A large collection of new modENCODE and ENCODE genome-wide chromatin data sets from cell lines and developmental stages in worm, fly and human are analysed; this reveals many conserved features of chromatin organization among the three organisms, as well as notable differences in the composition and locations of repressive chromatin. This study describes numerous new genome-wide chromatin data sets from cell lines and developmental stages of Homo sapiens, Drosophila melanogaster and Caenorhabditis elegans generated by the ENCODE and modENCODE consortia. The results point to many conserved features of chromatin organization among the three organisms, while identifying differences in the composition and locations of repressive chromatin. Genome function is dynamically regulated in part by chromatin, which consists of the histones, non-histone proteins and RNA molecules that package DNA. Studies in Caenorhabditis elegans and Drosophila melanogaster have contributed substantially to our understanding of molecular mechanisms of genome function in humans, and have revealed conservation of chromatin components and mechanisms1,2,3. Nevertheless, the three organisms have markedly different genome sizes, chromosome architecture and gene organization. On human and fly chromosomes, for example, pericentric heterochromatin flanks single centromeres, whereas worm chromosomes have dispersed heterochromatin-like regions enriched in the distal chromosomal ‘arms’, and centromeres distributed along their lengths4,5. To systematically investigate chromatin organization and associated gene regulation across species, we generated and analysed a large collection of genome-wide chromatin data sets from cell lines and developmental stages in worm, fly and human. Here we present over 800 new data sets from our ENCODE and modENCODE consortia, bringing the total to over 1,400. Comparison of combinatorial patterns of histone modifications, nuclear lamina-associated domains, organization of large-scale topological domains, chromatin environment at promoters and enhancers, nucleosome positioning, and DNA replication patterns reveals many conserved features of chromatin organization among the three organisms. We also find notable differences in the composition and locations of repressive chromatin. These data sets and analyses provide a rich resource for comparative and species-specific investigations of chromatin composition, organization and function.

Real-world evidence (RWE) and randomized control trial (RCT) data are considered mutually complementary. However, compared with RCT, the outcomes of RWE continue to be assigned lower credibility. It must be emphasized that RWE research is a real-world practice that does not need to be executed as RCT research for it to be reliable. The advantages and disadvantages of RWE must be discerned clearly, and then the proper protocol can be planned from the beginning of the research to secure as many samples as possible. Attention must be paid to privacy protection. Moreover, bias can be reduced meaningfully by reducing the number of dropouts through detailed and meticulous data quality management. RCT research, characterized as having the highest reliability, and RWE research, which reflects the actual clinical aspects, can have a mutually supplementary relationship. Indeed, once this is proven, the two could comprise the most powerful evidence-based research method in medicine.

Introduction There is a lack of evidence to support the effectiveness of prolonged β-blocker therapy after stabilisation of patients with acute myocardial infarction (AMI) without heart failure (HF) or left ventricular systolic dysfunction. Methods and analysis The SMart Angioplasty Research Team: DEcision on Medical Therapy in Patients with Coronary Artery DIsease or Structural Heart Disease Undergoing InterventiON (SMART-DECISION) trial is a multicentre, prospective, open-label, randomised, non-inferiority trial designed to determine whether discontinuing β-blocker therapy after ≥1 year of maintenance in stabilised patients after AMI is non-inferior to continuing it. Patients eligible for participation are those without HF or left ventricular systolic dysfunction (ejection fraction >40%) who have been continuing β-blocker therapy for ≥1 year after AMI. A total of 2540 patients will be randomised 1:1 to continuation of β-blocker therapy or not. Randomisation will be stratified according to the type of AMI (ie, ST-segment-elevation MI or non-ST-segment-elevation MI), type of β-blocker (carvedilol, bisoprolol, nebivolol or other) and participating centre. The primary study endpoint is a composite of all-cause death, MI and hospitalisation for HF over a median follow-up period of 3.5 years (minimum, 2.5 years; maximum, 4.5 years). Adverse effects related to β-blocker therapy, the occurrence of atrial fibrillation, medical costs and Patient-reported Outcomes Measurement Information system-29 questionnaire responses will also be collected as secondary endpoints. Ethics and dissemination Ethics approval for this study was granted by the Institutional Review Board of Samsung Medical Center (no. 2020-10-176). Informed consent is obtained from every participant before randomisation. The results of this study will be submitted for publication in international peer-reviewed journals and the key findings will be presented at international scientific conferences. Trial registration number ClinicalTrials.gov, NCT04769362 .

