David van Heel and colleagues report results of a large genome-wide association study of celiac disease. Most of the associated loci contain genes with immune functions, and over half harbor risk variants that are correlated with variation in cis gene expression. We performed a second-generation genome-wide association study of 4,533 individuals with celiac disease (cases) and 10,750 control subjects. We genotyped 113 selected SNPs with PGWAS < 10−4 and 18 SNPs from 14 known loci in a further 4,918 cases and 5,684 controls. Variants from 13 new regions reached genome-wide significance (Pcombined < 5 × 10−8); most contain genes with immune functions (BACH2, CCR4, CD80, CIITA-SOCS1-CLEC16A, ICOSLG and ZMIZ1), with ETS1, RUNX3, THEMIS and TNFRSF14 having key roles in thymic T-cell selection. There was evidence to suggest associations for a further 13 regions. In an expression quantitative trait meta-analysis of 1,469 whole blood samples, 20 of 38 (52.6%) tested loci had celiac risk variants correlated (P < 0.0028, FDR 5%) with cis gene expression.

PD-1 plus CTLA-4 blockade is highly effective in advanced-stage, mismatch repair (MMR)-deficient (dMMR) colorectal cancers, yet not in MMR-proficient (pMMR) tumors. We postulated a higher efficacy of neoadjuvant immunotherapy in early-stage colon cancers. In the exploratory NICHE study (ClinicalTrials.gov: NCT03026140 ), patients with dMMR or pMMR tumors received a single dose of ipilimumab and two doses of nivolumab before surgery, the pMMR group with or without celecoxib. The primary objective was safety and feasibility; 40 patients with 21 dMMR and 20 pMMR tumors were treated, and 3 patients received nivolumab monotherapy in the safety run-in. Treatment was well tolerated and all patients underwent radical resections without delays, meeting the primary endpoint. Of the patients who received ipilimumab + nivolumab (20 dMMR and 15 pMMR tumors), 35 were evaluable for efficacy and translational endpoints. Pathological response was observed in 20/20 (100%; 95% exact confidence interval (CI): 86–100%) dMMR tumors, with 19 major pathological responses (MPRs, ≤10% residual viable tumor) and 12 pathological complete responses. In pMMR tumors, 4/15 (27%; 95% exact CI: 8–55%) showed pathological responses, with 3 MPRs and 1 partial response. CD8+PD-1+ T cell infiltration was predictive of response in pMMR tumors. These data indicate that neoadjuvant immunotherapy may have the potential to become the standard of care for a defined group of colon cancer patients when validated in larger studies with at least 3 years of disease-free survival data. Results from the NICHE study show remarkable pathological responses to neoadjuvant combination immunotherapy in patients with early-stage colon cancer and uncover potential biomarkers of response.

Our genome-wide association study of celiac disease previously identified risk variants in the IL2–IL21 region. To identify additional risk variants, we genotyped 1,020 of the most strongly associated non-HLA markers in an additional 1,643 cases and 3,406 controls. Through joint analysis including the genome-wide association study data (767 cases, 1,422 controls), we identified seven previously unknown risk regions (P < 5 × 10−7). Six regions harbor genes controlling immune responses, including CCR3, IL12A, IL18RAP, RGS1, SH2B3 (nsSNP rs3184504) and TAGAP. Whole-blood IL18RAP mRNA expression correlated with IL18RAP genotype. Type 1 diabetes and celiac disease share HLA-DQ, IL2–IL21, CCR3 and SH2B3 risk regions. Thus, this extensive genome-wide association follow-up study has identified additional celiac disease risk variants in relevant biological pathways.

Coeliac disease may be regarded as refractory disease (RCD) when symptoms persist or recur despite strict adherence to a gluten-free diet. RCD may be subdivided into types I and II with a phenotypically normal and aberrant intraepithelial T-cell population, respectively. RCD I seems to respond well to azathioprine/prednisone therapy. RCD II is usually resistant to any known therapy and transition into enteropathy-associated T-cell lymphoma (EATL) is common.To provide further insight into RCD and the development of EATL, by reporting on long-term survival and risk of transition of RCD into EATL in a large cohort of patients with complicated coeliac disease.Retrospective comparison of responses to therapy in four groups of patients with complicated coeliac disease: 43, RCD I; 50, RCD II (total), of whom 26 with RCD II developed EATL after a period of refractoriness to a gluten-free diet (secondary EATL) and 13 were EATL patients without preceding history of complicated coeliac disease (de novo EATL).No coeliac-disease-related mortality was recognised in the RCD I group. The overall 5-year survival in the RCD I group it was 96%; in the RCD II (total) group was 58%; and in the RCD II group after developing EATL it was only 8%. The 2-year survival in the de novo EATL group was 20% versus 15% in secondary EATL group (p = 0.63). Twenty-eight (56%) of the 50 patients with RCD II died, 23 (46%) due to EATL, 4 due to a progressive refractory state with emaciation and 1 from neurocoeliac disease.Remarkably, no patient with RCD I developed RCD II or EATL within the mean follow-up period of 5 years (range 2-15 years). A total of 52% of the RCD II patients developed EATL within 4-6 years after the diagnosis of RCD II. More aggressive and targeted therapies seem necessary in RCD II and EATL.

Mismatch repair deficiency (dMMR) is found in approximately 15% of non-metastatic colon cancers (CCs) and is characterized by a defective DNA mismatch repair system, resulting in hypermutated and highly immunogenic tumors. Although patients with dMMR CC have limited benefit from chemotherapy, these tumors have been shown to respond exceptionally well to neoadjuvant anti-PD-1 plus anti-CTLA-4, with high rates of pathologic responses. Here, based on data from melanoma studies, we postulated a high efficacy and favorable toxicity profile of anti-PD-1 plus anti-LAG-3. In the NICHE-3 study, a total of 59 patients with locally advanced dMMR CC were treated with two 4-weekly cycles of nivolumab (480 mg) plus relatlimab (480 mg) before surgery. Pathologic response was observed in 57 of 59 (97%; 95% confidence interval (CI): 88-100%) patients, meeting the primary endpoint. Responses included 54 (92%; 95% CI: 81-97%) major pathologic responses (≤10% residual viable tumor) and 40 (68%; 95% CI: 54-79%) pathologic complete responses. With a median follow-up of 8 months (range, 2-19), one patient had recurrence of disease. The treatment displayed an acceptable safety profile, with all-grade and grade 3-4 immune-related adverse events (irAEs) occurring in 80% and 10% of patients, respectively. The most common irAEs were infusion-related reactions (29%), thyroid dysfunction (22%) and fatigue (20%). In conclusion, our results show that neoadjuvant nivolumab/relatlimab induces high rates of pathologic responses and that further investigation of this treatment in larger studies is warranted. These data add to the body of evidence in support of neoadjuvant immunotherapy regimens in dMMR CC. ClinicalTrials.gov identifier: NCT03026140 .