Abstract Mycobacterium tuberculosis (MTB) induces vigorous immune responses, yet persists inside macrophages, evading host immunity. MTB bacilli or lysate was found to inhibit macrophage expression of class II MHC (MHC-II) molecules and MHC-II Ag processing. This report characterizes and identifies a specific component of MTB that mediates these inhibitory effects. The inhibitor was extracted from MTB lysate with Triton X-114, isolated by gel electroelution, and identified with Abs to be MTB 19-kDa lipoprotein. Electroelution- or immunoaffinity-purified MTB 19-kDa lipoprotein inhibited MHC-II expression and processing of both soluble Ags and Ag 85B from intact MTB bacilli. Inhibition of MHC-II Ag processing by either MTB bacilli or purified MTB 19-kDa lipoprotein was dependent on Toll-like receptor (TLR) 2 and independent of TLR 4. Synthetic analogs of lipopeptides from Treponema pallidum also inhibited Ag processing. Despite the ability of MTB 19-kDa lipoprotein to activate microbicidal and innate immune functions early in infection, TLR 2-dependent inhibition of MHC-II expression and Ag processing by MTB 19-kDa lipoprotein during later phases of macrophage infection may prevent presentation of MTB Ags and decrease recognition by T cells. This mechanism may allow intracellular MTB to evade immune surveillance and maintain chronic infection.

Many solid cancers display cellular hierarchies with self-renewing, tumorigenic stemlike cells, or cancer-initiating cells (CICs) at the apex. Whereas CICs often exhibit relative resistance to conventional cancer therapies, they also receive critical maintenance cues from supportive stromal elements that also respond to cytotoxic therapies. To interrogate the interplay between chemotherapy and CICs, we investigated cellular heterogeneity in human colorectal cancers. Colorectal CICs were resistant to conventional chemotherapy in cell-autonomous assays, but CIC chemoresistance was also increased by cancer-associated fibroblasts (CAFs). Comparative analysis of matched colorectal cancer specimens from patients before and after cytotoxic treatment revealed a significant increase in CAFs. Chemotherapy-treated human CAFs promoted CIC self-renewal and in vivo tumor growth associated with increased secretion of specific cytokines and chemokines, including interleukin-17A (IL-17A). Exogenous IL-17A increased CIC self-renewal and invasion, and targeting IL-17A signaling impaired CIC growth. Notably, IL-17A was overexpressed by colorectal CAFs in response to chemotherapy with expression validated directly in patient-derived specimens without culture. These data suggest that chemotherapy induces remodeling of the tumor microenvironment to support the tumor cellular hierarchy through secreted factors. Incorporating simultaneous disruption of CIC mechanisms and interplay with the tumor microenvironment could optimize therapeutic targeting of cancer.

Objective

 Although the Geboes score (GS) and modified Riley score (MRS) are commonly used to evaluate histological disease activity in UC, their operating properties are unknown. Accordingly, we developed an alternative instrument. 

Design

 Four pathologists scored 48 UC colon biopsies using the GS, MRS and a visual analogue scale global rating. Intra-rater and inter-rater reliability for each index and individual index items were measured using intraclass correlation coefficients (ICCs). Items with high reliability were used to develop the Robarts histopathology index (RHI). The responsiveness/validity of the RHI and multiple histological, endoscopic and clinical outcome measures were evaluated by analyses of change scores, standardised effect size (SES) and Guyatt9s responsiveness statistic (GRS) using data from a clinical trial of an effective therapy. 

Results

 Inter-rater ICCs (95% CIs) for the total GS and MRS scores were 0.79 (0.63 to 0.87) and 0.80 (0.69 to 0.87). The correlation estimates between change scores in RHI and change score in GS and MRS were 0.75 (0.67 to 0.82) and 0.84 (0.79 to 0.88), respectively. The SES and GRS estimates for GS, MRS and RHI were: 1.87 (1.54 to 2.20) and 1.23 (0.97 to 1.50), 1.29 (1.02 to 1.56) and 0.88 (0.65 to 1.12), and 1.05 (0.79 to 1.30) and 0.88 (0.64 to 1.12), respectively. 

Conclusions

 The RHI is a new histopathological index with favourable operating properties.