Older adults are at a higher risk of severe adverse drug events (ADEs) because of multimorbidity, polypharmacy, and lower physiological function. This study aimed to determine whether polypharmacy, defined as the use of ≥ 5 active drug ingredients, was associated with severe ADEs in this population.

Background: Patients with multivessel coronary spasm showed relatively poor outcomes in vasospastic angina. Recent report also revealed that Ergovonine response definite group showed poor clinical outcomes compared to the Ergovonine response intermediate group. The purpose of this study is to evaluate the clinical impact of Ergovonine provocation definite or intermediate response in multivessel vasospastic angina patients. Methods: A total of 428 patients between May 2010 to November 2013, diagnosed as multivessel vasospastic angina who were registered in the Vasospastic Angina Korea (VA-KOREA) were enrolled. Patients were divided into Ergovonine provocation response definite group (n=111) and intermediate group (n=317). The primary endpoint was cumulative incidece of cardiac death, new onset arrhythmia, acute coronary syndrome, re-admission due to chest pain during 3 years follow-up. Results: In the baseline clinical chracteristics, Ergovonine response definite group had less proportion of male patients (32.4% vs. 49.8%, p=0.002). Other conventional cardiovascular risk factors were similar between two groups. In the angiographic characteristics, electrocardiogram changes during Ergovonine provocation was higher in the deinite group including ST change (18% vs 10.7%; p=0.046), ST elevation (16.2% vs 2.8%; p<0.001), ST depression (7.2% vs 2.5%; p=0.009), induced arrhythmia (27.9% vs 15.5%; p=0.004). Combined atherosclerotic lesion was also higher in the definite group (29.7% vs 15.5%; p=0.001). Prescrpition rate of Calcium channel blocker was lower in the intermediate group compared to the definite group (93.7% vs. 83.6%; p=0.008). The incidence of primary end point was not statistically signficant in both groups (10.8% vs. 14.5%; p=0.327). Multivariative cox regression analysis revealed that Ergovonine provocation response had no significant clinical impact in multivessel vasospastic angina patients (adjusted harzard ratio [HR] 0.64; 95% confidence interval [CI] 0.32 – 1.28; p=0.207). Conclusion: The present study indicates that Ergovonine provocation response is not an independent prognostic factor in multivessel vasospastic angina patients. Thus, intensive medical treatment and risk control should be carried out in both patient groups.

Securing adequate data privacy is critical for the productive utilization of data. De-identification, involving masking or replacing specific values in a dataset, could damage the dataset's utility. However, finding a reasonable balance between data privacy and utility is not straightforward. Nonetheless, few studies investigated how data de-identification efforts affect data analysis results. This study aimed to demonstrate the effect of different de-identification methods on a dataset's utility with a clinical analytic use case and assess the feasibility of finding a workable tradeoff between data privacy and utility.

Adverse drug reactions (ADRs) pose substantial public health issues, necessitating population-specific characterization due to variations in pharmacogenes. This study delineates the pharmacogenomic (PGx) landscape of the South Korean (SKR) population, focusing on 21 core pharmacogenes. Whole genome sequencing (WGS) was conducted on 396 individuals, including 99 healthy volunteers, 95 patients with chronic diseases, 81 with colon cancer, 81 with breast cancer, and 40 with gastric cancer, to identify genotype-specific drug dosing recommendations. Our detailed analysis, utilizing high-throughput genotyping (HTG) of CYP2D6 and comparative data from the 1,000 Genomes Project (1 KG) and the US National Marrow Donor Program (NMDP), revealed significant pharmacogenetic diversity in core pharmacogenes such as CYP2B6, CYP2C19, CYP4F2, NUDT15, and CYP2D6. Notably, intermediate metabolizer frequencies for CYP2B6 in SKR (3.28%) were comparable to Europeans (5.77%) and East Asians (5.36%) but significantly differed from other global populations (