We have previously shown correction of X-linked severe combined immunodeficiency [SCID-X1, also known as gamma chain (gamma(c)) deficiency] in 9 out of 10 patients by retrovirus-mediated gamma(c) gene transfer into autologous CD34 bone marrow cells. However, almost 3 years after gene therapy, uncontrolled exponential clonal proliferation of mature T cells (with gammadelta+ or alphabeta+ T cell receptors) has occurred in the two youngest patients. Both patients' clones showed retrovirus vector integration in proximity to the LMO2 proto-oncogene promoter, leading to aberrant transcription and expression of LMO2. Thus, retrovirus vector insertion can trigger deregulated premalignant cell proliferation with unexpected frequency, most likely driven by retrovirus enhancer activity on the LMO2 gene promoter.

We present clinical data on 558 patients with deletions within the DiGeorge syndrome critical region of chromosome 22q11. Twenty-eight percent of the cases where parents had been tested had inherited deletions, with a marked excess of maternally inherited deletions (maternal 61, paternal 18). Eight percent of the patients had died, over half of these within a month of birth and the majority within 6 months. All but one of the deaths were the result of congenital heart disease. Clinically significant immunological problems were very uncommon. Nine percent of patients had cleft palate and 32% had velopharyngeal insufficiency, 60% of patients were hypocalcaemic, 75% of patients had cardiac problems, and 36% of patients who had abdominal ultrasound had a renal abnormality. Sixty-two percent of surviving patients were developmentally normal or had only mild learning problems. The majority of patients were constitutionally small, with 36% of patients below the 3rd centile for either height or weight parameters.

Precise diagnosis of small-round-cell tumors is often a challenge to the pathologist and the clinical oncologist. In Ewing's sarcomas and related peripheral primitive neuroectodermal tumors, a t(11;22) translocation or a (21,22) rearrangement is associated with hybrid transcripts of the EWS gene with the FLI1 or ERG gene. To investigate the diagnostic implication of this observation, we searched for these hybrid transcripts in tumors from patients with clinical and radiologic features of Ewing's sarcoma or peripheral primitive neuroectodermal tumors.Samples of RNA from 114 tumors were reverse transcribed and subjected to the polymerase chain reaction with primers designed to amplify the relevant chimeric transcripts. All amplified products were sequenced.In-frame hybrid transcripts were observed in 89 cases. A hybrid transcript was found in 83 of 87 cases (95 percent) of Ewing's sarcoma or peripheral primitive neuroectodermal tumors. Samples of RNA from all of 12 tumors that had been proved to be other than Ewing's sarcoma or neuroectodermal tumors had no hybrid transcript. However, 6 of 15 undifferentiated tumors whose type was ambiguous (nonsecreting, poorly differentiated neuroblastoma or undifferentiated sarcoma) contained a hybrid transcript, suggesting that they might have to be reclassified.A subgroup of small-round-cell tumors identified as belonging to the Ewing family of tumors can be defined according to a specific molecular genetic lesion that is detectable by a rapid, reliable, and efficient method. This approach can be applied to small specimens obtained by fine-needle biopsies.

Atypical lipomatous tumor/well-differentiated liposarcoma (ALT-WDLPS) and dedifferentiated liposarcoma (DDLPS) may be difficult to distinguish from benign adipose tumors and from poorly differentiated sarcomas, respectively. Genetically, they are characterized by amplification of MDM2 and CDK4 genes on chromosome 12q13-15. We examined a series of 559 soft tissue tumors (44 ALT-WDLPS, 61 DDLPS, 49 benign adipose tumors, and 405 non-ALT-WDLPS/DDLPS sarcomas) for MDM2 and CDK4 expression using immunohistochemistry. MDM2 and CDK4 immunoexpressions were compared with gene amplification status (as assessed by quantitative PCR and/or comparative genomic hybridization) in 241 neoplasms. Most ALT-WDLPS/DDLPS expressed MDM2 (97%) and CDK4 (92%) as opposed to few benign adipose tumors (MDM2, 5%; CDK4, 2%) and a limited number of non-ALT-WDLSP/DDLPS sarcomas (MDM2, 19%; CDK4, 6%). The sensitivity and specificity of MDM2 and CDK4 immunostainings in identifying ALT-WDLPS/DDLPS among other soft tissue tumors were 97% and 92%, and 83% and 95%, respectively. MDM2 and CDK4 immunostainings were particularly useful to separate ALT-WDLPS from the large group of differentiated adipose tumors, and to distinguish DDLPS from poorly differentiated sarcomas. A strong correlation was observed between MDM2 and CDK4 stainings and gene amplification status. In conclusion, MDM2 and CDK4 immunostainings, which correlate with gene amplification, are helpful adjuncts to differentiate ALT-WDLPS from benign adipose tumors and to separate DDLPS from poorly differentiated sarcomas.

Since our initial reports on chromosomal studies in eight Ewing's sarcomas (ES), we have carried out similar investigations on 23 additional ES specimens following short-term culture of tumor cells (16 cases), and established in vitro cell lines (three cases) and on xenografted tumors in nude mice (four cases). We demonstrated the presence of the reciprocal t(11;22)(q24;q12) in every case except one that exhibited a complex t(11;22;14)(q24;q12;q11). On the basis of results from these additional 23 cases, we confirm the consistency of the t(11;22)(q24;q12) in ES. Moreover, we reviewed 54 ES cases reported by other investigators; when added to our 31 cases, this brings the total number to 85 unrelated cases of ES available for an evaluation of the frequency of involvement of bands 11q24 and 22q12 in translocations in ES. The standard t(11;22)(q24;q12) proved to be a remarkably consistent event, present in 83% of the cases. Five percent of the cases exhibited complex translocations involving a third chromosome in addition to chromosomes #11 and #22. In 4% of the cases variant translocations involved 22q12 but with a chromosome(s) other than #11. The breakpoint on chromosome 22q12 appears to be the most consistently observed event in 92% of the cases, whereas, the breakpoint at chromosome 11q24 was observed in 88% of the cases.