PURPOSE Pancreatic acinar cell carcinoma (PACC) is a rare and aggressive form of pancreatic cancer that originates in the acinar cells of the exocrine pancreas. In this study, we aimed to investigate the clinical and molecular characteristics of patients with PACC at our institution. METHODS This was a retrospective study of patients with PACC seen at Mayo Clinic between 2002 and 2023. Baseline patient characteristics, tumor pathology, treatment strategies used, and survival outcomes were analyzed. Kaplan-Meier curves were estimated using newsurv macros in SAS. RESULTS The study included a total of 65 patients with PACC. The median age at diagnosis was 66 years. Almost half of the patients (48%) presented with resectable/borderline-resectable disease (n = 28). Five-year overall survival (OS) for resectable/borderline-resectable, locally advanced/unresectable, and metastatic disease were 72.0%, 21.6%, and 20.9%, respectively. Somatic and germline next-generation sequencing identified numerous potentially actionable targets including homologous recombination (43% somatic, 33% germline), RAF alterations (29% somatic), and mismatch repair (14% somatic). CONCLUSION Our findings underscore the heterogeneity and aggressive nature of PACC. Despite the improved prognosis for patients with resectable/borderline-resectable disease, OS remains poor, particularly for those with locally advanced or metastatic disease. The identification of actionable molecular targets in a significant proportion of patients highlights the potential for personalized therapeutic approaches. Future research should focus on tailored treatment strategies to exploit these molecular vulnerabilities, which may offer new options for improving outcomes in this rare malignancy.

Advancement of AI has opened new possibility for accurate diagnosis and prognosis using digital histopathology slides which not only saves hours of expert effort but also makes the estimation more standardized and accurate. However, preserving the AI model performance on the external sites is an extremely challenging problem in the histopathology domain which is primarily due to the difference in data acquisition and/or sampling bias. Although, AI models can also learn spurious correlation, they provide unequal performance across validation population. While it is crucial to detect and remove the bias from the AI model before the clinical application, the cause of the bias is often unknown . We proposed a Causal Survival model that can reduce the effect of unknown bias by leveraging the causal reasoning framework. We use the model to predict recurrence-free survival for the colorectal cancer patients using quantitative histopathology features from seven geographically distributed sites and achieve equalized performance compared to the baseline traditional Cox Proportional Hazards and DeepSurvival model. Through ablation study, we demonstrated benefit of novel addition of latent probability adjustment and auxiliary losses. Although detection of cause of unknown bias is unsolved, we proposed a causal debiasing solution to reduce the bias and improve the AI model generalizibility on the histopathology domain across sites. Open-source codebase for the model training can be accessed from https://github.com/ramon349/fair_survival.git

Abstract Background Research on calcium intake as well as variants in the calcium sensor receptor ( CaSR) gene and their interaction in relation to CRC survival is still limited. Methods Data from 18,952 CRC patients, were included. Associations between primarily pre-diagnostic dietary ( n = 13.085), supplemental ( n = 11,837), total calcium intake ( n = 5970) as well as 325 single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the CaSR gene ( n = 15,734) in relation to CRC-specific and all-cause mortality were assessed using Cox proportional hazard models. Also interactions between calcium intake and variants in the CaSR gene were assessed. Results During a median follow-up of 4.8 years (IQR 2.4–8.4), 6801 deaths occurred, of which 4194 related to CRC. For all-cause mortality, no associations were observed for the highest compared to the lowest sex- and study-specific quartile of dietary (HR 1.00, 95%CI 0.92–1.09), supplemental (HR 0.97, 95%CI 0.89–1.06) and total calcium intake (HR 0.99, 95%CI 0.88–1.11). No associations with CRC-specific mortality were observed either. Interactions were observed between supplemental calcium intake and several SNPs of the CaSR gene. Conclusion Calcium intake was not associated with all-cause or CRC-specific mortality in CRC patients. The association between supplemental calcium intake and all-cause and CRC-specific mortality may be modified by genetic variants in the CaSR gene.

