Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
XS
Xiaokun Shen
Author with expertise in Poly(ADP-ribose) Polymerase Inhibition in Cancer Therapy
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(60% Open Access)
Cited by:
263
h-index:
20
/
i10-index:
30
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Over-Expression of LSD1 Promotes Proliferation, Migration and Invasion in Non-Small Cell Lung Cancer

Tangfeng Lv et al.Apr 6, 2012
Background Lysine specific demethylase 1 (LSD1) has been identified and biochemically characterized in epigenetics, but the pathological roles of its dysfunction in lung cancer remain to be elucidated. The aim of this study was to evaluate the prognostic significance of LSD1 expression in patients with non-small cell lung cancer (NSCLC) and to define its exact role in lung cancer proliferation, migration and invasion. Methods The protein levels of LSD1 in surgically resected samples from NSCLC patients were detected by immunohistochemistry or Western blotting. The mRNA levels of LSD1 were detected by qRT-PCR. The correlation of LSD1 expression with clinical characteristics and prognosis was determined by statistical analysis. Cell proliferation rate was assessed by MTS assay and immunofluorescence. Cell migration and invasion were detected by scratch test, matrigel assay and transwell invasion assay. Results LSD1 expression was higher in lung cancer tissue more than in normal lung tissue. Our results showed that over-expression of LSD1 protein were associated with shorter overall survival of NSCLC patients. LSD1 was localized mainly to the cancer cell nucleus. Interruption of LSD1 using siRNA or a chemical inhibitor, pargyline, suppressed proliferation, migration and invasion of A549, H460 and 293T cells. Meanwhile, over-expression of LSD1 enhanced cell growth. Finally, LSD1 was shown to regulate epithelial-to-mesenchymal transition in lung cancer cells. Conclusions Over-expression of LSD1 was associated with poor prognosis in NSCLC, and promoted tumor cell proliferation, migration and invasion. These results suggest that LSD1 is a tumor-promoting factor with promising therapeutic potential for NSCLC.
0
Citation258
0
Save
8

Understanding the phase separation characteristics of nucleocapsid protein provides a new therapeutic opportunity against SARS-CoV-2

Dan Zhao et al.Oct 12, 2020
Abstract The ongoing coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic has raised an urgent need to develop effective therapeutics against the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). As a potential antiviral drug target, the nucleocapsid (N) protein of SARS-CoV-2 functions as a viral RNA chaperone and plays vital and multifunctional roles during the life cycle of coronavirus 1-3 . In this study, we discovered that the N protein of SARS-CoV-2 undergoes liquid-liquid phase separation (LLPS) both in vitro and in vivo , which is further modulated by viral RNA. In addition, we found that, the core component of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) of SARS-CoV-2, nsp12, preferentially partitions into the N protein condensates. Moreover, we revealed that, two small molecules, i.e., CVL218 and PJ34, can be used to intervene the N protein driven phase separation and loosen the compact structures of the condensates of the N-RNA-nsp12 complex of SARS-CoV-2. The discovery of the LLPS-mediated interplay between N protein and nsp12 and the corresponding modulating compounds illuminates a feasible way to improve the accessibility of antiviral drugs (e.g., remdesivir) to their targets (e.g., nsp12/RdRp), and thus may provide useful hints for further development of effective therapeutic strategies against SARS-CoV-2.
8
Citation5
0
Save
0

Single-cell transcriptomic analysis of immune cell dynamics in the healthy human endometrium

Kaixing Chen et al.Jan 1, 2023
The microenvironment of the endometrial immune system is crucial to the success of placental implantation and healthy pregnancy. However, the functionalities of immune cells across various stages of the reproductive cycle have yet to be fully comprehended. To address this, we conducted advanced bioinformatic analyses on 230,049 high-quality single-cell transcriptomes from healthy endometrial samples obtained during the proliferative, secretory, early pregnancy, and late pregnancy stages. Our investigation revealed that proliferative natural killer (NK) cells, a potential source of endometrial NK cells, exhibit the most robust proliferative and differentiation potential during non-pregnant stages. During early pregnancy, NK cells display high oxidative phosphorylation metabolism activity, and together with macrophages and T cells, exhibit a strong type II interferon response. Based on our cell-cell interaction analyses, we identify a large majority of interaction pairs to occur in late pregnancy. Finally, we explored the correlation between stage-specific alterations in transcriptomics and the risk genes of common reproductive diseases, unveiling that MHC class I/II molecules, along with TGFBR1, exhibited the potential to serve as biomarkers. Our study provides insights into the dynamics of the endometrial immune microenvironment during different reproductive cycle stages, thus serving as a reference for detecting pathological changes during pregnancy.
0

