Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
LZ
Li Zhang
Author with expertise in Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats and CRISPR-associated proteins
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
12
/
i10-index:
12
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Combined transcriptomics and cellular analyses reveal the molecular mechanism by which Candida tropicalis ZD-3 adapts to and degrades gossypol

Li Zhang et al.Sep 1, 2024
Microbial degradation techniques are often considered an environmentally friendly and cost-effective strategy for reducing gossypol toxicity. However, the mechanism by which Candida tropicalis degrades gossypol remains unclear. In the current study, we aimed to establish the mechanisms of biodegradation and adaptation mechanisms by C. tropicalis ZD-3. The toxicological evaluation results revealed that ZD-3 adapts to gossypol primarily by activating the antioxidant defense system to alleviate the oxidative stress response induced by gossypol. Transcriptomic analyses further suggested that ZD-3 protects against gossypol toxicity via cell wall remodeling. The intracellular enzyme CTRG_04744 gene was significantly up-regulated under gossypol stress, and then expressed in Pichia pastoris. The purified AKR_Z1 degraded 92 % of gossypol within 48 h. In addition, the aldehyde group of gossypol was effectively eliminated to achieve the desired detoxification. Collectively, these results provide theoretical guidance for the continued development of bio-efficient strategies capable of degrading gossypol.
0

Metabolomic and transcriptomic analyses revealed potential mechanisms of Anchusa italica Retz. in alleviating cerebral ischemia–reperfusion injury via Wnt/β-catenin pathway modulation

Wenjie Tan et al.Jan 8, 2025
Abstract Anchusa italica Retz. (AIR), a traditional herbal remedy, is commonly applied in managing heart and brain disorders. However, its specific function and mechanism in acute cerebral ischemia–reperfusion injury (CIRI) are not fully understood. This research focused on the interventional effects and potential mechanisms of AIR extract (AIRE) in a rat model of CIRI. The model was established using the filament occlusion method, which involved blocking the middle cerebral artery for 1.5 h and then removing the filament to restore blood flow. Transcriptomic and metabolomic analyses were conducted to explore the molecular pathways and metabolites affected by AIRE. ATP level was measured using an ATP assay kit. Additionally, RT-qPCR and western blot tests were conducted to evaluate the influence of AIRE on the Wnt signaling pathway and mitochondrial function. Transcriptomic and metabolomic analyses indicated that AIRE regulated the Wnt signaling pathway in CIRI and modulated metabolites associated with mitochondrial energy metabolism, such as citrate and succinate. ATP assay result demonstrated that AIRE enhanced ATP production in CIRI. Further, RT-qPCR and western blot analyses revealed that AIRE activated the Wnt/β-catenin signaling pathway and corrected mitochondrial dysfunction. These results proposed that AIRE mitigated mitochondrial energy metabolism deficits in CIRI via the Wnt/β-catenin pathway. By restoring the balance of mitochondrial function and energy metabolism, AIRE might offer a potentially therapeutic strategy for addressing CIRI. Graphical Abstract