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Michal Drozdzal
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The One Hundred Layers Tiramisu: Fully Convolutional DenseNets for Semantic Segmentation

Simon Jégou et al.Jul 1, 2017
State-of-the-art approaches for semantic image segmentation are built on Convolutional Neural Networks (CNNs). The typical segmentation architecture is composed of (a) a downsampling path responsible for extracting coarse semantic features, followed by (b) an upsampling path trained to recover the input image resolution at the output of the model and, optionally, (c) a post-processing module (e.g. Conditional Random Fields) to refine the model predictions. Recently, a new CNN architecture, Densely Connected Convolutional Networks (DenseNets), has shown excellent results on image classification tasks. The idea of DenseNets is based on the observation that if each layer is directly connected to every other layer in a feed-forward fashion then the network will be more accurate and easier to train. In this paper, we extend DenseNets to deal with the problem of semantic segmentation. We achieve state-of-the-art results on urban scene benchmark datasets such as CamVid and Gatech, without any further post-processing module nor pretraining. Moreover, due to smart construction of the model, our approach has much less parameters than currently published best entries for these datasets.
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The Liver Tumor Segmentation Benchmark (LiTS)

Patrick Bilic et al.Nov 17, 2022
In this work, we report the set-up and results of the Liver Tumor Segmentation Benchmark (LiTS), which was organized in conjunction with the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) 2017 and the International Conferences on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI) 2017 and 2018. The image dataset is diverse and contains primary and secondary tumors with varied sizes and appearances with various lesion-to-background levels (hyper-/hypo-dense), created in collaboration with seven hospitals and research institutions. Seventy-five submitted liver and liver tumor segmentation algorithms were trained on a set of 131 computed tomography (CT) volumes and were tested on 70 unseen test images acquired from different patients. We found that not a single algorithm performed best for both liver and liver tumors in the three events. The best liver segmentation algorithm achieved a Dice score of 0.963, whereas, for tumor segmentation, the best algorithms achieved Dices scores of 0.674 (ISBI 2017), 0.702 (MICCAI 2017), and 0.739 (MICCAI 2018). Retrospectively, we performed additional analysis on liver tumor detection and revealed that not all top-performing segmentation algorithms worked well for tumor detection. The best liver tumor detection method achieved a lesion-wise recall of 0.458 (ISBI 2017), 0.515 (MICCAI 2017), and 0.554 (MICCAI 2018), indicating the need for further research. LiTS remains an active benchmark and resource for research, e.g., contributing the liver-related segmentation tasks in http://medicaldecathlon.com/. In addition, both data and online evaluation are accessible via https://competitions.codalab.org/competitions/17094.
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A Benchmark for Endoluminal Scene Segmentation of Colonoscopy Images

David Vázquez et al.Jan 1, 2017
Colorectal cancer (CRC) is the third cause of cancer death worldwide. Currently, the standard approach to reduce CRC-related mortality is to perform regular screening in search for polyps and colonoscopy is the screening tool of choice. The main limitations of this screening procedure are polyp miss rate and the inability to perform visual assessment of polyp malignancy. These drawbacks can be reduced by designing decision support systems (DSS) aiming to help clinicians in the different stages of the procedure by providing endoluminal scene segmentation. Thus, in this paper, we introduce an extended benchmark of colonoscopy image segmentation, with the hope of establishing a new strong benchmark for colonoscopy image analysis research. The proposed dataset consists of 4 relevant classes to inspect the endoluminal scene, targeting different clinical needs. Together with the dataset and taking advantage of advances in semantic segmentation literature, we provide new baselines by training standard fully convolutional networks (FCNs). We perform a comparative study to show that FCNs significantly outperform, without any further postprocessing, prior results in endoluminal scene segmentation, especially with respect to polyp segmentation and localization.
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Towards Geographic Inclusion in the Evaluation of Text-to-Image Models

Melissa Hall et al.Jun 3, 2024
Rapid progress in text-to-image generative models coupled with their deployment for visual content creation has magnified the importance of thoroughly evaluating their performance and identifying potential biases. In pursuit of models that generate images that are realistic, diverse, visually appealing, and consistent with the given prompt, researchers and practitioners often turn to automated metrics to facilitate scalable and cost-effective performance profiling. However, commonly-used metrics often fail to account for the full diversity of human preference; often even in-depth human evaluations face challenges with subjectivity, especially as interpretations of evaluation criteria vary across regions and cultures. In this work, we conduct a large, cross-cultural study to study how much annotators in Africa, Europe, and Southeast Asia vary in their perception of geographic representation, visual appeal, and consistency in real and generated images from state-of-the art public APIs. We collect over 65,000 image annotations and 20 survey responses. We contrast human annotations with common automated metrics, finding that human preferences vary notably across geographic location and that current metrics do not fully account for this diversity. For example, annotators in different locations often disagree on whether exaggerated, stereotypical depictions of a region are considered geographically representative. In addition, the utility of automatic evaluations is dependent on assumptions about their set-up, such as the alignment of feature extractors with human perception of object similarity or the definition of "appeal" captured in reference datasets used to ground evaluations. We recommend steps for improved automatic and human evaluations. This includes collecting annotations from people located inside and outside the region of interest, instructing annotators on whether they should follow specific definitions of evaluation criteria or utilize their own interpretation, and reporting assumptions underlying automatic evaluations.