Xylella fastidiosa is a fastidious, xylem-limited bacterium that causes a range of economically important plant diseases. Here we report the complete genome sequence of X. fastidiosa clone 9a5c, which causes citrus variegated chlorosis—a serious disease of orange trees. The genome comprises a 52.7% GC-rich 2,679,305-base-pair (bp) circular chromosome and two plasmids of 51,158 bp and 1,285 bp. We can assign putative functions to 47% of the 2,904 predicted coding regions. Efficient metabolic functions are predicted, with sugars as the principal energy and carbon source, supporting existence in the nutrient-poor xylem sap. The mechanisms associated with pathogenicity and virulence involve toxins, antibiotics and ion sequestration systems, as well as bacterium–bacterium and bacterium–host interactions mediated by a range of proteins. Orthologues of some of these proteins have only been identified in animal and human pathogens; their presence in X. fastidiosa indicates that the molecular basis for bacterial pathogenicity is both conserved and independent of host. At least 83 genes are bacteriophage-derived and include virulence-associated genes from other bacteria, providing direct evidence of phage-mediated horizontal gene transfer.

ABSTRACT Leptospira species colonize a significant proportion of rodent populations worldwide and produce life-threatening infections in accidental hosts, including humans. Complete genome sequencing of Leptospira interrogans serovar Copenhageni and comparative analysis with the available Leptospira interrogans serovar Lai genome reveal that despite overall genetic similarity there are significant structural differences, including a large chromosomal inversion and extensive variation in the number and distribution of insertion sequence elements. Genome sequence analysis elucidates many of the novel aspects of leptospiral physiology relating to energy metabolism, oxygen tolerance, two-component signal transduction systems, and mechanisms of pathogenesis. A broad array of transcriptional regulation proteins and two new families of afimbrial adhesins which contribute to host tissue colonization in the early steps of infection were identified. Differences in genes involved in the biosynthesis of lipopolysaccharide O side chains between the Copenhageni and Lai serovars were identified, offering an important starting point for the elucidation of the organism's complex polysaccharide surface antigens. Differences in adhesins and in lipopolysaccharide might be associated with the adaptation of serovars Copenhageni and Lai to different animal hosts. Hundreds of genes encoding surface-exposed lipoproteins and transmembrane outer membrane proteins were identified as candidates for development of vaccines for the prevention of leptospirosis.

Abstract Background The “Virtual Semester for Medical Research Aachen” (vSEMERA) is an international, interdisciplinary, virtual education program developed for health profession students. The first edition (2021) was hosted by the Medical Faculty of RWTH Aachen University (Germany) in cooperation with Centro Universitário Christus (Brazil) and Universidad Peruana Cayetano Heredia (Peru). The primary aim of the 12-weeks program was to provide students with skills in health science research and prepare them for scientific career paths. Methods vSEMERA was built on a virtual learning platform, the “vSEMERA-Campus”, designed to foster students’ learning process and social interactions. Maximum flexibility was offered through synchronous and asynchronous teaching, enabling participants to join via any device from any part of the Globe alongside their regular studies. For the program’s first edition (September - November 2021), health profession students from Germany, Brazil, Peru, Spain, and Italy filled all 30 available spots. Satisfaction, quality of the program and courses offered, as well as perceived learning outcomes, were examined using questionnaires throughout and at the end of the program. Results The program received a rating of 4.38 out of 5 stars. While it met most expectations (4.29 out of 5), participants were unable to attend as many courses as intended (2.81 out of 5), mainly due to scheduling conflicts with the home university schedule (46%), internships (23%), and general timing issues (31%). Participants acknowledged considerable improvements in their scientific skills, English language skills, confidence in scientific project management, research career progression, and enthusiasm for a scientific career. Conclusions vSEMERA represents a promising example of an online international learning and exchange program using pedagogical and technological elements of virtual collaboration and teaching. In addition to advancing future vSEMERA editions, our results may offer insights for similar projects that address the targeted integration of scientific research education into an international, digital learning environment.