Dr. Syed Rizwan AbbasVerified
Verified Account
Verified
A researcher specializing in drug discovery, molecular genetics, in silico design, and biochemistry.
Structure-based drug design (SBDD) National University of Singapore
Member for 4 months and 1 day
I am Dr. Syed Rizwan Abbas, a Postdoctoral Researcher specializing in Structural-Based Drug Designing from the National University of Singapore, with a Ph.D. in Agriculture focusing on Molecular Genetics. My expertise lies in drug discovery, molecular dynamics simulations, in silico drug design, and...
Show more
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(58% Open Access)
Cited by:
290
h-index:
9
/
i10-index:
9
Reputation
Surgery
70%
Molecular Medicine
54%
Materials Chemistry
46%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Ailanthus altissima leaf extract mediated green production of zinc oxide (ZnO) nanoparticles for antibacterial and antioxidant activity

Shahid Awan et al.Nov 1, 2022
Fabricating zinc oxide nanoparticles (ZnO-NPs) from plant extracts is a cost-effective, safe, and environmentally friendly alternative to established chemical procedures. This study was aimed at the environmentally friendly fabrication of ZnO-NPs from plant extract. An additional objective was to investigate the antibacterial and antioxidant activity of these biosynthesized ZnO-NPs.ZnO-NPs were fabricated using the leaf extract of Ailanthus altissima, as an eco-friendly approach. The physicochemical properties of ZnO-NPs were explored using UV-visible spectroscopy, scanning electron microscopy, X-ray diffraction, and Fourier transform infrared spectrometry. The bio-fabricated ZnO-NPs were examined for bactericidal activity against pathogenic bacteria (gram-negative and gram-positive) using the agar well diffusion technique. The antioxidant efficiency of ZnO-NPs was assessed using a DPPH assay.A surface Plasmon peak was recorded at 327 nm, showing the existence of ZnO-NPs in the reaction solution of plant extract and zinc sulfate hexahydrate salt. These nanoparticles were predominantly spherical and capped by different functional groups of biomolecules. Furthermore, ZnO-NPs showed a dose-dependent antibacterial and antioxidant activity. At 20 mg/mL ZnO-NPs, the maximum bactericidal potential of ZnO-NPs was reported against Staphylococcus aureus (201.2 mm). ZnO-NPs have an IC50 value of 78.23 µg/mL, indicating that they are an effective antioxidant.This research presents an environmentally acceptable method for producing spherical ZnO-NPs with high antibacterial and antioxidant activities. These bio-fabricated ZnO-NPs could be a good option for applications in medicine and the healthcare industry.
0
Citation34
0
Save
0

Antioxidant activity and lipid peroxidation of selected wheat cultivars under salt stress

A. Rao et al.Jan 25, 2013
Antioxidants and dietary fibers are compact sources that are recommended for healthy diets in whole grain foods. The antioxidant activity, total phenolic content (TPC) and lipid peroxidation was measured among 15 cultivars of wheat which are commonly used in Pakistan and the effect of salt stress was also evaluated. The results revealed that different concentrations of wheat (25, 50, 75, 150 and 300 µg/ml) in control and under salt stress (that is, electrical conductivity, 2 EC, 4 EC, 8 EC and 16 EC) showed antioxidant activity. The inhibitory concentration at 50% (IC50) values of different cultivars of wheat ranged from 22.9 to 27.01 µg/ml. On the basis of comparison of scavenging percentage of non-stress and stressed wheat groups at different doses of salt, we have concluded that LU26-CTR, PAS-90, BARS, NARC, WAFAQ, LISANI, SEHAR, MEHRAJ, GA-02 and SHAFAQ are salt tolerant varieties. The change of phenolic content suggests that wheat uses antioxidant properties of phenolics as a mechanism of salt stress. Whereas, the lipid peroxidation data has indicated that LU26-CTR, PAS-90, BARS, NARC, FSD-08, PIRSBAK-09, SEHAR, SH-03 and GA-02 are salt resistant varieties as they showed a less percentage increase in lipid peroxidation (malondialdehyde (MDA) content) compared to control at different doses of salt. Key words: Antioxidant activity, phenolic content, salt stress, lipid peroxidation, wheat cultivars.
0
Citation12
0
Save
0