Summary Background Varying obesogenic inherited predisposition in early to later life may differentially impact colorectal cancer (CRC) development. Previous Mendelian randomization (MR) studies, conducted in populations of European genetic similarity, have not observed any significant associations between early life body weight with CRC risk. However, it remains unclear whether body mass index (BMI) at different early lifetime points is causally related with CRC risk in both Europeans and East Asian populations. Objectives We conducted a two‐sample MR study to investigate potential causal relationships between genetically predicted BMI during early life (birth to 8 years old) and at specific periods (birth, transient, early rise and late rise) and CRC risk. Methods Summary data were obtained from genome‐wide association study (GWAS) of BMI in 28 681 children from the Norwegian Mother, Father and Child Cohort Study (MoBa) study and applied to CRC GWAS data from European and East Asian descent populations (102 893 cases and 485 083 non‐cases). Results There were no significant associations observed between early life BMI and CRC risk in European or East Asian populations. The effect estimates were similar in European studies (odds ratio [OR] per a 1‐standard deviation [SD] increase: 1.01, 95% confidence interval [CI]: 0.95, 1.07) and in East Asians (OR per a 1‐SD increase: 1.02, 95% CI: 0.91, 1.14). Similar nonsignificant associations were found between time of BMI measurement during childhood and cancer‐site‐specific analyses. Conclusions We found little evidence of any associations between early life adiposity on later life CRC risk.

Introduction: Langerhans cell histiocytosis (LCH) is a rare hematologic condition which can affect multiple organ systems and has variable presentation. LCH is more commonly seen as a malignancy of childhood. LCH in adulthood can have poor outcomes depending on the involvement of critical organs. Case Presentation: We report a case of a 71-year-old female who presented with progressive weakness, weight loss, diarrhea, and jaundice, and had been undergoing outpatient workup for elevated liver enzymes for the last 2 years. She required admission to the intensive care unit for vasodilatory shock, requiring vasopressor and chronotropic support. Imaging showed an underlying multiorgan process involving the gastrointestinal tract, liver, spleen, and central nervous system. A repeat liver biopsy after a prior inconclusive one revealed the diagnosis of multisystem LCH presenting as secondary sclerosing cholangitis. Conclusion: The uniqueness of this multisystem LCH case lies not only in its rarity but also in the diagnostic journey that necessitated a repeat biopsy for a conclusive diagnosis. Early identification and targeted intervention can help in ensuring better patient outcomes, especially when the presentation can overlap with various other possible conditions.

PURPOSE Identification of those at risk of hereditary cancer syndromes using electronic health record (EHR) data sources is important for clinical care, quality improvement, and research. We describe diagnostic processes, previously seldom reported, for a common hereditary cancer syndrome, Lynch syndrome (LS), using EHR data within a community-based, multicenter, demographically diverse health system. METHODS Within a retrospective cohort enrolled between 2015 and 2020 at Kaiser Permanente Northern California, we assessed electronic diagnostic domains for LS including (1) family history of LS-associated cancer; (2) personal history of LS-associated cancer; (3) LS screening via mismatch repair deficiency (MMRD) testing of newly diagnosed malignancy; (4) germline genetic test results; and (5) clinician-entered diagnostic codes for LS. We calculated proportions and overlap for each diagnostic domain descriptively. RESULTS Among 5.8 million individuals, (1) 28,492 (0.49%) had a family history of LS-associated cancer of whom 3,635 (13%) underwent genetic testing; (2) 100,046 (1.7%) had a personal history of a LS-associated cancer; and (3) 8,711 (0.1%) were diagnosed with colorectal cancer of whom 7,533 (86%) underwent MMRD screening and of the positive screens (486), 130 (27%) underwent germline testing. One thousand seven hundred and fifty-seven (0.03%) were diagnosed with endometrial cancer of whom 1,613 (92%) underwent MMRD screening and of the 195 who screened positive, 55 (28%) underwent genetic testing. (4) 30,790 (0.05%) had LS germline genetic testing with 707 (0.01%) testing positive; and (5) 1,273 (0.02%) had a clinician-entered diagnosis of LS. CONCLUSION It is feasible to electronically characterize the diagnostic processes of LS. No single data source comprehensively identifies all LS carriers. There is underutilization of LS genetic testing for those eligible and underdiagnosis of LS. Our work informs similar efforts in other settings for hereditary cancer syndromes.