Listeria monocytogenes is a food-borne pathogen with a high mortality rate that has also emerged as a paradigm for intracellular parasitism. We present and compare the genome sequences of L. monocytogenes (2,944,528 base pairs) and a nonpathogenic species, L. innocua (3,011,209 base pairs). We found a large number of predicted genes encoding surface and secreted proteins, transporters, and transcriptional regulators, consistent with the ability of both species to adapt to diverse environments. The presence of 270 L. monocytogenes and 149 L. innocua strain-specific genes (clustered in 100 and 63 islets, respectively) suggests that virulence in Listeria results from multiple gene acquisition and deletion events.

Chromosome 21 is the smallest human autosome. An extra copy of chromosome 21 causes Down syndrome, the most frequent genetic cause of significant mental retardation, which affects up to 1 in 700 live births. Several anonymous loci for monogenic disorders and predispositions for common complex disorders have also been mapped to this chromosome, and loss of heterozygosity has been observed in regions associated with solid tumours. Here we report the sequence and gene catalogue of the long arm of chromosome 21. We have sequenced 33,546,361 base pairs (bp) of DNA with very high accuracy, the largest contig being 25,491,867 bp. Only three small clone gaps and seven sequencing gaps remain, comprising about 100 kilobases. Thus, we achieved 99.7% coverage of 21q. We also sequenced 281,116 bp from the short arm. The structural features identified include duplications that are probably involved in chromosomal abnormalities and repeat structures in the telomeric and pericentromeric regions. Analysis of the chromosome revealed 127 known genes, 98 predicted genes and 59 pseudogenes.

Chlamydiae are the major cause of preventable blindness and sexually transmitted disease. Genome analysis of a chlamydia-related symbiont of free-living amoebae revealed that it is twice as large as any of the pathogenic chlamydiae and had few signs of recent lateral gene acquisition. We showed that about 700 million years ago the last common ancestor of pathogenic and symbiotic chlamydiae was already adapted to intracellular survival in early eukaryotes and contained many virulence factors found in modern pathogenic chlamydiae, including a type III secretion system. Ancient chlamydiae appear to be the originators of mechanisms for the exploitation of eukaryotic cells.

The Yeast Genome DirectoryThis directory was made possible by a unique international collaboration between the 633 scientists whose names appear below.It represents both the first published description of the complete sequence of most chromsomes from Saccharomyces cerevisiae , and the first published overview of the entire sequence.

The fungus Candida albicans and the Gram-positive bacterium Enterococcus faecalis share mucosal niches in the human body. As opportunistic pathogens, both are found to expand population size during dysbiosis, and can cause severe systemic infections in susceptible individuals. Here, we show that the presence of C. albicans results in increased host cell damage by E. faecalis. Furthermore, E. faecalis aggravates oropharyngeal candidiasis in mice. Increased damage is mediated by enterococcal cytolysin, and involves both physical interaction and altered glucose availability. Physical interaction promotes accumulation of bacteria on host cells, facilitating contact of cytolysin with host cells. Glucose depletion by the metabolic activity of the fungus sensitized host cells to cytolysin. This work illustrates how a complex interplay between fungi and bacteria can result in detrimental consequences for the host.