions: Our study demonstrates that CD276 might promote tumor progression via the promotion of an immunosuppressive microenvironment.
0

The impact of donor diabetes on recipient postoperative complications, renal function, and survival rate in deceased donor kidney transplantation: a single-center analysis

Qi Chen et al.Aug 23, 2024
As the global incidence of diabetes rises and diagnoses among younger patients increase, transplant centers worldwide are encountering more organ donors with diabetes. This study examined 80 donors and 160 recipients, including 30 donors with diabetes (DD) and their 60 recipients (DDR). The control group comprised 50 non-diabetic donors (ND) and 100 recipients (NDR). We analyzed clinical, biochemical, and pathological data for both diabetic and control groups, using logistic regression to identify risk factors for delayed graft function (DGF) after kidney transplantation. Results showed that pre-procurement blood urea nitrogen levels were significantly higher in DD [18.20 ± 10.63 vs. 10.86 ± 6.92, p = 0.002] compared to ND. Renal pathological damage in DD was notably more severe, likely contributing to the higher DGF incidence in DDR compared to NDR. Although DDR had poorer renal function during the first three months post-transplant, both groups showed similar renal function thereafter. No significant differences were observed in 1-year or 3-year mortality rates or graft failure rates between DDR and NDR. Notably, according to the Renal Pathology Society (RPS) grading system, kidneys from diabetic donors with a grade > IIb are associated with significantly lower postoperative survival rates. Recipient gender [OR: 5.452 (1.330–22.353), p = 0.013] and pre-transplant PRA positivity [OR: 34.879 (7.698–158.030), p < 0.001] were identified as independent predictors of DGF in DDR. In conclusion, transplant centers may consider utilizing kidneys from diabetic donors, provided they are evaluated pathologically, without adversely impacting recipient survival and graft failure rates.
0

Genomic profiling of a multi-lineage and multi-passage patient-derived xenograft biobank reflects heterogeneity of ovarian cancer

Tianyu Qin et al.Jul 1, 2024
Ovarian cancer (OC) manifests as a complex disease characterized by inter- and intra-patient heterogeneity. Despite enhanced biological and genetic insights, OC remains a recalcitrant malignancy with minimal survival improvement. Based on multi-site sampling and a multi-lineage patient-derived xenograft (PDX) establishment strategy, we present herein the establishment of a comprehensive PDX biobank from histologically and molecularly heterogeneous OC patients. Comprehensive profiling of matched PDX and patient samples demonstrates that PDXs closely recapitulate parental tumors. By leveraging multi-lineage models, we reveal that the previously reported genomic disparities of PDX could be mainly attributed to intra-patient spatial heterogeneity instead of substantial model-independent genomic evolution. Moreover, DNA damage response pathway inhibitor (DDRi) screening uncovers heterogeneous responses across models. Prolonged iterative drug exposure recapitulates acquired drug resistance in initially sensitive models. Meanwhile, interrogation of induced drug-resistant (IDR) models reveals that suppressed interferon (IFN) response and activated Wnt/β-catenin signaling contribute to acquired DDRi drug resistance.