A data-driven drug repositioning framework discovered a potential therapeutic agent targeting COVID-19

Yiyue Ge et al.Mar 12, 2020
The global spread of SARS-CoV-2 requires an urgent need to find effective therapeutics for the treatment of COVID-19. We developed a data-driven drug repositioning framework, which applies both machine learning and statistical analysis approaches to systematically integrate and mine large-scale knowledge graph, literature and transcriptome data to discover the potential drug candidates against SARS-CoV-2. The retrospective study using the past SARS-CoV and MERS-CoV data demonstrated that our machine learning based method can successfully predict effective drug candidates against a specific coronavirus. Our in silico screening followed by wet-lab validation indicated that a poly-ADP-ribose polymerase 1 (PARP1) inhibitor, CVL218, currently in Phase I clinical trial, may be repurposed to treat COVID-19. Our in vitro assays revealed that CVL218 can exhibit effective inhibitory activity against SARS-CoV-2 replication without obvious cytopathic effect. In addition, we showed that CVL218 is able to suppress the CpG-induced IL-6 production in peripheral blood mononuclear cells, suggesting that it may also have anti-inflammatory effect that is highly relevant to the prevention immunopathology induced by SARS-CoV-2 infection. Further pharmacokinetic and toxicokinetic evaluation in rats and monkeys showed a high concentration of CVL218 in lung and observed no apparent signs of toxicity, indicating the appealing potential of this drug for the treatment of the pneumonia caused by SARS-CoV-2 infection. Moreover, molecular docking simulation suggested that CVL218 may bind to the N-terminal domain of nucleocapsid (N) protein of SARS-CoV-2, providing a possible model to explain its antiviral action. We also proposed several possible mechanisms to explain the antiviral activities of PARP1 inhibitors against SARS-CoV-2, based on the data present in this study and previous evidences reported in the literature. In summary, the PARP1 inhibitor CVL218 discovered by our data-driven drug repositioning framework can serve as a potential therapeutic agent for the treatment of COVID-19.
0

Utility of quantitative whole-body autoradiography (QWBA) and oxidative combustion (OC) analysis in the assessment of tissue distribution of [14C]Mefuparib (CVL218) in SD and LE rats

Xinmei Li et al.Dec 5, 2024
Background In tissue distribution studies of radiopharmaceuticals, quantitative whole-body autoradiography (QWBA) and oxidative combustion (OC) analysis are the two important methods that have not been compared using the same drug. Sprague-Dawley (SD) and Long-Evans (LE) rats, both of which are commonly used rodents in tissue distribution studies, have also not been compared using the same drug. Comparative studies are important for aiding the selection of appropriate experimental methods and animals. Methods To evaluate the tissue distribution of [ 14 C]Mefuparib (CVL218) in rats and assess its clinical safety, QWBA and OC analysis were used. The differences between the two methods were noted. Comparisons between the tissue distribution results of LE and SD rats were also done. Results The QWBA and OC distribution analysis showed that [ 14 C]CVL218-related radioactivity could be distributed in 19 tissues. For 89.47% of the tissues, no significant differences were noted between the two methods. There were also no differences in the pharmacokinetics data for plasma and brain homogenates between LE and SD rats. However, the pharmacokinetics data for liver and kidney homogenates were seven-fold higher in LE rats than in SD ones. Conclusions Both the OC and QWBA methods revealed that [ 14 C]CVL218 could be widely distributed in the tissues of rats. The OC had a lower limit of quantification while QWBA provided a more comprehensive analysis of [ 14 C]CVL218 distribution. More safety was associated with using LE rat data to estimate the dosimetry of [ 14 C]CVL218 for the whole-body, for human radiolabeled mass balance studies.