In-Vitro antioxidant, anti-lipid peroxidative activities and In-Silico study of Terminalia chebula bioactive compounds

Syed Sabir et al.Dec 1, 2020
Abstract Objective To evaluate the antioxidant activities and to identify the bioactive compounds in hot water extracts of Terminalia chebula fruit. Methods The antioxidant activities were determined by DPPH assay, lipid peroxidation assay, iron chelation and total antioxidant assay. The phenolic composition was determined by HPLC-DAD. Human Rab8b Protein was used for the validation of compounds as anti-inflammation. String analysis for protein synergism was used. Results The analysis of Terminalia chebula Retzius (Combretaceae) phenolics showed anti-inflammatory effect. The specific phenolic compositions were determined by high performance liquid chromatography (HPLC) and resulted in the identification of rutin, catechin, caffeic acid, gallicacid, ellagic acid, epicatechin, and quercetin as antioxidant compounds. Human Rab8b protein is selected for protein docking and all compounds except rutin showed good results. ADMET properties were checked by using AdmetSar and all seven compounds showed validation for AMET properties. The synergisms of compounds were analyzed by STRING analysis and our ligands shows strong binding with human Rab8b proteins. The aqueous extract was capable of inhibiting the lipid peroxidation in egg yolk phospholipid homogenate. The extract scavenged the 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl radical (DPPH) (IC 50, 71.5 ± 2.1 μg/ml). The extract displayed the high metal chelation activities and reducing abilities on the phosphomolybdenum assay. Conclusions It is concluded that extracts of T. chebula have good antioxidant and anti-inflammation activities and are rich in phenolics .
0
Citation6
0
Save
1

Study of resveratrol against bone loss by using in-silico and in-vitro methods

Dr. Syed Rizwan Abbas et al.Dec 20, 2021
Abstract By applying the in-silico method, resveratrol was docked on those proteins which are responsible for bone loss. The Molecular docking data between the resveratrol and Receptor activator of nuclear factor-kappa-Β ligand [RANKL] receptors proved that resveratrol binds tightly to the receptors, showed the highest binding affinities of −6.9, −7.6, −7.1, −6.9, −6.7, and −7.1 kcal/mol. According to in-vitro data, Resveratrol reduced the osteoclasts after treating Marrow-Derived Macrophages [BMM] with Macrophage colony-stimulating factor [MCSF] 20ng / ml and RANKL 50ng / ml, with different concentrations of resveratrol (2.5, 10 μg / ml) For 7 days, the cells were treated with MCSF (20 ng / ml) and RANKL (40 ng / ml) together with concentrated trimethyl ether and resveratrol (2.5, 10 μg / ml) within 12 hours. Which, not affect cell survival. After fixing osteoclast cells with formaldehyde fixative on glass coverslip followed by incubation with 0.1% Triton X-100 in PBS for 5 min and after that stain with rhodamine phalloidin staining for actin and Hoechst for nuclei. Fluorescence microscopy was performed to see the distribution of filaments actin [F.actin]. Finally, resveratrol reduced the actin ring formation. Resveratrol is the best bioactive compound for drug preparation against bone loss.
1
Citation5
0
Save
1

Discovery of a Tin–Piperonal–Entecavir Schiff Base Compound That Overcomes Multidrug Resistance by Inhibiting P-Glycoprotein

Rehmat Zaman et al.Jun 1, 2018
The presence of P-glycoprotein in the human intestine represents a significant barrier to effective drug therapy. These proteins form a multidrug-resistant barrier to most drugs, especially those administered orally. Thus, strategies are needed to prepare molecules to combat these resistant proteins and enable an increase in drug efficacy. We developed a novel tin–Schiff base complex using an ultrasonic bath, a new technique in small molecule synthesis. New bond formation was confirmed using ultraviolet andFourier transform spectroscopies. A computational study was carried out using Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion and Toxicity software. The novel tin–entecavir (ETV)–piperonal Schiff base acts as a potent P-glycoprotein inhibitor, which overcomes the multidrug resistance to all drugs that are substrates for P-glycoprotein. Further study showed that the novel tin complex is less toxic than the parent compound at the same dose. The development of this tin–piperonal–ETV Schiff base complex is a major breakthrough for overcoming multidrug resistance barriers and can be applied to other drug molecules.
1
Citation2
0
Save
Load More